cytidine 2',3'-cyclic 5'-bis(monophosphate) | 5511-94-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: cytidine 2',3'-cyclic 5'-bis(monophosphate)
• 英文别名: O^2',O^3'-hydroxyphosphoryl-[5']cytidylic acid；Cytidin-2',3'-phosphat-5'-phosphat；Cyclo-cdp；[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-hydroxy-2-oxo-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3,2]dioxaphosphol-6-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 5511-94-4
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₁₀P₂
• 分子量: 385.164
• InChiKey: IZJNKZMLZILGRK-XVFCMESISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.4
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-胞苷酸 在 sodium hydroxide 、 Sodium trimetaphosphate 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 96.0h， 生成 cytidine 2',3'-cyclic 5'-bis(monophosphate) 、 胞苷 3',5'-二磷酸酯 、 cytidine 2',5'-bis(monophosphate)
  参考文献：
  名称：

  核苷酸与无机环三磷酸的磷酸化

  摘要：

  在各种条件下（P3m 与核苷酸的混合比、pH 值）在水溶液中研究了核苷酸（核苷 3'-和 5'-单磷酸酯，以及 2'-脱氧核苷 5'-单磷酸酯）与无机环三磷酸钠 (P3m) 的磷酸化、反应温度和时间）。(I) 未受保护的 5'-单磷酸核苷 (5'-NMP's) 很容易在顺式 2',3'-二醇处被 P3m 磷酸化，形成选择性核苷 2',5'-双（单磷酸）（2',5 '-NDP's）、核苷 3',5'-双（单磷酸）（3',5'-NDP）和核苷 2',3'-环状 5'-双（单磷酸）（cNDP）。(2) 5'-NMP's 的磷酸化强烈依赖于混合比、pH、反应温度和时间。在 P3m 与 5'-NMP's 的高混合比 (5:1–10:1)、高 pH (12) 和室温条件下，92-98% 的 5'-NMP's 转化为 3',5' -NDP 和 2'，大致等摩尔量的 5'-NDP。(3) 在 5'-NMP's

  DOI：

  10.1246/bcsj.64.490