1-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-hexopyranosyl)cytosine | 136020-18-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-hexopyranosyl)cytosine
• 英文别名: 1-(2,3-dideoxy-erythro-β-D-hexopyranosyl)cytosine；1-(2',3'-Dideoxy-β-D-glucopyranosyl)cytosin；2(1H)-Pyrimidinone, 4-amino-1-(2,3-dideoxy-b-D-erythro-hexopyranosyl)-；4-amino-1-[(2R,5S,6R)-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 136020-18-3
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₄
• 分子量: 241.247
• InChiKey: GOUMWHNAXBKGRV-LKEWCRSYSA-N

物化性质

• 沸点：
  491.8±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.63±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

制备方法与用途

(2,3-脱氧-β-D-红-外-吡喃糖基)胞嘧啶是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其靶向惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡等途径实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-hexopyranosyl)cytosine 在 吡啶 作用下， 反应 18.0h， 生成 N-(1-((2R,5S,6R)-6-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-hydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl)-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOSITIONS FOR EDITING MECP2 TRANSCRIPTS AND METHODS THEREOF
  [FR] COMPOSITIONS POUR L'ÉDITION DE TRANSCRITS MECP2 ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS

  摘要：

  Among other things, the present disclosure provides oligonucleotides, compositions and methods thereof that can bring about specific editing of a target adenosine in a target RNA molecule. Such oligonucleotides, compositions and methods are useful to treat, prevent, or ameliorate MECP2 associated disorders, diseases and syndromes that can benefit from adenosine modification.

  公开号：

  WO2023049477A2
• 作为产物：
  描述：

  N⁴-Benzoyl-1-(2',3'-dideoxy-β-D-glucopyranosyl)cytosin 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 30.0h， 以87%的产率得到1-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-hexopyranosyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  Warum Pentose- and nichtHexose-Nucleinsäuren??。泰尔二世。寡核苷酸aus 2'，3'-Dideoxy-β-D-glucopyranosyl-Bausteinen（'Homo-DNS'）：Herstellung。†

  摘要：

  为什么是戊糖而不是己糖核酸？第二部分。包含2'，3'-双脱氧-β-D-吡喃葡萄糖基结构单元的寡核苷酸的制备（7）

  DOI：

  10.1002/hlca.19920750503

文献信息

• Investigation of The Kinetics of Degradation of Hexopyranosylated Cytosine Nucleosides Using Liquid Chromatography
  作者：Grace N. Thoithi、Ann Van Schepdael、Roger Busson、Gerard Janssen、Arthur Van Aerschot、Piet Herdewijn、EugÈNe Roets、Jos Hoogmartens

  DOI：10.1080/15257770008033003

  日期：2000.1

  Abstract Liquid chromatography was used to follow the degradation of hexopyranosylated cytosine nucleosides in buffers of acid, neutral and alkaline pH and of constant ionic strength. The compounds were found to degrade by hydrolysis to cytosine and/or by deamination to the corresponding uracil nucleosides. Degradation in acid is influenced by the number of sugar hydroxyl groups, presence of sugar double

  摘要在酸性，中性和碱性pH值和恒定离子强度的缓冲液中，采用液相色谱法跟踪六吡喃糖基化胞嘧啶核苷的降解情况。发现该化合物通过水解成胞嘧啶和/或通过脱氨基成相应的尿嘧啶核苷而降解。酸的降解受糖羟基数量，糖双键的存在和端基异构体类型的影响。将某些化合物的稳定性与相关胸腺嘧啶核苷的稳定性进行了比较。温度研究支持在pH 1.22下水解的单分子机理。
• VAN, AERSCHOT A.;KERREMANS, L.;BALZARINI, J.;DE, CLERCQ E.;HERDEWIJN, P., NUCLEOSIDES AND NUCLEOTIDES, 10,(1991) N-3, C. 589-590
  作者：VAN, AERSCHOT A.、KERREMANS, L.、BALZARINI, J.、DE, CLERCQ E.、HERDEWIJN, P.

  DOI：——

  日期：——
• Warum Pentose- und nicht Hexose-Nucleinsäuren??. Teil II. Oligonucleotide aus 2′,3′-Dideoxy-β-<scp>D</scp>-glucopyranosyl-Bausteinen (‘Homo-DNS’): Herstellung.
  作者：Markus Böhringer、Hans-JÖRg Roth、Jürg Hunziker、Michael Göbel、Ravichandran Krishnan、Alfred Giger、Bernd Schweizer、Jakob Schreiber、Christian Leumann、Albert Eschenmoser

  DOI：10.1002/hlca.19920750503

  日期：1992.8.13

  Why Pentose and Not Hexose Nucleic Acids? Part II. Preparation of Oligonucleotides Containing 2′,3′-Dideoxy-β-D-glucopyranosyl Building Blocks(7)

  为什么是戊糖而不是己糖核酸？第二部分。包含2'，3'-双脱氧-β-D-吡喃葡萄糖基结构单元的寡核苷酸的制备（7）
• [EN] COMPOSITIONS FOR EDITING MECP2 TRANSCRIPTS AND METHODS THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS POUR L'ÉDITION DE TRANSCRITS MECP2 ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：[en]WAVE LIFE SCIENCES LTD.

  公开号：WO2023049477A2

  公开（公告）日：2023-03-30

  Among other things, the present disclosure provides oligonucleotides, compositions and methods thereof that can bring about specific editing of a target adenosine in a target RNA molecule. Such oligonucleotides, compositions and methods are useful to treat, prevent, or ameliorate MECP2 associated disorders, diseases and syndromes that can benefit from adenosine modification.