5-(3-aminopropyl)oxymethyl-2'-deoxycytidine | 807369-75-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(3-aminopropyl)oxymethyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 4-amino-5-(3-aminopropoxymethyl)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 807369-75-1
• 化学式: C₁₃H₂₂N₄O₅
• 分子量: 314.341
• InChiKey: UGRZIWPZACKTJV-HBNTYKKESA-N

物化性质

• 沸点：
  573.7±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(3-aminopropyl)oxymethyl-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 N4-benzoyl-5-{3-[N,N-bis(2-methoxyoxalylaminoethyl)aminoethyl]aminooxalylaminopropyl}oxymethyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  [用于带有带有反应性残基的接头的寡核苷酸合成的单体：I。在杂环碱基中具有甲氧基草酰胺基的脱氧核苷衍生物的合成]。

  摘要：

  制备了用于标准亚磷酰胺寡脱氧核苷酸合成的许多单体，这些单体带有连接到胸苷，2'-脱氧胞苷和2'-脱氧腺苷杂环碱基上的反应性甲氧基草酰胺基。该论文的英文版：Russian Journal of Bioorganic Chemistry，2004年，第1卷。30号 3; 另请参见http://www.maik.ru。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030129.13466.18
• 作为产物：
  描述：

  在 氨 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙腈 为溶剂， 反应 17.5h， 生成 5-(3-aminopropyl)oxymethyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  [用于带有带有反应性残基的接头的寡核苷酸合成的单体：I。在杂环碱基中具有甲氧基草酰胺基的脱氧核苷衍生物的合成]。

  摘要：

  制备了用于标准亚磷酰胺寡脱氧核苷酸合成的许多单体，这些单体带有连接到胸苷，2'-脱氧胞苷和2'-脱氧腺苷杂环碱基上的反应性甲氧基草酰胺基。该论文的英文版：Russian Journal of Bioorganic Chemistry，2004年，第1卷。30号 3; 另请参见http://www.maik.ru。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030129.13466.18