作者:Christopher DeLaney、Yan Sheng、D. Chase Pectol、Erol Vantansever、Hanyuan Zhang、Nattamai Bhuvanesh、Isaiah Salas、Wenshe R. Liu、Carol F. Fierke、Marcetta Y. Darensbourg
DOI:10.1039/d1dt02499j
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Numerous organic molecules are known to inhibit the main protease of SARS-CoV-2, (SC2Mpro), a key component in viral replication of the 2019 novel coronavirus. We explore the hypothesis that zinc ions, long used as a medicinal supplement and known to support immune function, bind to the SC2Mpro enzyme in combination with lipophilic tropolone and thiotropolone ligands, L, block substrate docking, and
已知许多有机分子可以抑制 SARS-CoV-2 的主要蛋白酶 (SC2M pro ),这是 2019 年新型冠状病毒病毒复制的关键成分。我们探索了以下假设:锌离子长期用作药物补充剂并已知支持免疫功能,结合 SC2M pro酶与亲脂性托酚酮和硫托酚酮配体L 结合,阻断底物对接并抑制功能。这项研究结合了合成无机化学、体外蛋白酶活性分析和计算模型。虽然配体本身具有半数最大抑制浓度 IC 50,对于 SC2M pro在 8–34 μM 范围内,IC50 个值是大约。Zn(NO 3 ) 2为 100 nM,在 Zn- L组合中进一步增强(59-97 nM)。Zn( L ) 2二元复合物的分离和它们进行配体置换的能力的表征是酶抑制的化学特征的计算建模的基础。使用修改后的 Autodock4 协议盲对接到 SC2M pro酶表面发现优先结合到活性位点口袋中。这种Zn- L组合的取向允许 Zn( L ) +与碱性活性位点残基发生配价键合。