(4R,4aS,5aS,6R,12aS)-9-((2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)-3,4,10,12-tetrahydroxy-6,12a-dimethoxy-6-methyl-1,11-dioxo-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-octahydrotetracene-2-carboxamide | 141215-09-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 四环素类
• 英文名称: (4R,4aS,5aS,6R,12aS)-9-((2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)-3,4,10,12-tetrahydroxy-6,12a-dimethoxy-6-methyl-1,11-dioxo-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-octahydrotetracene-2-carboxamide
• CAS: 141215-09-0
• 化学式: C₂₈H₃₃NO₁₂
• 分子量: 575.57
• InChiKey: IQORQSSKFIXANF-ZLCWVCDWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  226.3
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,4-二羟基苯甲酸 、 (4R,4aS,5aS,6R,12aS)-9-((2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)-3,4,10,12-tetrahydroxy-6,12a-dimethoxy-6-methyl-1,11-dioxo-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-octahydrotetracene-2-carboxamide 在 ATP-dependent salicylyl-CoA ligase 、 C-4 salicylyl transferase 、 5’-三磷酸腺苷 、 辅酶 A 、 magnesium chloride 作用下， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  抗癌四环素SF2575生物合成途径的生化分析

  摘要：

  SF2575 1 是由 Streptomyces sp. 产生的四环素聚酮化合物。SF2575 对多种癌细胞系显示出异常有效的抗癌活性。SF2575 的结构特点是高度取代的四环素苷元。修饰包括 C-6 和 C-12a 羟基的甲基化、4-(S)-羟基与水杨酸的酰化、D-环的 C-9 的 C-糖基化与 D-橄榄糖以及进一步的酰化D-橄榄糖的 C4'-羟基与不寻常的当归酸。因此，了解 SF2575 的生物合成可以扩展可以修饰四环素的酶库，并促进 SF2575 类似物的工程生物合成。在这项研究中，我们对包含 40 个假定开放阅读框的 ssf 生物合成基因簇进行了鉴定、测序和功能分析。在基因簇中发现了编码酶的基因，这些酶可以组装四环素苷元，以及安装这些独特的结构特征。从 SF2575 培养提取物中分离出生物合成中间体，表明侧基添加的顺序是 C-9 糖基化、C-4 水杨基化和 O-4' 天使酰化。使用体外分析，鉴定了两种负责水杨酸

  DOI：

  10.1021/ja907852c
• 作为产物：
  描述：

  SF2575 在 sodium hydroxide 作用下， 反应 15.0h， 生成 (4R,4aS,5aS,6R,12aS)-9-((2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)-3,4,10,12-tetrahydroxy-6,12a-dimethoxy-6-methyl-1,11-dioxo-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-octahydrotetracene-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  四环素生物合成途径中水杨酰基转移酶 SsfX3 的结构和生化特征。

  摘要：

  SsfX3 是一种 GDSL 家族酰基转移酶，在抗癌天然产物 SF2575 生物合成过程中的倒数第二步中，将水杨酸转移至四环素中间体的 C-4 羟基。C-4 水杨酸酯取代了更常见的 C-4 二甲胺官能团，使 SsfX3 成为第一个被确定作用于四环素底物的酰基转移酶。SsfX3 的晶体结构在 2.5 A 下测定，揭示了两个不同的结构域，如下所示：类似于碳水化合物结合模块的 N 端 β 夹心结构域，以及包含非典型 α/β 水解酶的 C 端催化结构域GDSL 水解酶家族中发现的折叠。活性位点位于一个大的开放结合袋的一端，该结合袋在空间上由 N 端和 C 端结构域的结构元件定义。假定的底物结合口袋中的突变分析鉴定了来自两个结构域的残基，这些残基对于结合酰基供体和受体很重要。此外，去除 N 端碳水化合物结合模块样结构域使独立的 α/β-水解酶结构域失活。因此，建议需要额外的非催化模块来限定结合袋并提

  DOI：

  10.1074/jbc.m111.299859

文献信息

• Biochemical Analysis of the Biosynthetic Pathway of an Anticancer Tetracycline SF2575
  作者：Lauren B. Pickens、Woncheol Kim、Peng Wang、Hui Zhou、Kenji Watanabe、Shuichi Gomi、Yi Tang

  DOI：10.1021/ja907852c

  日期：2009.12.9

  SsfX3, both of which were shown to have relaxed substrate specificity toward substituted benzoic acids. Since the salicylic acid moiety is critically important for the anticancer properties of SF2575, verification of the activities of SsfL1 and SsfX3 sets the stage for biosynthetic modification of the C-4 group toward structure-activity relationship studies of SF2575. Using heterologous biosynthesis in

  SF2575 1 是由 Streptomyces sp. 产生的四环素聚酮化合物。SF2575 对多种癌细胞系显示出异常有效的抗癌活性。SF2575 的结构特点是高度取代的四环素苷元。修饰包括 C-6 和 C-12a 羟基的甲基化、4-(S)-羟基与水杨酸的酰化、D-环的 C-9 的 C-糖基化与 D-橄榄糖以及进一步的酰化D-橄榄糖的 C4'-羟基与不寻常的当归酸。因此，了解 SF2575 的生物合成可以扩展可以修饰四环素的酶库，并促进 SF2575 类似物的工程生物合成。在这项研究中，我们对包含 40 个假定开放阅读框的 ssf 生物合成基因簇进行了鉴定、测序和功能分析。在基因簇中发现了编码酶的基因，这些酶可以组装四环素苷元，以及安装这些独特的结构特征。从 SF2575 培养提取物中分离出生物合成中间体，表明侧基添加的顺序是 C-9 糖基化、C-4 水杨基化和 O-4' 天使酰化。使用体外分析，鉴定了两种负责水杨酸
• Structural and Biochemical Characterization of the Salicylyl-acyltranferase SsfX3 from a Tetracycline Biosynthetic Pathway
  作者：Lauren B. Pickens、Michael R. Sawaya、Huma Rasool、Inna Pashkov、Todd O. Yeates、Yi Tang

  DOI：10.1074/jbc.m111.299859

  日期：2011.12

  acyltransferase that transfers salicylate to the C-4 hydroxyl of a tetracycline intermediate in the penultimate step during biosynthesis of the anticancer natural product SF2575. The C-4 salicylate takes the place of the more common C-4 dimethylamine functionality, making SsfX3 the first acyltransferase identified to act on a tetracycline substrate. The crystal structure of SsfX3 was determined at 2.5

  SsfX3 是一种 GDSL 家族酰基转移酶，在抗癌天然产物 SF2575 生物合成过程中的倒数第二步中，将水杨酸转移至四环素中间体的 C-4 羟基。C-4 水杨酸酯取代了更常见的 C-4 二甲胺官能团，使 SsfX3 成为第一个被确定作用于四环素底物的酰基转移酶。SsfX3 的晶体结构在 2.5 A 下测定，揭示了两个不同的结构域，如下所示：类似于碳水化合物结合模块的 N 端 β 夹心结构域，以及包含非典型 α/β 水解酶的 C 端催化结构域GDSL 水解酶家族中发现的折叠。活性位点位于一个大的开放结合袋的一端，该结合袋在空间上由 N 端和 C 端结构域的结构元件定义。假定的底物结合口袋中的突变分析鉴定了来自两个结构域的残基，这些残基对于结合酰基供体和受体很重要。此外，去除 N 端碳水化合物结合模块样结构域使独立的 α/β-水解酶结构域失活。因此，建议需要额外的非催化模块来限定结合袋并提