5-(tert-butoxycarbonyl)amino-N-2-naphthylpentanamide | 1225133-46-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 5-(tert-butoxycarbonyl)amino-N-2-naphthylpentanamide
• 英文别名: Boc-NH-(CH₂)₄-1-naphthylamide；tert-butyl N-[5-(naphthalen-1-ylamino)-5-oxopentyl]carbamate
• CAS: 1225133-46-9
• 化学式: C₂₀H₂₆N₂O₃
• 分子量: 342.438
• InChiKey: FPFBFIXDIDGLCS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  67.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(tert-butoxycarbonyl)amino-N-2-naphthylpentanamide 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 以100%的产率得到5-amino-N-naphthalen-1-ylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  胍基羰基吡咯-芳基衍生物：用于分光光度法识别特定DNA和RNA序列和抗增殖活性的结构调整

  摘要：

  我们对不同的胍基羰基吡咯-芳基衍生物进行了系统的研究，这些衍生物旨在通过将芳香族部分插入核苷酸的碱基堆栈中以及通过胍基羰基吡咯阳离子的凹槽结合来与DNA或RNA相互作用。我们改变了1）芳香环的大小（苯，萘，pyr和a啶），2）连接两个结合基团的接头的长度和柔性，以及3）在不同pH值下存在的正电荷总数。通过UV / Vis，荧光和CD光谱研究了化合物及其与DNA和RNA的相互作用。还确定了对人肿瘤细胞系的抗增殖活性。我们的研究表明，与 DNA需要一个很大的芳香环（py），该芳香环通过柔性接头连接到吡咯部分。但是，正电荷如12，也是必需的。化合物12允许在生理pH值下对ds-DNA进行碱基对选择性识别。这些化合物的抗增殖活性与其对DNA的结合亲和力有关，这表明它们的生物学作用最有可能是由于DNA结合所致。

  DOI：

  10.1002/chem.200901999
• 作为产物：
  描述：

  Boc-5-氨基戊酸 、 1-萘胺 在 N-甲基吗啉 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.33h， 以60%的产率得到5-(tert-butoxycarbonyl)amino-N-2-naphthylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  胍基羰基吡咯-芳基衍生物：用于分光光度法识别特定DNA和RNA序列和抗增殖活性的结构调整

  摘要：

  我们对不同的胍基羰基吡咯-芳基衍生物进行了系统的研究，这些衍生物旨在通过将芳香族部分插入核苷酸的碱基堆栈中以及通过胍基羰基吡咯阳离子的凹槽结合来与DNA或RNA相互作用。我们改变了1）芳香环的大小（苯，萘，pyr和a啶），2）连接两个结合基团的接头的长度和柔性，以及3）在不同pH值下存在的正电荷总数。通过UV / Vis，荧光和CD光谱研究了化合物及其与DNA和RNA的相互作用。还确定了对人肿瘤细胞系的抗增殖活性。我们的研究表明，与 DNA需要一个很大的芳香环（py），该芳香环通过柔性接头连接到吡咯部分。但是，正电荷如12，也是必需的。化合物12允许在生理pH值下对ds-DNA进行碱基对选择性识别。这些化合物的抗增殖活性与其对DNA的结合亲和力有关，这表明它们的生物学作用最有可能是由于DNA结合所致。

  DOI：

  10.1002/chem.200901999

文献信息

• Inhibitory effect of novel somatostatin peptide analogues on human cancer cell growth based on the selective inhibition of DNA polymerase β
  作者：Isoko Kuriyama、Anna Miyazaki、Yuko Tsuda、Hiromi Yoshida、Yoshiyuki Mizushina

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.11.024

  日期：2013.1

  The present study was designed to investigate the anticancer activity of novel nine small peptides (compounds 1-9) derived from TT-232, a somatostatin structural analogue, by analyzing the inhibition of mammalian DNA polymerase (pol) and human cancer cell growth. Among the compounds tested, compounds 3 [tert-butyloxycarbonyl (Boc)-Tyr-Phe-1-naphthylamide], 4 (Boc-Tyr-Ile-1-naphthylamide), 5 (Boc-Tyr-Leu-1-naphthylamide) and 6 (Boc-Tyr-Val-1-naphthylamide) containing tyrosine (Tyr) but no carboxyl groups, selectively inhibited the activity of rat pol beta, which is a DNA repair-related pol. Compounds 3-6 strongly inhibited the growth of human colon carcinoma HCT116 p53(+/+) cells. The influence of compounds 1-9 on HCT116 p53(+/+) cell growth was similar to that observed for HCT116 p53(+/+) cells. These results suggest that the cancer cell growth suppression induced by these compounds might be related to their inhibition of pol. Compound 4 was the strongest inhibitor of pol beta and cancer cell growth among the nine compounds tested. This compound specifically inhibited rat pol beta activity, but had no effect on the other 10 mammalian pols investigated. Compound 4 combined with methyl methane sulfonate (MMS) treatment synergistically suppressed HCT116 p53(+/+) cell growth compared with MMS alone. This compound also induced apoptosis in HCT116 cells with or without p53. From these results, the influence of compound 4, a specific pol beta inhibitor, on the relationship between DNA repair and cancer cell growth is discussed. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Guanidiniocarbonylpyrrole-Aryl Derivatives: Structure Tuning for Spectrophotometric Recognition of Specific DNA and RNA Sequences and for Antiproliferative Activity
  作者：Laura Hernandez-Folgado、Domagoj Baretić、Ivo Piantanida、Marko Marjanović、Marijeta Kralj、Thomas Rehm、Carsten Schmuck

  DOI：10.1002/chem.200901999

  日期：2010.3.8

  positive charges present at different pH values. The compounds and their interactions with DNA and RNA were studied by UV/Vis, fluorescence and CD spectroscopy. Antiproliferative activities against human tumour cell lines were also determined. Our studies show that efficient interaction with, for example, DNA requires a significantly large aromatic ring (pyrene) connected through a flexible linker to

  我们对不同的胍基羰基吡咯-芳基衍生物进行了系统的研究，这些衍生物旨在通过将芳香族部分插入核苷酸的碱基堆栈中以及通过胍基羰基吡咯阳离子的凹槽结合来与DNA或RNA相互作用。我们改变了1）芳香环的大小（苯，萘，pyr和a啶），2）连接两个结合基团的接头的长度和柔性，以及3）在不同pH值下存在的正电荷总数。通过UV / Vis，荧光和CD光谱研究了化合物及其与DNA和RNA的相互作用。还确定了对人肿瘤细胞系的抗增殖活性。我们的研究表明，与 DNA需要一个很大的芳香环（py），该芳香环通过柔性接头连接到吡咯部分。但是，正电荷如12，也是必需的。化合物12允许在生理pH值下对ds-DNA进行碱基对选择性识别。这些化合物的抗增殖活性与其对DNA的结合亲和力有关，这表明它们的生物学作用最有可能是由于DNA结合所致。