3'-amino-3'-N-(2-methoxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)-3'-deoxythymidine | 876131-60-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-amino-3'-N-(2-methoxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)-3'-deoxythymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5S)-5-(hydroxymethyl)-4-[(2-methoxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)amino]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 876131-60-1
• 化学式: C₁₅H₁₇N₃O₇
• 分子量: 351.316
• InChiKey: KIGNQYPAAOHKSH-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-amino-3'-N-(2-methoxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)-3'-deoxythymidine 在 sodium hydroxide 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 14.0h， 以75%的产率得到3'-amino-3'-N-(2-hydroxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)-3'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  具有方酸酰胺部分的新核苷酸类似物的合成和性质作为新的磷酸盐等排体

  摘要：

  合成了结合独特方酸酰胺结构的 2'-脱氧核苷酸和核糖核苷酸的新类似物。由于该部分的强酸性（pKa = 2.3），这些核苷酸类似物以单阴离子形式存在，在生理条件下可以被视为5'-核苷酸的电子等排体。核苷酸类似物的合成是通过 5'-或 3'-氨基核苷与方酸二甲酯的缩合来实现的，而甲基的选择性去除则是通过用溴化钠处理来有效实现的。此外，我们还从 3',5'-二叠氮核苷衍生物合成了 3',5'-环核苷酸类似物。核磁共振分析表明，它们的核糖起皱是一种 N 型形式，与 cAMP 和 cGMP 中的相同。由于独特的结构、电子、和方酸酰胺型核苷酸类似物的构象特性，这些类似物作为潜在的生物活性化合物，如抗病毒和抗癌剂，应该是非常有趣的。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2005)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200500520
• 作为产物：
  描述：

  3,4-二甲氧基-3-环丁烯-1,2-二酮 在 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 3'-amino-3'-N-(2-methoxy-3,4-dioxocyclobuten-1-yl)-3'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  具有方酸酰胺部分的新核苷酸类似物的合成和性质作为新的磷酸盐等排体

  摘要：

  合成了结合独特方酸酰胺结构的 2'-脱氧核苷酸和核糖核苷酸的新类似物。由于该部分的强酸性（pKa = 2.3），这些核苷酸类似物以单阴离子形式存在，在生理条件下可以被视为5'-核苷酸的电子等排体。核苷酸类似物的合成是通过 5'-或 3'-氨基核苷与方酸二甲酯的缩合来实现的，而甲基的选择性去除则是通过用溴化钠处理来有效实现的。此外，我们还从 3',5'-二叠氮核苷衍生物合成了 3',5'-环核苷酸类似物。核磁共振分析表明，它们的核糖起皱是一种 N 型形式，与 cAMP 和 cGMP 中的相同。由于独特的结构、电子、和方酸酰胺型核苷酸类似物的构象特性，这些类似物作为潜在的生物活性化合物，如抗病毒和抗癌剂，应该是非常有趣的。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2005)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200500520

文献信息

• Synthesis and Properties of New Nucleotide Analogues Possessing Squaramide Moieties as New Phosphate Isosters
  作者：Kohji Seio、Takuhei Miyashita、Kousuke Sato、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1002/ejoc.200500520

  日期：2005.12

  condensation of 5′- or 3′-aminonucleosides with dimethyl squarate, whilst the selective removal of the methyl group was effectively accomplished by treatment with sodium bromide. In addition, we also synthesized 3′,5′-cyclic nucleotide analogues from the 3′,5′-diazidonucleoside derivatives. NMR analysis revealed that their ribose puckering was of an N-type form, identical to that in cAMP and cGMP. Because

  合成了结合独特方酸酰胺结构的 2'-脱氧核苷酸和核糖核苷酸的新类似物。由于该部分的强酸性（pKa = 2.3），这些核苷酸类似物以单阴离子形式存在，在生理条件下可以被视为5'-核苷酸的电子等排体。核苷酸类似物的合成是通过 5'-或 3'-氨基核苷与方酸二甲酯的缩合来实现的，而甲基的选择性去除则是通过用溴化钠处理来有效实现的。此外，我们还从 3',5'-二叠氮核苷衍生物合成了 3',5'-环核苷酸类似物。核磁共振分析表明，它们的核糖起皱是一种 N 型形式，与 cAMP 和 cGMP 中的相同。由于独特的结构、电子、和方酸酰胺型核苷酸类似物的构象特性，这些类似物作为潜在的生物活性化合物，如抗病毒和抗癌剂，应该是非常有趣的。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2005)