含
溴结构域的蛋白质通过蛋白质-蛋白质与染色质的相互作用来调节转录,并充当招募转录机制重要成员的支架蛋白。其中一种蛋白质是含
溴结构域和 PHD 的转录因子 (B
PTF),它是核小体重塑复合物 NURF 的最大成员。尽管 B
PTF 在调节多种癌症方面发挥着新兴作用,但抑制 B
PTF
溴结构域的小分子开发一直缺乏。在这里,我们交叉验证了三种互补的
生物物理测定,以进一步发现用于
化学探针开发的 B
PTF
溴结构域
抑制剂:两种直接结合测定(蛋白质观察19 F (PrOF) NMR 和表面等离子共振 (
SPR))和竞争性抑制测定(阿尔法屏幕)。我们首先比较使用三种小分子和乙酰化组蛋白肽的测定,并报告对 B
PTF
溴结构域的亲和力。使用具有未标记和
氟化 B
PTF 的
SPR,我们进一步确定19 F 掺入对未来 PrOF NMR 实验的
配体结合的影响最小。为了指导
化学探针开发的药物
化学工作,我们随后使用我们