半胱
氨酸的
化学蛋白质组学分析已成为筛选半胱
氨酸反应性片段、药物和
天然产物的蛋白质组范围目标的有力方法。在此,我们报告了作为半胱
氨酸选择性
化学蛋白质组学探针的四氟烷基苯并氧唑 (TFBX) 的开发和深入评估。我们表明,与传统使用的半胱
氨酸反应性探针相比,该探针具有许多关键改进,包括出色的目标占有率、更快的标记动力学和更广泛的蛋白质组学覆盖,从而能够直接在活细胞中分析半胱
氨酸。此外,探针7的
氟“签名”构成了一个额外的优势,导致在基于质谱的鉴定工作流程中更可靠的加合物 -
氨基酸位点分配。我们通过识别 (−)-myrocin G 的细胞靶标来证明我们的新探针在蛋白质组范围内的靶标分析中的实用性,这是一种具有迄今为止未知作用机制的抗增殖真菌
天然产物。我们表明,这种
天然产物和简化的类似物靶向 X 射线修复交叉互补蛋白5(XRCC5),一种
ATP 依赖性 DNA 解旋酶,在 DNA 双链断裂时启动 DNA