严重急性呼吸系统综合症 (
SARS) 冠状病毒
SARS-CoV M(pro) 的 3C 样主要
蛋白酶被广泛认为是开发抗
SARS 治疗的主要药物靶点。基于先前筛选的先导化合物的
化学结构,我们设计并合成了许多非肽基
抑制剂,其中一些对
SARS-CoV M(pro) 的抑制活性显着提高,IC(50) 值约 60 nM。在没有与这些合成
抑制剂复合的
SARS-CoV M(pro) 晶体结构的情况下,分子对接工具已被用于研究这些
抑制剂与
SARS-CoV M(pro) 之间可能的相互作用。对接结果表明这些
抑制剂与
SARS-CoV M(pro) 活性位点的初始结合有两种主要模式。他们还通过表明所有现有
抑制剂共有的 3-
氯吡啶功能倾向于聚集在 S1 特异性口袋中,从而为这些
抑制剂的“核心设计”建立了结构基础。此外,S4 口袋内在的灵活性允许容纳苯环等庞大的基团,这表明可以进一步利用这种结构可塑性来