5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-5-methyl uridine | 134821-75-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-5-methyl uridine
• 英文别名: TBDPS(-5)Ribf(b)-thymin-1-yl；1-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 134821-75-3
• 化学式: C₂₆H₃₂N₂O₆Si
• 分子量: 496.635
• InChiKey: UTPFWECPNPDNDI-GBEXAXCTSA-N

物化性质

• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.04
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-5-methyl uridine 在 硼烷四氢呋喃络合物 、 四磷十氧化物 、 氢气 、 碳酸氢钠 、 三苯基膦 作用下， 40.0~160.0 ℃ 、790.82 kPa 条件下， 反应 68.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOSIDE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF RNA-DEPENDENT RNA VIRAL POLYERMASE

  摘要：

  本发明提供了核苷类化合物及其某些衍生物，这些化合物是RNA依赖性RNA病毒聚合酶的抑制剂。这些化合物是RNA依赖性RNA病毒复制的抑制剂，对于治疗RNA依赖性RNA病毒感染非常有用。它们特别适用于作为乙型肝炎病毒（HCV）NS5B聚合酶的抑制剂，作为HCV复制的抑制剂，和/或用于治疗丙型肝炎感染。该发明还描述了含有这种核苷类化合物的药物组合物，单独使用或与其他针对RNA依赖性RNA病毒感染，特别是HCV感染的药物一起使用。还公开了使用本发明的核苷类化合物抑制RNA依赖性RNA聚合酶、抑制RNA依赖性RNA病毒复制和/或治疗RNA依赖性RNA病毒感染的方法。

  公开号：

  US20170183373A1
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2',3'-O-(2-bromo-1-diethylphosphonoethylidene)-5'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine 在 吡啶 、 potassium fluoride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-5-methyl uridine
  参考文献：
  名称：

  核糖核苷的2'，3'-O-膦亚烷基衍生物：合成与反应性

  摘要：

  新型的核苷酸类似物，核糖核苷的2'，3'-O-（1-二乙基膦酰基）亚烷基衍生物是通过亚磷酸二乙酯与各种原核苷的氧化还原反应制备的。当用亲核试剂处理时，这些化合物中的一些会发生有趣的重排。通过2D-ROESY实验确定标题化合物的构型。还讨论了部分受保护的核苷酸类似物的生物活性。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(98)00653-x

文献信息

• Synthesis and in vitro growth inhibitory activity of novel silyl- and trityl-modified nucleosides
  作者：Jenny-Lee Panayides、Véronique Mathieu、Laetitia Moreno Y. Banuls、Helen Apostolellis、Nurit Dahan-Farkas、Hajierah Davids、Leonie Harmse、M.E. Christine Rey、Ivan R. Green、Stephen C. Pelly、Robert Kiss、Alexander Kornienko、Willem A.L. van Otterlo

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.04.036

  日期：2016.6

  Seventeen silyl- and trityl-modified (5'-O- and 3',5'-di-O-) nucleosides were synthesized with the aim of investigating the in vitro antiproliferative activities of these nucleoside derivatives. A subset of the compounds was evaluated at a fixed concentration of 100μM against a small panel of tumor cell lines (HL-60, K-562, Jurkat, Caco-2 and HT-29). The entire set was also tested at varying concentrations

  为了研究这些核苷衍生物的体外抗增殖活性，合成了十七个甲硅烷基和三苯甲基修饰的（5'-O-和3'，5'-di-O-）核苷。针对一小组肿瘤细胞系（HL-60，K-562，Jurkat，Caco-2和HT-29）以固定的100μM浓度评估了这些化合物的子集。还以两种人胶质瘤细胞株（U373和Hs683）的不同浓度对整套样品进行了测试，得出GI50值，最好的结果是〜25μM。
• Improved Protocol for the Synthesis of Flexibly Protected Morpholino Monomers from Unprotected Ribonucleosides
  作者：Sankha Pattanayak、Sibasish Paul、Bappaditya Nandi、Surajit Sinha

  DOI：10.1080/15257770.2012.724491

  日期：2012.11

  protected morpholino monomers from unprotected ribonucleosides in high overall yield, using oxidative glycol cleavage and reductive amination strategy. Unlike the previous methods, the present strategy allows installing the exocyclic amine protections at a later stage, and thus avoids the use of expensive, or commercially unavailable, exocyclic amine-protected ribonucleosides as starting materials. To

  已经开发了一种廉价且大大改进的方案，使用氧化乙二醇裂解和还原胺化策略从未保护的核糖核苷以高总收率合成受保护的吗啉代单体。与先前的方法不同，本策略允许在稍后的阶段安装环外胺保护剂，从而避免使用昂贵的或市售的环外胺保护的核糖核苷作为起始原料。为了证明本发明方法在选择保护基上的灵活性，已在环外胺位置用几个具有不同解嵌段性质的此类基团保护了单体。
• MORPHOLINO-BASED ANTISENSE AGENT
  申请人：Sinha Surajit

  公开号：US20120296087A1

  公开（公告）日：2012-11-22

  Morpholino-based oligomers suitable as antisense agent comprising modifications of phosphorodiamidate backbone or modification with 5-substituted pyrimidines of morpholino compound that is soluble in culture medium and sufficient for cell penetration thereby eliminating the need for injecting into the cells. Monomers comprising the said oligomers and its method of manufacture, method of manufacture of the said oligomers and its dye, flurophore, drug, biomolecule conjugate wherein the said oligomers find different end use but not limited to regulation of gene expression, tissue culture with improved transfection efficiency and related studies on cellular transfection.

  基于Morpholino的寡聚体适用作为反义物质，包括对磷酸二胺酰基骨架的修饰或对Morpholino化合物进行5-取代嘧啶的修饰，该化合物在培养基中溶解并足以渗透细胞，从而消除了注射到细胞中的需要。包括上述寡聚体的单体及其制造方法，上述寡聚体及其染料、荧光素、药物、生物分子共轭物的制造方法，其中上述寡聚体具有不同的最终用途，但不限于调控基因表达，具有改善转染效率的组织培养以及有关细胞转染的相关研究。
• Inhibition of human thymidine phosphorylase by conformationally constrained pyrimidine nucleoside phosphonic acids and their “open-structure” isosteres
  作者：Ivana Košiová、Ondřej Šimák、Natalya Panova、Miloš Buděšínský、Magdalena Petrová、Dominik Rejman、Radek Liboska、Ondřej Páv、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.12.026

  日期：2014.3

  A series of conformationally constrained uridine-based nucleoside phosphonic acids containing annealed 1,3-dioxolane and 1,4-dioxane rings and their “open-structure” isosteres were synthesized and evaluated as potential multisubstrate-like inhibitors of the human recombinant thymidine phosphorylase (TP, EC 2.4.2.4) and TP obtained from peripheral blood mononuclear cells (PBMC). From a large set of

  合成了一系列构象受约束的基于尿苷的核苷膦酸，其中包含退火的1,3-二氧戊环和1,4-二氧杂环丁烷环及其“开放结构”等位基因，并被评估为人类重组胸苷磷酸化酶的潜在多底物状抑制剂（ TP，EC 2.4.2.4）和从外周血单核细胞（PBMC）获得的TP。从大量经过测试的核苷膦酸中，鉴定出几种有效化合物，它们的K i值在0.048–1μM的范围内。所研究化合物的抑制能力在很大程度上取决于膦酸酯部分的构象柔性程度，糖膦酸酯组分的立体化学排列以及嘧啶核碱基5位上的取代基。
• <i>N</i> ‐Fluoroalkylated Morpholinos – a New Class of Nucleoside Analogues
  作者：Nóra Debreczeni、Judit Hotzi、Miklós Bege、Miklós Lovas、Erika Mező、Ilona Bereczki、Pál Herczegh、Loránd Kiss、Anikó Borbás

  DOI：10.1002/chem.202203248

  日期：2023.2.21

  The first synthesis of N-fluoroalkylated morpholino nucleoside derivatives is reported. The procedures were based either on a double reductive amination-cyclisation reaction, using commercially available mono-, di- and trifluoralkylated amines, or on post-cyclisation trifluoromethylation of the morpholino nitrogen, by oxidative desulfurization-fluorination with NBS and diethylaminosulfur trifluoride

  报道了首次合成N-氟烷基化吗啉代核苷衍生物。这些程序基于双还原胺化-环化反应，使用市售的单、二和三氟烷基化胺，或基于吗啉代氮的环化后三氟甲基化，通过氧化脱硫-氟化与 NBS 和二乙基氨基三氟化硫。