2-acetamido-1,2-dideoxynojirimicin hydrochloride | 1356848-49-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 哌啶类
• 英文名称: 2-acetamido-1,2-dideoxynojirimicin hydrochloride
• 英文别名: 2-N-acetamido-1,2-dideoxynojirimicin hydrochloride；2-acetamido-1,2,5-trideoxy-1,5-imino-D-glucitol hydrochloride；2-Acetamido-1,2-dideoxynojirimycin Hydrochloride；N-[(3S,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)piperidin-3-yl]acetamide;hydrochloride
• CAS: 1356848-49-1
• 化学式: C₈H₁₆N₂O₄*ClH
• 分子量: 240.687
• InChiKey: PXYTXXMWBPXVRV-ANJNCBFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-acetamido-1,2-dideoxynojirimicin hydrochloride 在 Dowex (50W-X₈, H⁺) 作用下， 以 水 为溶剂， 以95%的产率得到2-乙酰氨基-1,2,5-三脱氧-1,5-亚氨基-d-葡萄糖醇
  参考文献：
  名称：

  从葡萄糖醛酸内酯可扩展地合成 DNJNAc 和 DGJNAc 两种对映体：N-烷基化对氨基己糖苷酶抑制的影响

  摘要：

  2-乙酰氨基-1,2-双脱氧-D-半乳糖-野尻霉素（DGJNAc）和2-乙酰氨基-1,2-双脱氧-D-葡萄糖-野尻霉素（DNJNAc ）的高效可扩展合成，以及据报道，它们的对映异构体来自L-葡糖醛酸内酯。DNJNAc 和 DGJNAc 的两种对映异构体及其N-烷基衍生物作为糖苷酶抑制剂的评估表明，DGJNAc 及其N-烷基衍生物都是 α-GalNAcase 的抑制剂，但没有一种差向异构 DNJNAc 衍生物抑制这种酶。相比之下，DGJNAc 和 DNJNAc 以及它们的烷基衍生物都是 β-GlcNAcases 和 β-GalNAcases 的有效抑制剂。两种L-对映异构体均未显示出对所测试的任何酶的任何显着抑制。通过对溶酶体酶抑制的游离寡糖分析，体外抑制与细胞数据的相关性揭示了以下结构-性质关系：疏水侧链优先促进亚氨基糖在细胞内接近那些具有更多亲水性的抑制剂- 链特征。

  DOI：

  10.1002/chem.201200110
• 作为产物：
  描述：

  3,6-di-O-acetyl-2-azido-1-N,4-O-dibenzyl-1,2,5-trideoxy-1,5-imino-D-glucitol 在 盐酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 sodium methylate 、 copper(II) sulfate 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 40.33h， 生成 2-acetamido-1,2-dideoxynojirimicin hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  从葡萄糖醛酸内酯可扩展地合成 DNJNAc 和 DGJNAc 两种对映体：N-烷基化对氨基己糖苷酶抑制的影响

  摘要：

  2-乙酰氨基-1,2-双脱氧-D-半乳糖-野尻霉素（DGJNAc）和2-乙酰氨基-1,2-双脱氧-D-葡萄糖-野尻霉素（DNJNAc ）的高效可扩展合成，以及据报道，它们的对映异构体来自L-葡糖醛酸内酯。DNJNAc 和 DGJNAc 的两种对映异构体及其N-烷基衍生物作为糖苷酶抑制剂的评估表明，DGJNAc 及其N-烷基衍生物都是 α-GalNAcase 的抑制剂，但没有一种差向异构 DNJNAc 衍生物抑制这种酶。相比之下，DGJNAc 和 DNJNAc 以及它们的烷基衍生物都是 β-GlcNAcases 和 β-GalNAcases 的有效抑制剂。两种L-对映异构体均未显示出对所测试的任何酶的任何显着抑制。通过对溶酶体酶抑制的游离寡糖分析，体外抑制与细胞数据的相关性揭示了以下结构-性质关系：疏水侧链优先促进亚氨基糖在细胞内接近那些具有更多亲水性的抑制剂- 链特征。

  DOI：

  10.1002/chem.201200110

文献信息

• Bicyclic Picomolar OGA Inhibitors Enable Chemoproteomic Mapping of Its Endogenous Post-translational Modifications
  作者：Manuel González-Cuesta、Peter Sidhu、Roger A. Ashmus、Alexandra Males、Cameron Proceviat、Zarina Madden、Jason C. Rogalski、Jil A. Busmann、Leonard J. Foster、José M. García Fernández、Gideon J. Davies、Carmen Ortiz Mellet、David J. Vocadlo

  DOI：10.1021/jacs.1c10504

  日期：2022.1.19

  cleft in which diverse substrates are accommodated. Chemical tools to control OGA are emerging as essential resources for helping to decode the biochemical and cellular functions of the O-GlcNAc pathway. Here we describe rationally designed bicyclic thiazolidine inhibitors that exhibit superb selectivity and picomolar inhibition of human OGA. Structures of these inhibitors in complex with human OGA reveal

  由于其在人类健康和疾病中的作用，用 O 连接的N修饰核、细胞质和线粒体蛋白-乙酰氨基葡萄糖残基 (O-GlcNAc) 已成为备受关注的话题。尽管细胞内数百种蛋白质上存在 O-GlcNAc，但只有两种酶调节这种修饰。其中一种酶是 O-GlcNAcase (OGA)，它是一种二聚糖苷水解酶，具有可容纳多种底物的深活性位点裂缝。控制 OGA 的化学工具正在成为帮助解码 O-GlcNAc 途径的生化和细胞功能的重要资源。在这里，我们描述了合理设计的双环噻唑烷抑制剂，它们表现出极好的选择性和对人类 OGA 的皮摩尔抑制。这些抑制剂与人类 OGA 复合的结构揭示了它们异常效力的基础，并表明它们延伸到酶活性位点裂缝之外。利用这种结构，我们创建了一种高亲和力化学蛋白质组学探针，它可以从大脑中简单地一步纯化内源性 OGA，并对其翻译后修饰进行靶向蛋白质组学定位。这些数据揭示了一系列新的修饰，包括一些鲜为人知的修饰，例如
• Inhibitors for Bacterial Cell-Wall Recycling
  作者：Takao Yamaguchi、Blas Blázquez、Dusan Hesek、Mijoon Lee、Leticia I. Llarrull、Bill Boggess、Allen G. Oliver、Jed F. Fisher、Shahriar Mobashery

  DOI：10.1021/ml2002746

  日期：2012.3.8

  Gram-negative bacteria have evolved an elaborate process for the recycling of their cell wall, which is initiated in the periplasmic space by the action of lytic transglycosylases. The product of this reaction, beta-D-N-acetylglucosamine-(1 -> 44)-1,6-anhydro-beta-D-N-acetylmuramyl-L-Ala-gamma-D-Glu-meso-DAP-D-Ala-D-Ala (compound 1), is internalized to begin the recycling events within the cytoplasm. The first step in the cytoplasmic recycling is catalyzed by the NagZ glycosylase, which cleaves in a hydrolytic reaction the N-acetylglucosamine glycosidic bond of metabolite 1. The reactions catalyzed by both the lytic glycosylases and NagZ are believed to involve oxocarbenium transition species. We describe herein the synthesis and evaluation of four iminosaccharides as possible mimetics of the oxocarbenium species, and we disclose one as a potent (compound 3, K-i = 300 +/- 15 nM) competitive inhibitor of NagZ.