4-azidobenzyl (4-nitrophenyl) carbonate | 161536-59-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-azidobenzyl (4-nitrophenyl) carbonate
• 英文别名: (4-azidophenyl)methyl (4-nitrophenyl) carbonate
• CAS: 161536-59-0
• 化学式: C₁₄H₁₀N₄O₅
• 分子量: 314.257
• InChiKey: YWNRQIIAFXIOSH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  95.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-azidobenzyl (4-nitrophenyl) carbonate 在 四(三苯基膦)钯 吗啉 、 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 4-甲基苯磺酸吡啶 、 potassium carbonate 、 达卡巴嗪 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 115.75h， 生成 3'N-(4-azidobenzyloxycarbonyl)-3'-N-debenzoylpaclitaxel
  参考文献：
  名称：

  设计用于低氧肿瘤组织中生物还原活化的新型紫杉醇前药的合成。

  摘要：

  描述了第一种潜在的生物还原性紫杉醇前药的合成和初步评估。通过针对缺氧肿瘤组织，这些前药被设计为更选择性化疗的潜在候选药物。芳香硝基和叠氮化物基团被用作生物还原触发物。紫杉醇的生成发生在还原和随后的1,6-消除或1,8-消除之后。所有前药在缓冲液中都是稳定的，并且在化学还原芳香族硝基或叠氮化物官能度后，的确会产生紫杉醇。在有氧细胞毒性测定中，几种前药表现出减弱的细胞毒性。这些化合物是用于进一步生物学评估的有趣候选物。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(01)00235-8
• 作为产物：
  描述：

  对氨基苯甲醇 在 吡啶 、 盐酸 、 sodium nitrite 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 4-azidobenzyl (4-nitrophenyl) carbonate
  参考文献：
  名称：

  The rational design of a peptide-based hydrogel responsive to H₂S

  摘要：

  通过在超短水凝肽中引入偶氮苄基团，我们报道了一种新型水凝胶的设计，该水凝胶可以在生理条件下被H₂S选择性降解。

  DOI：

  10.1039/c5cc06889d

文献信息

• Structural Basis for Genetic-Code Expansion with Bulky Lysine Derivatives by an Engineered Pyrrolysyl-tRNA Synthetase
  作者：Tatsuo Yanagisawa、Mitsuo Kuratani、Eiko Seki、Nobumasa Hino、Kensaku Sakamoto、Shigeyuki Yokoyama

  DOI：10.1016/j.chembiol.2019.03.008

  日期：2019.7

  non-natural lysine derivatives by UAG. In this study, we examined how PylRS(Y306A/Y384F) recognizes many amino acids. Among 17 non-natural lysine derivatives, Nɛ-(benzyloxycarbonyl)lysine (ZLys) and 10 ortho/meta/para-substituted ZLys derivatives were efficiently ligated to tRNAPyl and were incorporated into proteins by PylRS(Y306A/Y384F). We determined crystal structures of 14 non-natural lysine derivatives

  Pyrrolysyl-tRNA合成酶（PylRS）和tRNAPyl已被广泛用于遗传密码扩展。带有Y306A和Y384F突变的马氏甲烷八叠球菌PylRS突变体（PylRS（Y306A / Y384F））通过UAG编码各种庞大的非天然赖氨酸衍生物。在这项研究中，我们检查了PylRS（Y306A / Y384F）如何识别许多氨基酸。在17种非天然赖氨酸衍生物中，N +-（苄氧羰基）赖氨酸（ZLys）和10种邻/间/对位/对位取代的ZLys衍生物被有效地连接到tRNAPyl上，并通过PylRS（Y306A / Y384F）掺入蛋白质中。我们确定了绑定到PylRS（Y306A / Y384F）催化片段的14种非天然赖氨酸衍生物的晶体结构。将间位和对位取代的ZLys衍生物紧密地容纳在生产模式中。相比之下，ZLys和未取代或邻位取代的ZLys衍生物除生产模式外还表现出其他结合模式。PylRS（Y306A
• METHOD FOR SYNTHESIZING PEPTIDES IN CELL-FREE TRANSLATION SYSTEM
  申请人：Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha

  公开号：US20200040372A1

  公开（公告）日：2020-02-06

  An objective of the present invention is to provide methods of synthesizing peptides containing structurally diverse amino acids using cell-free translation systems, which can accomplish excellent translational efficiency as compared to conventional techniques (the conventional techniques being methods which involve preparing aminoacyl-tRNAs which do not have protecting groups outside the translation systems without using ARS, and then adding the prepared aminoacyl-tRNAs into translation systems). In the present invention, it was found that amino acid-containing peptides can be synthesized efficiently by protecting an amino acid linked to tRNA with an appropriate protecting group, and then performing the step of deprotecting the protecting group of the amino acid linked to tRNA and the step of peptide translation from a template nucleic acid in a cell-free translation system in parallel.

  本发明的一个目标是提供使用无细胞翻译系统合成含有结构多样的氨基酸的肽的方法，这些方法可以实现与传统技术相比出色的翻译效率（传统技术是指涉及在翻译系统外部准备没有保护基的氨酰-tRNA而不使用ARS的方法，然后将准备好的氨酰-tRNA添加到翻译系统中）。在本发明中，发现通过用适当的保护基保护与tRNA连接的氨基酸，然后并行进行去保护氨基酸与tRNA连接的保护基的步骤和从模板核酸进行肽翻译的步骤，可以高效地合成含有氨基酸的肽。
• Protecting-group strategies for the synthesis of N  4-substituted and N  1,N  8-disubstituted spermidines, exemplified by hirudonine
  作者：Bernard T. Golding、Andrew Mitchinson、William Clegg、Mark R. J. Elsegood、Roger J. Griffin

  DOI：10.1039/a806355i

  日期：——

  Methods are described for the preparation of derivatives of the polyamines 1,4-diaminobutane (putrescine) and N-(3-aminopropyl)-1,4-diaminobutane (spermidine) in which a particular amino group is modified with, e.g., a guanidino function. Specific amino groups in these polyamines were protected as N-trifluoroacetyl and N-4-azidobenzyloxycarbonyl derivatives, which were unmasked chemoselectively using methanolic ammonia and dithiothreitol–triethylamine, respectively. Guanidino functions were introduced by an improved procedure in which an amino group was treated with 3,5-dimethyl-N-nitro-1H-pyrazole-1-carboximidamide in methanol to give a nitroguanidine derivative, from which the nitro group was removed by catalytic transfer hydrogenation. The methodology is exemplified by the development of efficient preparative routes to agmatine and hirudonine. The integrity of the sequence of protection/deprotection leading to hirudonine was confirmed by a crystal-structure analysis of its sulfate. The effect of selected compounds on the uptake of putrescine into rat lung cells was determined and showed that N 4-(4-azidobenzyloxycarbonyl)spermidine was the best inhibitor (Ki = 3.4 µM).

  本文描述了制备多胺衍生物1,4-二氨基丁烷（腐胺）和N-（3-氨基丙基）-1,4-二氨基丁烷（精胺）的方法，其中特定的氨基被修饰为胍基等官能团。在这些多胺中，特定的氨基被保护成N-三氟乙酰基和N-4-叠氮苄氧羰基衍生物，并分别使用甲醇氨和二硫苏糖醇-三乙胺选择性地脱去保护。通过改进的方法引入胍基官能团，其中氨基与3,5-二甲基-N-硝基-1H-吡唑-1-羧酰亚胺在甲醇中反应生成硝基胍衍生物，然后通过催化转移氢化除去硝基。该方法以开发高效的制备路线至胍氨酸和蛭素为例。保护/去保护序列的完整性通过其硫酸盐的晶体结构分析得到了证实。评估了选定化合物对大鼠肺细胞摄取腐胺的影响，并显示N-4-（4-叠氮苄氧羰基）精胺是最好的抑制剂（Ki = 3.4 µM）。
• Mechanistic Evaluation of Bioorthogonal Decaging with <i>trans</i>-Cyclooctene: The Effect of Fluorine Substituents on Aryl Azide Reactivity and Decaging from the 1,2,3-Triazoline
  作者：Siddharth S. Matikonda、Jessica M. Fairhall、Franziska Fiedler、Suchaya Sanhajariya、Robert A. J. Tucker、Sarah Hook、Anna L. Garden、Allan B. Gamble

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.7b00665

  日期：2018.2.21

  subsequent release from the 1,2,3-triazoline are reported. As the number of fluorine substituents on the PABC linker increases from one to four, the rate of cycloaddition increases by almost one order of magnitude. Using a combination of fluorescence, 1H/19F NMR, and computational experiments, we have been able to determine how substituents on the PABC ring can influence the degradation rates and also the product

  生物正交前药的激活/减少策略必须是选择性的，快速的，并在激活后将其从掩蔽组中释放出来。反式-环辛烯（TCO）与一系列氟取代的叠氮基-PABC自消化间隔基在两种模型药物之间发生的1,3-偶极环加成速率以及随后从1,2,3-三唑啉的释放是报告。随着PABC接头上氟取代基的数量从一增加到四，环加成速率增加了几乎一个数量级。使用荧光的组合，1 H / 19通过NMR和计算实验，我们已经能够确定PABC环上的取代基如何影响降解速率以及1,2,3-三唑啉的产物分布。我们还能够确定这些取代基如何影响亚胺水解的速率以及生成的苯胺的1，6-自消灭的降解速率。NMR和计算研究表明，芳环上的氟取代基降低了通过双原子氮的挤出将三唑啉转化为亚胺或氮丙啶中间体所需的过渡态能量，而在四氟取代的芳环的情况下，则是亚胺水解和1，6-自焚是限速的。这些知识进一步增强了对影响三唑啉稳定性的因素的理解，
• Discrimination of spermidine amino functions by a new protecting group strategy; application to the synthesis of guanidinylated polyamines, including hirudonine
  作者：Andrew Mitchinson、Bernard T. Golding、Roger J. Griffin、Mary C. O'Sullivan

  DOI：10.1039/c39940002613

  日期：——

  Agmatine and hirudonine, guanidine derivatives of putrescine and spermidine, respectively, are synthesised by the application of a new protecting group strategy for polyamines, which uses N-nitroguanidinyl as a precursor of guanidine functions and selectively blocks spermidine at N-1 and N-8 with trifluoroacetyl and at N-4 by 4-azidobenzyloxycarbonyl.

  从尸胺和亚精胺分别合成的阿基美汀和水蛭素是通过采用一种新的聚胺保护基团策略实现的，该策略使用N-硝基氨基脲作为氨基功能的前体，并选择性地在N-1和N-8位用三氟乙酰基保护亚精胺，而在N-4位用4-叠氮苯甲氧羰基进行保护。