[Dab(Ac)8]-polymyxin B3 | 1173923-65-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: [Dab(Ac)8]-polymyxin B3
• 英文别名: octanoyl-Dab-Thr-Dab-cyclo[Dab-Dab-D-PheLeu-Dab(Ac)-Dab-Thr]；octanoyl-Dab-Thr-Dab-Dab(1)-Dab-D-Phe-Leu-Dab(Ac)(Ac)-Dab-Thr-(1)；N-[(2S)-1-[[(2S,3R)-1-[[(2S)-1-[[(3S,6S,9S,12S,15R,18S,21S)-9-(2-acetamidoethyl)-6,18-bis(2-aminoethyl)-15-benzyl-3-[(1R)-1-hydroxyethyl]-12-(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20-heptaoxo-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-21-yl]amino]-4-amino-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-amino-1-oxobutan-2-yl]octanamide
• CAS: 1173923-65-3
• 化学式: C₅₇H₉₈N₁₆O₁₄
• 分子量: 1231.5
• InChiKey: CSSWZXNRGZYXIT-NOMRENGJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.5
• 重原子数：
  87
• 可旋转键数：
  30
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  494
• 氢给体数：
  18
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  octanoyl-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Thr(Bn)(Bn)-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Dab(1)-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-D-Phe-Leu-Dab(Ac)(Ac)-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Thr(Bn)(Bn)-(1) 在 氢氟酸 、 苯甲醚 作用下， 反应 1.0h， 生成 [Dab(Ac)8]-polymyxin B3
  参考文献：
  名称：

  Contribution of Each Amino Acid Residue in Polymyxin B3 to Antimicrobial and Lipopolysaccharide Binding Activity

  摘要：

  这项关于多粘菌素 B（一种环肽抗生素）结构-活性关系的研究使用了 16 种合成多粘菌素 B3 类似物，包括丙氨酸扫描类似物，以阐明侧链对抗菌活性和脂多糖 (LPS) 结合的贡献。在这些类似物中，[Ala5]-多粘菌素 B3 对大肠杆菌 (E. coli)、鼠伤寒沙门氏菌 (S. Typhimurium) 和铜绿假单胞菌 (P. aeruginosa) 的抗菌活性大大降低，MIC 值为 4-16 nmol/ml，这表明第 5 位的 Dab（α,γ-二氨基丁酸）残基是有助于杀菌活性的最重要的残基。 Dab 位于内酰胺环内（位置 5、8 和 9）时的抗菌贡献大于位于环外（位置 1 和 3）时的抗菌贡献。 [D-Ala6]-、[L-Phe6]-、[Ala7]- 和 [Gly7]-多粘菌素 B3 类似物保留了有效的抗菌活性，表明D-Phe6-Leu7 区域的疏水性和第 6 位 D-构型的减少对于抗菌活性是必不可少的。 LPS结合研究表明，内酰胺环疏水性降低影响不大，但1、3、5、8和9位Dab残基的Nγ-氨基功能极大地影响了LPS结合，其中Dab5的贡献最为显着。

  DOI：

  10.1248/cpb.57.240