Isopentenyl Diphosphate Isomerase. Mechanism-Based Inhibition by Diene Analogues of Isopentenyl Diphosphate and Dimethylallyl Diphosphate
作者:Zheng Wu、Johan Wouters、C. Dale Poulter
DOI:10.1021/ja056187h
日期:2005.12.1
Isopentenyl diphosphate isomerase (IDI) catalyzes the interconversion of isopentenyl diphosphate (IPP) and dimethylallyl diphosphate (DMAPP). This is an essential step in the mevalonate entry into the isoprenoid biosynthetic pathway. The isomerization catalyzed by type I IDI involves protonation of the carbon-carbon double bond in IPP or DMAPP to form a tertiary carbocation, followed by deprotonation
异戊烯二磷酸异构酶 (IDI) 催化异戊烯二磷酸 (IPP) 和二甲基烯丙基二磷酸 (DMAPP) 的相互转化。这是甲羟戊酸进入类异戊二烯生物合成途径的必要步骤。I 型 IDI 催化的异构化涉及 IPP 或 DMAPP 中碳-碳双键的质子化以形成叔碳正离子,然后去质子化。合成了 DMAPP(E-2-OPP 和 Z-2-OPP)和 IPP(4-OPP)的二烯类似物,发现它们是该酶的有效活性部位定向不可逆抑制剂。大肠杆菌 IDI 和 4-OPP 之间的 EI 复合物的 X 射线分析表明,存在两种异构体,它们在抑制剂的烃链中新形成的 C3-C4 双键的立体化学上存在差异。在两种加合物中,抑制剂的 C5 都与 C67 的硫相连。在这些结构中,4-OPP 中二烯部分质子化时形成的甲基位于 E116 附近,表明该残基参与了质子化步骤。