N-Terminal amino acid side-chain cleavage of chemically modified peptides in the gas phase: A mass spectrometry technique for N-terminus identification
作者:A CHACON、D MASTERSON、H YIN、D LIEBLER、N PORTER
DOI:10.1016/j.bmc.2006.05.060
日期:2006.9.15
the b or y-ion series in a peptide MS/MS spectrum as well as identification of the b1 - and yn-1 -ions can facilitate de novo analyses. Therefore, it is valuable to identify either amino-acid terminus. In previous work, we have demonstrated that peptides modified at the epsilon-amino group of lysine as a t-butyl peroxycarbamate derivative undergo free radical promoted peptide backbone fragmentation under
尽管基因组数据库已成为蛋白质组学分析的关键,但是从头测序对于研究基因组尚未完成的生物仍然至关重要。另外,翻译后修饰对数据库搜索提出了挑战。识别肽段MS / MS光谱中的b或y离子系列以及鉴定b1和yn-1离子可以促进从头分析。因此,鉴定任一氨基酸末端是有价值的。在以前的工作中,我们已经证明,在低能量碰撞诱导解离(CID)条件下,赖氨酸的ε-氨基修饰的肽作为过氧氨基甲酸叔丁酯衍生物会经历自由基促进的肽骨架断裂。在这里,我们探讨了修饰为过氧氨基甲酸叔丁酯的N端氨基的化学性质。用芳基叔丁基过氧碳酸酯研究了N-末端胺向简单氨基酸和肽的过氧氨基甲酸酯的转化。对过氧氨基甲酸酯加合物的ESI-MS / MS分析提供了与N端侧链(R)的中性损失相对应的产物离子的证据,从而鉴定了该残基。由N末端残基侧链损失(-R)形成的产物离子的进一步碎裂(MS3)显示b离子的m / z位移等于R的中性损失,因此标记了b离