2,4-dinitrophenyl methyl phosphate | 122949-58-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2,4-dinitrophenyl methyl phosphate
• 英文别名: 2,4-Dinitrophenyl-methyl-phosphat
• CAS: 122949-58-0
• 化学式: C₇H₆N₂O₈P
• 分子量: 277.107
• InChiKey: HIZTVKBEFKVUIM-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.0
• 重原子数：
  18.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.14
• 拓扑面积：
  144.87
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,4-dinitrophenyl methyl phosphate 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 2,4-二硝基酚
  参考文献：
  名称：

  磷酸二酯水解中的分子内通用碱催化。机构选择的计算指导

  摘要：

  尽管它在25°C下的半衰期为70年，但磷酸二-2-吡啶基磷酸酯（DPP）的自发水解速度却快了数千倍（在100°C时约3000倍，在25°C时超过10000倍） C）较预期的二酯键的离去基团p K为9.09。动力学参数不允许在所考虑的五种可能机理之间做出决定性的选择，但是动力学和计算证据的组合支持单步一致的S N图2（P）的机理涉及溶剂水攻击磷，而分子内的催化作用是通过（弱碱性）吡啶氮作为一般碱而辅助的。对于这种机理，催化是相对有效的，一般碱的估计有效摩尔浓度（EM）> 15 M，这与典型缓冲液不存在催化作用相一致。进一步的新结果证实，改变nonleaving组具有自发二酯水解速率的影响最小，在鲜明的对比对三酯的相应反应的主要效果：虽然DPP的一个氮的质子化-通过6个数量增加水解的速率数量级，符合预期。

  DOI：

  10.1021/jo302498g

文献信息

• Reactions of phosphate and phosphorothiolate diesters with nucleophiles: comparison of transition state structures
  作者：Jing-Dong Ye、Christofer D. Barth、Potluri S. R. Anjaneyulu、Thomas Tuschl、Joseph A. Piccirilli

  DOI：10.1039/b707205h

  日期：——

  synthesized and their reactions with pyridine derivatives were compared to those for methyl aryl phosphate esters (OP). Results show that SP esters react with pyridine nucleophiles via a concerted S(N)2(P) mechanism. Bronsted analysis suggests that reactions of both SP and OP esters proceed via transition states with dissociative character. The overall similarity of the transition state structures supports the

  合成了一系列甲基芳基硫代磷酸酯（SP），并将它们与吡啶衍生物的反应与甲基芳基磷酸酯（OP）的反应进行了比较。结果表明，SP酯通过协同的S（N）2（P）机制与吡啶亲核试剂反应。布朗斯台德的分析表明，SP和OP酯的反应都是通过具有解离特性的过渡态进行的。过渡态结构的总体相似性支持使用硫代磷酸酯作为底物类似物来探测酶催化的磷酰基转移反应的机理。
• Structure and Mechanism of PhnP, a Phosphodiesterase of the Carbon-Phosphorus Lyase Pathway
  作者：Shu-Mei He、Matthew Wathier、Kateryna Podzelinska、Matthew Wong、Fern R. McSorley、Alemayehu Asfaw、Bjarne Hove-Jensen、Zongchao Jia、David L. Zechel

  DOI：10.1021/bi2005398

  日期：2011.10.11

  PhnP is a phosphodiesterase that plays an important role within the bacterial carbon-phosphorus lyase (CP-lyase) pathway by recycling a “dead-end” intermediate, 5-phospho-α-d-ribosyl 1,2-cyclic phosphate, that is formed during organophosphonate catabolism. As a member of the metallo-β-lactamase superfamily, PhnP is most homologous in sequence and structure to tRNase Z phosphodiesterases. X-ray structural

  PhnP是一种磷酸二酯酶，通过回收“末端”中间体5-磷酸-α- d在细菌碳-磷裂解酶（CP-裂解酶）途径中发挥重要作用。-核糖基1,2-环磷酸酯，在有机膦酸酯分解代谢过程中形成。作为金属-β-内酰胺酶超家族的成员，PnP在序列和结构上与tRNase Z磷酸二酯酶最同源。用PhnP与原钒酸酯络合至1.5Å分辨率的X射线结构分析表明，该抑制剂在四面体几何结构中被两个催化锰离子和推定的一般酸残基H200结合。在这种结构的指导下，我们通过定点诱变，动力学分析和ICP-MS探索了第一和第二球活性位点残基对催化和金属离子结合的贡献。H200变为丙氨酸导致k cat / K M降低6–33倍带有取代的甲基苯基磷酸二酯，离去基团p K a的值在4至8.4之间。以双（对硝基苯基）磷酸酯为底物，k cat / K M降低了10倍，这主要是由于K M大大增加的结果。此外，镍离子活化的H200A PhnP对k cat