6-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3,4-dihydro-6H,8H-pyrimido[4,5-c][1,2]oxazin-2-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3,4-dihydro-6H,8H-pyrimido[4,5-c][1,2]oxazin-2-one
• 英文别名: 1H-Pyrimido[4,5-c][1,2]oxazin-7(3H)-one,6-(2-deoxy-b-D-erythro-pentofuranosyl)-4,6-dihydro-；6-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-3,4-dihydro-1H-pyrimido[4,5-c]oxazin-7-one
• 化学式: C₁₁H₁₅N₃O₅
• 分子量: 269.257
• InChiKey: YTWREPAHBKYMNI-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3,4-dihydro-6H,8H-pyrimido[4,5-c][1,2]oxazin-2-one 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 三氯硫磷 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 反应 5.0h， 以50%的产率得到[6-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3,4-dihydro-6H,8H-pyrimido[4,5-c][1,2]oxazin-2-one]-5'-(1-thio)triphosphate
  参考文献：
  名称：

  核苷酸掺入过程中DNA聚合酶对碱基配对的识别：诱变核苷酸dPTP alphaS的特性。

  摘要：

  高度致突变的核苷dP（6-（2-脱氧-β-D-赤-戊呋喃糖基）-3,4-二氢-6H，8H-嘧啶基[4,5-c] [1,2]恶嗪-2-酮）是N4-甲氧基-2'-脱氧胞苷的双环类似物。它以亚氨基和氨基互变异构体的混合物形式存在，基于互变异构常数约10：1。杂环P的双环性质以反构象约束氨基取代基，并允许使用任一种互变异构体进行有效的沃森-克里克碱基配对。已结合使用5'-（1-硫代）三磷酸dPTP alphaS和硫代磷酸酯-DNA来研究DNA聚合酶I的无3'-5'-外切核酸酶的Klenow片段掺入dP的特异性。 DNA产物的特异性测序。

  DOI：

  10.1039/b302011h

文献信息

• Evolved sortases and uses thereof
  申请人：President and Fellows of Harvard College

  公开号：US10202593B2

  公开（公告）日：2019-02-12

  Evolved sortases exhibiting enhanced reaction kinetics and/or altered substrate preferences are provided herein, for example evolved sortases that bind recognitions motifs comprising a LAXT or LPXS sequence. Also provided are methods (e.g., orthogonal transpeptidation and diagnostics methods) for using such sortases. Kits comprising materials, reagents, and cells for carrying out the methods described herein are also provided.

  本文提供的进化分选酶具有增强的反应动力学和/或改变的底物偏好，例如，进化分选酶可结合由 LAXT 或 LPXS 序列组成的识别基团。还提供了使用此类分选酶的方法（如正交转肽和诊断方法）。还提供了包括材料、试剂和细胞的试剂盒，用于实施本文所述的方法。
• COUPLED POLYMERASE CHAIN REACTION-RESTRICTION ENDONUCLEASE DIGESTION-LIGASE DETECTION REACTION PROCESS
  申请人：CORNELL RESEARCH FOUNDATION, INC.

  公开号：EP1165838B1

  公开（公告）日：2006-10-11
• IN VITRO EVOLUTION IN MICROFLUIDIC SYSTEMS
  申请人：Medical Research Council

  公开号：EP1805324B1

  公开（公告）日：2011-10-05
• ENZYMES FOR AMPLIFICATION AND COPYING BISULPHITE MODIFIED NUCLEIC ACIDS
  申请人：Human Genetic Signatures Pty Ltd

  公开号：EP2215250B1

  公开（公告）日：2013-02-27
• In vitro evolution in microfluidic systems
  申请人：Medical Research Council

  公开号：EP2270235B1

  公开（公告）日：2014-10-01