5-(3-aminoallyl)-2'-deoxyuridine 5'-triphosphate | 90015-82-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 5-(3-aminoallyl)-2'-deoxyuridine 5'-triphosphate
• 英文别名: allylamine-dUTP；AA-dUTP；5'-triphosphate-5-(3-aminopropen-1-yl)deoxyuridine；5-(3-aminoallyl)-2'-deoxyurdine 5'-triphosphate；2'-deoxyuridine-triphosphate allyl amine；aminoallyl-dUTP；[[(2R,3S,5R)-5-[5-(3-aminoprop-1-enyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 90015-82-0
• 化学式: C₁₂H₂₀N₃O₁₄P₃
• 分子量: 523.224
• InChiKey: AAQWIRIAZPJBAM-IVZWLZJFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.934±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.2
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  265
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(3-aminoallyl)-2'-deoxyuridine 5'-triphosphate 、 6-(N-三氟乙酰基)氨基己酸N-琥珀酰亚胺基酯 在 氨 、 水 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 aminohexanoyl-aminoallyl-dUTP
  参考文献：
  名称：

  [EN] CYANINE DYE LABELLING REAGENTS
  [FR] REACTIFS DE MARQUAGE A COLORANTS DE CYANINE

  摘要：

  揭示了一种对生物和其他材料进行标记和检测有用的青菁染料。该染料具有以下结构式（I），其中基团R3和R4连接到Z1环结构，基团R5和R6连接到Z2环结构，n = 1、2或3；Z1和Z2独立表示完成一个环或两个融合环芳香系统所需的碳原子；基团R1、R2、R3、R4、R5、R6和R7中至少有一个是基团-E-F，其中E是一个单键或一个间隔基团，F是一个目标结合基团；基团R11、R12、R13和R14中的一个或多个是独立选择自羟基-(CH2)k-W的群，其中W是磺酸或膦酸，k是1到10之间的整数。这些染料可用于荧光标记应用，其中将至少一个且最好是多个水溶性基团连接到吲哚啉环的3位，可以减少染料间的相互作用，从而减少染料间的猝灭，特别是当多个染料分子连接到核酸、寡核苷酸、蛋白质和抗体等组分时。

  公开号：

  WO2005044923A1
• 作为产物：
  描述：

  allylamine acetate 、 chloro-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]mercury 在 lithium tetrachloropalladate sodium acetate 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 5-(3-aminoallyl)-2'-deoxyuridine 5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  [EN] A SYSTEM FOR DELIVERING THERAPEUTIC AGENTS INTO LIVING CELLS AND CELL NUCLEI
  [FR] SYSTEME POUR INTRODUIRE DES AGENTS THERAPEUTIQUES DANS DES CELLULES VIVANTES ET NOYAUX DE CELLULE

  摘要：

  公开号：

  WO2006010084A3

文献信息

• MONOAZO DYES WITH CYCLIC AMINE AS FLUORESCENCE QUENCHERS
  申请人：Enzo Biochem, Inc.

  公开号：US20160289779A1

  公开（公告）日：2016-10-06

  The present disclosure provides reactive quencher dyes that can be used in the detection and/or quantification of desirable target molecules, such as proteins, nucleic acids and various cellular organelles. These dyes are essentially non-fluorescent but are efficient quenchers of various fluorescent dyes. Also, provided are methods of using the dyes, bio-probes incorporating dyes and methods of using the bio-probes. The quencher dyes described herein are modified to provide beneficial properties.

  本公开提供了一种可以用于检测和/或定量理想目标分子（如蛋白质、核酸和各种细胞器官）的反应性猝灭染料。这些染料基本上不发光，但是可以有效猝灭各种荧光染料。此外，还提供了使用这些染料的方法，包括含有染料的生物探针以及使用生物探针的方法。本文描述的猝灭染料经过改良以提供有益特性。
• Labeling reagents and labeled targets, target labeling processes and other processes for using same in nucleic acid determinations and analyses
  申请人：——

  公开号：US20030225247A1

  公开（公告）日：2003-12-04

  This invention provides for labeling reagents, labeled targets and processes for preparing labeling reagents. The labeling reagents can take the form of cyanine dyes, xanthene dyes, porphyrin dyes, coumarin dyes or composite dyes. These labeling reagents are useful for labeling probes or targets, including nucleic acids and proteins. These reagents can be usefully applied to protein and nucleic acid probe based assays. They are also applicable to real-time detection processes.

  这项发明提供了用于标记试剂、标记靶物和制备标记试剂的过程。这些标记试剂可以采用青霉素染料、黄色素染料、卟啉染料、香豆素染料或复合染料的形式。这些标记试剂对于标记探针或靶物（包括核酸和蛋白质）非常有用。这些试剂可以被有益地应用于基于蛋白质和核酸探针的分析。它们也适用于实时检测过程。
• Hydroxamate substituted azaindoline-cyanine dyes and bioconjugates of the same
  申请人：Becton, Dickinson and Company

  公开号：US09012643B2

  公开（公告）日：2015-04-21

  Hydroxamate substituted azaindoline cyanine dyes, conjugates thereof and methods of using the same are provided. The subject cyanine dyes include an azaindoline ring having a hydroxamate substituent. The dyes may further include a reactive group moieties (RGM) and/or a water soluble group. Also provided are conjugates of the subject dyes. Also provided are tandem conjugates including a fluorescent protein capable of energy transfer to the dye. Methods of detecting an analyte in a sample by contacting the sample with a detection reagent are provided. The detection agent may be a dye-conjugate that specifically binds the analyte, or may be a reactive dye which conjugates to the analyte. Also provided are compositions, e.g., kits, etc., incorporating such dyes which facilitate use in such methods.

  提供了羟肟取代的氮杂环吲哚青霉素染料，以及它们的共轭物和使用方法。所述青霉素染料包括具有羟肟取代基的氮杂环吲哚环。这些染料可能进一步包括反应性基团（RGM）和/或水溶性基团。还提供了所述染料的共轭物。还提供了包括能够将能量传递给染料的荧光蛋白的串联共轭物。提供了通过将样品与检测试剂接触来检测样品中的分析物的方法。检测剂可以是特异性结合分析物的染料共轭物，也可以是与分析物结合的反应性染料。还提供了包括这种染料的组合物，例如试剂盒等，有助于在这些方法中使用。
• Facile preparation of non-self-quenching fluorescent DNA strands with the degree of labeling up to the theoretic limit
  作者：Yong Yu、Jianzhao Liu、Zujin Zhao、Ka Ming Ng、Kathy Qian Luo、Ben Zhong Tang

  DOI：10.1039/c2cc32038j

  日期：——

  A new aggregation-induced emission (AIE) compound 1,1-dimethyl-2,5-bis[4-(isothiocyanatemethyl)phenyl]-3,4-diphenylsilole (SITC) was synthesized and used to conjugate with aminoallyl-dUTP. The SITC–dUTP can be incorporated enzymatically into DNA strands with the degree of labeling (DOL) up to the theoretic limit.

  研究人员合成了一种新的聚集诱导发射（AIE）化合物 1,1-二甲基-2,5-双[4-（异硫氰酸基甲基）苯基]-3,4-二苯基硅油（SITC），并将其用于与氨基烯丙基-dUTP 共轭。SITC-dUTP 可通过酶法与 DNA 链结合，标记度（DOL）可达到理论极限。
• Macromolecular Nucleotide Compounds and Methods for Using the Same
  申请人：Cherkasov Dmitry

  公开号：US20100093992A1

  公开（公告）日：2010-04-15

  The invention relates to the structure, production and use of modified nucleotide and nucleoside building blocks, (nuc-macromolecules).

  这项发明涉及修饰核苷酸和核苷建构模块（核酸大分子）的结构、生产和使用。