(1R)-1-(2-thiophene-2-yl-acetylamino)-2-(3-carboxyphenyl)ethyl-1-boronic acid | 1154426-00-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (1R)-1-(2-thiophene-2-yl-acetylamino)-2-(3-carboxyphenyl)ethyl-1-boronic acid
• 英文别名: boronic acid transition state inhibitor EC04；3-[(2R)-2-borono-2-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]ethyl]benzoic acid
• CAS: 1154426-00-2
• 化学式: C₁₅H₁₆BNO₅S
• 分子量: 333.173
• InChiKey: SHAOGLYXUUWVRD-ZDUSSCGKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.381±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.73
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,2S,3R,5S)-(+)-2,3-蒎烷二醇 、 (1R)-1-(2-thiophene-2-yl-acetylamino)-2-(3-carboxyphenyl)ethyl-1-boronic acid 以 四氢呋喃 为溶剂， 以100%的产率得到3-((R)-2-(2-(thiophen-2-yl)acetamido)-2-((3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methanobenzo[d][1,3,2]dioxaborol-2-yl)ethyl)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  新型硼酸抑制剂的设计和探索揭示了与克拉维酸抗性巯基可变 (SHV) β-内酰胺酶的重要相互作用

  摘要：

  抑制剂耐药 (IR) A 类 β-内酰胺酶对许多当前的抗生素组合构成重大威胁。来自肺炎克雷伯菌的 SHV β-内酰胺酶中的 K234R 取代导致对氨苄西林/克拉维酸的抗性。在 SHV 中对 Lys-234 进行定点饱和诱变后，所得 β-内酰胺酶的微生物学和生化表征表明只有 -Arg 赋予氨苄青霉素/克拉维酸抗性。X 射线晶体学揭示了 SHV K234R 中 Arg-234 和 Ser-130 的两种构象。Ser-130 的运动是观察到的克拉维酸盐抗性的主要原因。设计了一组硼酸抑制剂并针对 SHV-1 和 SHV K234R 进行了测试。发现手性氨苄青霉素类似物具有 2.4 ± 0.2 nM K i适用于 SHV K234R；与 SHV-1 相比，手性氨苄青霉素类似物在 SHV K234R 中形成了更复杂的氢键网络。考虑到 Ser-130 和 Lys-234 的空间位置以及这种氢键网络对于设计针对

  DOI：

  10.1021/jm301490d
• 作为产物：
  描述：

  3-溴苯甲酸叔丁酯 在 2-噻吩乙酸 、 正丁基锂 、 苯甲醚 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (1R)-1-(2-thiophene-2-yl-acetylamino)-2-(3-carboxyphenyl)ethyl-1-boronic acid
  参考文献：
  名称：

  探索铜绿假单胞菌头孢菌素酶中C3 / C4羧酸酯识别的序列要求：洞察AmpCβ-内酰胺酶的可塑性

  摘要：

  在铜绿假单胞菌中，染色体编码的C类头孢菌素酶（AmpCβ-内酰胺酶）通常是导致对β-内酰胺抗生素的高水平耐药性。尽管已经对这些重要的β-内酰胺酶进行了多年的研究，但有关氨基酸序列如何决定AmpC假单胞菌衍生的头孢菌素酶（PDC）功能的知识仍然很少。对结构-功能关系的洞察力对于β-内酰胺和高亲和力抑制剂的设计至关重要。为了了解PDC如何识别β-内酰胺的C 3 / C 4羧酸盐，我们首先检查了铜绿假单胞菌的分子模型AmpCβ-内酰胺酶（PDC-3）与硼酸酯抑制剂配合使用，该硼酸酯抑制剂具有模仿噻唑烷/二氢噻嗪环的侧链和β-内酰胺底物的C 3 / C 4羧酸盐特征。我们接下来测试由我们的模型生成的假说，即，多于一个的氨基酸残基参与识别作为C 3 / C 4 β内酰胺羧酸酯，和工程化丙氨酸三个假定羧酸结合的氨基酸变体。抗菌药敏测试表明，尽管C 3 / C 4取代，PDC-3β-内酰胺酶仍保持较高的

  DOI：

  10.1002/pro.612

文献信息

• [EN] BETA-LACTAMASE INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE BÊTA-LACTAMASES
  申请人：PROTEZ PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2009064413A1

  公开（公告）日：2009-05-22

  Disclosed herein are alpha-aminoboronic acids and their derivatives which act as inhibitors of beta-lactamases. Also disclosed herein are pharmaceutical compositions comprising alpha-aminoboronic acids and methods of use thereof.

  本文揭示了α-氨基硼酸及其衍生物，它们作为β-内酰胺酶的抑制剂。本文还揭示了包含α-氨基硼酸的药物组合物以及其使用方法。
• Exploring sequence requirements for C ₃ /C ₄ carboxylate recognition in the <i>Pseudomonas aeruginosa</i> cephalosporinase: Insights into plasticity of the AmpC β‐lactamase
  作者：Sarah M. Drawz、Magdalena Taracila、Emilia Caselli、Fabio Prati、Robert A. Bonomo

  DOI：10.1002/pro.612

  日期：2011.6

  (AmpC β‐lactamase) is often responsible for high‐level resistance to β‐lactam antibiotics. Despite years of study of these important β‐lactamases, knowledge regarding how amino acid sequence dictates function of the AmpC Pseudomonas‐derived cephalosporinase (PDC) remains scarce. Insights into structure‐function relationships are crucial to the design of both β‐lactams and high‐affinity inhibitors. In

  在铜绿假单胞菌中，染色体编码的C类头孢菌素酶（AmpCβ-内酰胺酶）通常是导致对β-内酰胺抗生素的高水平耐药性。尽管已经对这些重要的β-内酰胺酶进行了多年的研究，但有关氨基酸序列如何决定AmpC假单胞菌衍生的头孢菌素酶（PDC）功能的知识仍然很少。对结构-功能关系的洞察力对于β-内酰胺和高亲和力抑制剂的设计至关重要。为了了解PDC如何识别β-内酰胺的C 3 / C 4羧酸盐，我们首先检查了铜绿假单胞菌的分子模型AmpCβ-内酰胺酶（PDC-3）与硼酸酯抑制剂配合使用，该硼酸酯抑制剂具有模仿噻唑烷/二氢噻嗪环的侧链和β-内酰胺底物的C 3 / C 4羧酸盐特征。我们接下来测试由我们的模型生成的假说，即，多于一个的氨基酸残基参与识别作为C 3 / C 4 β内酰胺羧酸酯，和工程化丙氨酸三个假定羧酸结合的氨基酸变体。抗菌药敏测试表明，尽管C 3 / C 4取代，PDC-3β-内酰胺酶仍保持较高的
• Design and Exploration of Novel Boronic Acid Inhibitors Reveals Important Interactions with a Clavulanic Acid-Resistant Sulfhydryl-Variable (SHV) β-Lactamase
  作者：Marisa L. Winkler、Elizabeth A. Rodkey、Magdalena A. Taracila、Sarah M. Drawz、Christopher R. Bethel、Krisztina M. Papp-Wallace、Kerri M. Smith、Yan Xu、Jeffrey R. Dwulit-Smith、Chiara Romagnoli、Emilia Caselli、Fabio Prati、Focco van den Akker、Robert A. Bonomo

  DOI：10.1021/jm301490d

  日期：2013.2.14

  X-ray crystallography revealed two conformations of Arg-234 and Ser-130 in SHV K234R. The movement of Ser-130 is the principal cause of the observed clavulanate resistance. A panel of boronic acid inhibitors was designed and tested against SHV-1 and SHV K234R. A chiral ampicillin analogue was discovered to have a 2.4 ± 0.2 nM Ki for SHV K234R; the chiral ampicillin analogue formed a more complex hydrogen-bonding

  抑制剂耐药 (IR) A 类 β-内酰胺酶对许多当前的抗生素组合构成重大威胁。来自肺炎克雷伯菌的 SHV β-内酰胺酶中的 K234R 取代导致对氨苄西林/克拉维酸的抗性。在 SHV 中对 Lys-234 进行定点饱和诱变后，所得 β-内酰胺酶的微生物学和生化表征表明只有 -Arg 赋予氨苄青霉素/克拉维酸抗性。X 射线晶体学揭示了 SHV K234R 中 Arg-234 和 Ser-130 的两种构象。Ser-130 的运动是观察到的克拉维酸盐抗性的主要原因。设计了一组硼酸抑制剂并针对 SHV-1 和 SHV K234R 进行了测试。发现手性氨苄青霉素类似物具有 2.4 ± 0.2 nM K i适用于 SHV K234R；与 SHV-1 相比，手性氨苄青霉素类似物在 SHV K234R 中形成了更复杂的氢键网络。考虑到 Ser-130 和 Lys-234 的空间位置以及这种氢键网络对于设计针对