(2R)-3-{1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-4-yl}-2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)propanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (2R)-3-{1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-4-yl}-2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)propanoic acid
• 英文别名: (2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]piperidin-4-yl]propanoic acid
• 化学式: C₂₈H₃₄N₂O₆
• 分子量: 494.588
• InChiKey: JVDSTYGNXVJVKL-XMMPIXPASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R)-3-{1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-4-yl}-2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)propanoic acid 在 哌啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 (R)-5-(4-chlorophenyl)-N-(3-(1-(2-(4-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl)acetyl)piperidin-4-yl)-1-(methylamino)-1-oxopropan-2-yl)picolinamide
  参考文献：
  名称：

  使用 DNA 编码的化学文库选择发现有效的 BET 溴结构域 1 立体选择性抑制剂。

  摘要：

  BRDT、BRD2、BRD3 和 BRD4 包含溴结构域和末端外 (BET) 亚家族，其中包含两个相似的串联溴结构域（BD1 和 BD2）。选择性 BD1 抑制在癌症模型中以及正如我们和其他人所报道的 BRDT 在睾丸中的串联 BET BD 抑制的表型效应。为了寻找新的 BET BD1 结合剂，我们从我们的 DNA 编码化学文库中筛选出超过 45 亿个分子，同时使用 BRDT-BD1 或 BRDT-BD2 蛋白。仅由 BRDT-BD1 富集的化合物系列在 DNA 外重新合成，揭示了一种有效的手性化合物 CDD-724，其抑制 BRDT-BD1 的选择性比 BRDT-BD2 高 2,000 倍以上。CDD-724 立体异构体在抑制 BRDT-BD1 方面表现出显着差异，R-对映异构体 (CDD-787) 的效力是 S-对映异构体 (CDD-786) 的 50 倍。通过结构-活性关系研究，我们生产了

  DOI：

  10.1073/pnas.2122506119

文献信息

• Discovery of potent BET bromodomain 1 stereoselective inhibitors using DNA-encoded chemical library selections
  作者：Ram K. Modukuri、Zhifeng Yu、Zhi Tan、Hai Minh Ta、Melek Nihan Ucisik、Zhuang Jin、Justin L. Anglin、Kiran L. Sharma、Pranavanand Nyshadham、Feng Li、Kevin Riehle、John C. Faver、Kevin Duong、Sureshbabu Nagarajan、Nicholas Simmons、Stephen S. Palmer、Mingxing Teng、Damian W. Young、Joanna S. Yi、Choel Kim、Martin M. Matzuk

  DOI：10.1073/pnas.2122506119

  日期：2022.5.31

  screened >4.5 billion molecules from our DNA-encoded chemical libraries with BRDT-BD1 or BRDT-BD2 proteins in parallel. A compound series enriched only by BRDT-BD1 was resynthesized off-DNA, uncovering a potent chiral compound, CDD-724, with >2,000-fold selectivity for inhibiting BRDT-BD1 over BRDT-BD2. CDD-724 stereoisomers exhibited remarkable differences in inhibiting BRDT-BD1, with the R-enantiomer

  BRDT、BRD2、BRD3 和 BRD4 包含溴结构域和末端外 (BET) 亚家族，其中包含两个相似的串联溴结构域（BD1 和 BD2）。选择性 BD1 抑制在癌症模型中以及正如我们和其他人所报道的 BRDT 在睾丸中的串联 BET BD 抑制的表型效应。为了寻找新的 BET BD1 结合剂，我们从我们的 DNA 编码化学文库中筛选出超过 45 亿个分子，同时使用 BRDT-BD1 或 BRDT-BD2 蛋白。仅由 BRDT-BD1 富集的化合物系列在 DNA 外重新合成，揭示了一种有效的手性化合物 CDD-724，其抑制 BRDT-BD1 的选择性比 BRDT-BD2 高 2,000 倍以上。CDD-724 立体异构体在抑制 BRDT-BD1 方面表现出显着差异，R-对映异构体 (CDD-787) 的效力是 S-对映异构体 (CDD-786) 的 50 倍。通过结构-活性关系研究，我们生产了