Rhamnosyl tricyclic spinosyn pseudoaglycone | 1310326-19-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酯类和类似物
• 英文名称: Rhamnosyl tricyclic spinosyn pseudoaglycone
• 英文别名: (1S,2E,6S,10S,11R,13E,15S,16R,18R,20S)-6-ethyl-10-hydroxy-11-methyl-18-[(2R,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-5-oxatricyclo[13.7.0.016,20]docosa-2,13,21-triene-4,12-dione
• CAS: 1310326-19-2
• 化学式: C₃₀H₄₄O₉
• 分子量: 548.674
• InChiKey: XLNHRKMLLJUXMU-RFCQDVLTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Rhamnosyl tricyclic spinosyn pseudoaglycone 在 重水 、 recombinant SpnL gene from Saccharopolyspora spinosa 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  多杀菌素 A 生物合成过程中酶催化的 Rauhut-Currier 反应的证据

  摘要：

  已知催化亲核试剂辅助形成 C-C 键的酶目录非常少，目前还没有生物 Rauhut-Currier 反应的明确例子。多刺糖多孢菌中聚酮类杀虫剂多杀菌素 A 的生物合成涉及分别由 SpnF 和 SpnL 催化的 [4 + 2]-环加成和随后的分子内 C-C 键形成。然而，同位素示踪实验和动力学同位素效应暗示 SpnL 催化的反应在没有底物初始去质子化的情况下进行。SpnL 的晶体结构与 SAM 依赖性甲基转移酶以及 SpnF 具有高度相似性。残基 Cys60 也显示存在于 SpnL 活性位点，并且发现 Cys60Ala SpnL 突变体没有活性。此外，SpnL 在 Cys60 处被共价修饰，并且当它与氟化底物类似物共温育时，它被设计为亲核试剂辅助 C-C 键形成的自杀灭活剂。这些结果表明 SpnL 催化了生物 Rauhut-Currier 反应。

  DOI：

  10.1021/jacs.1c09482
• 作为产物：
  描述：

  (3E,5E,7E,10R,12R,13E,17R,18S,22S)-22-ethyl-10,12,18-trihydroxy-17-methyl-1-oxacyclodocosa-3,5,7,13-tetraene-2,16-dione 在 recombinant N-terminally His₆-tagged Saccharopolyspora spinosa SpnF protein 、 recombinant N-terminally His₆-tagged Saccharopolyspora spinosa SpnG protein 、 recombinant N-terminally His₆-tagged Saccharopolyspora spinosa SpnM protein 作用下， 生成 Rhamnosyl tricyclic spinosyn pseudoaglycone
  参考文献：
  名称：

  酶催化的 [4+2] 环加成是多杀菌素 A 生物合成的关键步骤

  摘要：

  Diels-Alder 反应是 [4+2] 环加成反应，其中环己烯环通过单个周环过渡态在 1,3-二烯和缺电子烯烃之间形成。该反应被认为是许多含环己烯次级代谢物生物合成中的关键转化。然而，迄今为止，只有四种纯化的酶涉及与 Diels-Alder 反应一致的生物转化，即茄吡酮合酶、LovB、巨果酸合酶和核黄素合酶。尽管这些反应的立体化学结果表明在每种情况下产物的形成都可以由酶引导，但这些酶通常表现出不止一种催化活性，因此它们对环加成步骤的具体影响尚不确定。在我们对刺糖多孢菌素 A（一种来自刺糖多孢菌的四环聚酮化合物衍生的杀虫剂）生物合成的研究中，我们鉴定了一种环化酶 SpnF，它催化跨环的 [4+2] 环加成以在刺糖多孢菌素 A 中形成环己烯环。动力学分析表明SpnF 以估计 500 倍的速率增强专门加速成环反应。另一种酶 SpnL 也被确定负责最终的交叉桥接步骤，该步骤以与 Rauhut-Currier

  DOI：

  10.1038/nature09981

文献信息

• Evidence for an Enzyme-Catalyzed Rauhut–Currier Reaction during the Biosynthesis of Spinosyn A
  作者：Sei-hyun Choi、Byungsun Jeon、Namho Kim、Hsin-Hui Wu、Tzu-Ping Ko、Mark W. Ruszczycky、Eta A. Isiorho、Yung-nan Liu、Adrian T. Keatinge-Clay、Ming-Daw Tsai、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.1c09482

  日期：2021.12.8

  The catalog of enzymes known to catalyze the nucleophile-assisted formation of C–C bonds is extremely small, and there is presently no definitive example of a biological Rauhut-Currier reaction. Biosynthesis of the polyketide insecticide spinosyn A in Saccharopolyspora spinosa involves a [4 + 2]-cycloaddition and a subsequent intramolecular C–C bond formation catalyzed by SpnF and SpnL, respectively

  已知催化亲核试剂辅助形成 C-C 键的酶目录非常少，目前还没有生物 Rauhut-Currier 反应的明确例子。多刺糖多孢菌中聚酮类杀虫剂多杀菌素 A 的生物合成涉及分别由 SpnF 和 SpnL 催化的 [4 + 2]-环加成和随后的分子内 C-C 键形成。然而，同位素示踪实验和动力学同位素效应暗示 SpnL 催化的反应在没有底物初始去质子化的情况下进行。SpnL 的晶体结构与 SAM 依赖性甲基转移酶以及 SpnF 具有高度相似性。残基 Cys60 也显示存在于 SpnL 活性位点，并且发现 Cys60Ala SpnL 突变体没有活性。此外，SpnL 在 Cys60 处被共价修饰，并且当它与氟化底物类似物共温育时，它被设计为亲核试剂辅助 C-C 键形成的自杀灭活剂。这些结果表明 SpnL 催化了生物 Rauhut-Currier 反应。
• Enzyme-catalysed [4+2] cycloaddition is a key step in the biosynthesis of spinosyn A
  作者：Hak Joong Kim、Mark W. Ruszczycky、Sei-hyun Choi、Yung-nan Liu、Hung-wen Liu

  DOI：10.1038/nature09981

  日期：2011.5

  insecticide from Saccharopolyspora spinosa, we identified a cyclase, SpnF, that catalyses a transannular [4+2] cycloaddition to form the cyclohexene ring in spinosyn A. Kinetic analysis demonstrates that SpnF specifically accelerates the ring formation reaction with an estimated 500-fold rate enhancement. A second enzyme, SpnL, was also identified as responsible for the final cross-bridging step that completes

  Diels-Alder 反应是 [4+2] 环加成反应，其中环己烯环通过单个周环过渡态在 1,3-二烯和缺电子烯烃之间形成。该反应被认为是许多含环己烯次级代谢物生物合成中的关键转化。然而，迄今为止，只有四种纯化的酶涉及与 Diels-Alder 反应一致的生物转化，即茄吡酮合酶、LovB、巨果酸合酶和核黄素合酶。尽管这些反应的立体化学结果表明在每种情况下产物的形成都可以由酶引导，但这些酶通常表现出不止一种催化活性，因此它们对环加成步骤的具体影响尚不确定。在我们对刺糖多孢菌素 A（一种来自刺糖多孢菌的四环聚酮化合物衍生的杀虫剂）生物合成的研究中，我们鉴定了一种环化酶 SpnF，它催化跨环的 [4+2] 环加成以在刺糖多孢菌素 A 中形成环己烯环。动力学分析表明SpnF 以估计 500 倍的速率增强专门加速成环反应。另一种酶 SpnL 也被确定负责最终的交叉桥接步骤，该步骤以与 Rauhut-Currier