2'-C-β-difluoromethyluridine 3',5'-bisphosphate | 867287-81-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 2'-C-β-difluoromethyluridine 3',5'-bisphosphate
• 英文别名: 3',5'-diphosphono-2'-C-β-difluoromethyluridine；[(2R,3R,4R,5R)-4-(difluoromethyl)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] dihydrogen phosphate
• CAS: 867287-81-8
• 化学式: C₁₀H₁₄F₂N₂O₁₂P₂
• 分子量: 454.172
• InChiKey: OTVAHBDSSBKQFM-HXWNMLOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.4
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  212
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-tri-O-benzoyl-2'-C-β-difluoromethyluridine 在 甲醇 、 氨 、 三氯氧磷 作用下， 反应 52.0h， 生成 2'-C-β-difluoromethyluridine 3',5'-bisphosphate
  参考文献：
  名称：

  2'- C-二氟甲基核糖核苷的合成及其酶掺入寡核苷酸中

  摘要：

  具有支链核糖的核苷作为治疗剂以及生物技术和生化工具具有重要的前景。在这里，我们描述了合成进入这些类似物的新亚类2'- C -β-二氟甲基核糖核苷的方法。我们从1,3,5- tri - O-苯甲酰基-α - d-核呋喃糖1分三步构建了糖基化剂4。关键步骤包括将亲二氟甲基苯基砜亲核加成到2-ketoribose 2中，然后进行温和而有效的还原性脱磺化反应。呋喃核糖4直接糖基化双（三甲基甲硅烷基）尿嘧啶，脱保护后可有效地得到二氟甲基尿苷7。转换相应的呋喃核糖基溴的图4所示的化合物允许有效地获得C，A和G类似物。从甲基d-核呋喃糖开始的一种相关方法提供了合成进入非对映异构体歧管中的2' - C -α-二氟甲基-阿拉伯糖基-α-嘧啶。为了将2′ - C -β-二氟甲基尿苷掺入寡脱氧核苷酸中，我们将7转化为二磷酸，并使用T 4 RNA连接酶和T 4 DNA连接酶进行连续的连接反应。类似于天然RNA键合

  DOI：

  10.1021/jo0507542

文献信息

• The Mechanism of RNA Strand Scission: An Experimental Measure of the Brønsted Coefficient,βnuc
  作者：Jing-Dong Ye、Nan-Sheng Li、Qing Dai、Joseph A. Piccirilli

  DOI：10.1002/anie.200605124

  日期：2007.5.11
• Synthesis of 2‘-<i>C</i>-Difluoromethylribonucleosides and Their Enzymatic Incorporation into Oligonucleotides
  作者：Jing-Dong Ye、Xiangmin Liao、Joseph A. Piccirilli

  DOI：10.1021/jo0507542

  日期：2005.9.1

  analogues, 2‘-C-β-difluoromethylribonucleosides. We constructed the glycosylating agent 4 in three steps from 1,3,5-tri-O-benzoyl-α-d-ribofuranose 1. The key steps included nucleophilic addition of difluoromethyl phenyl sulfone to 2-ketoribose 2 followed by mild and efficient reductive desulfonation. Ribofuranose 4 glycosylated bis(trimethylsilyl)uracil directly, giving difluoromethyluridine 7 efficiently

  具有支链核糖的核苷作为治疗剂以及生物技术和生化工具具有重要的前景。在这里，我们描述了合成进入这些类似物的新亚类2'- C -β-二氟甲基核糖核苷的方法。我们从1,3,5- tri - O-苯甲酰基-α - d-核呋喃糖1分三步构建了糖基化剂4。关键步骤包括将亲二氟甲基苯基砜亲核加成到2-ketoribose 2中，然后进行温和而有效的还原性脱磺化反应。呋喃核糖4直接糖基化双（三甲基甲硅烷基）尿嘧啶，脱保护后可有效地得到二氟甲基尿苷7。转换相应的呋喃核糖基溴的图4所示的化合物允许有效地获得C，A和G类似物。从甲基d-核呋喃糖开始的一种相关方法提供了合成进入非对映异构体歧管中的2' - C -α-二氟甲基-阿拉伯糖基-α-嘧啶。为了将2′ - C -β-二氟甲基尿苷掺入寡脱氧核苷酸中，我们将7转化为二磷酸，并使用T 4 RNA连接酶和T 4 DNA连接酶进行连续的连接反应。类似于天然RNA键合