2-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxylic acid | 1235863-08-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxylic acid
• 英文别名: 2-[(4-fluorophenyl)methyl]-5-hydroxy-6-oxo-1H-pyrimidine-4-carboxylic acid
• CAS: 1235863-08-7
• 化学式: C₁₂H₉FN₂O₄
• 分子量: 264.213
• InChiKey: AOEDATHTUPXYIO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.08
• 拓扑面积：
  99
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  methyl 2-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxylate 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 以47%的产率得到2-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  4,5-二羟基嘧啶甲基羧酸盐、羧酸和甲酰胺作为人巨细胞病毒 pUL89 核酸内切酶的抑制剂

  摘要：

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00203

文献信息

• Scaffold rearrangement of dihydroxypyrimidine inhibitors of HIV integrase: Docking model revisited
  作者：Jing Tang、Kasthuraiah Maddali、Yves Pommier、Yuk Y. Sham、Zhengqiang Wang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.04.048

  日期：2010.6

  A series of dihydroxypyrimidine (DHP) derivatives were designed as inhibitors of HIV integrase (IN) based on known homology models. Through chemical synthesis and biochemical assays it was found that the activity profile of these compounds largely deviates from predictions with existing models. With the recently disclosed IN crystal structure of prototype foamy virus (PFV), a new HIV IN homology model was constructed featuring a critical IN/DNA interface previously lacking. With this new model, docking results completely corroborated observed biological activities. This new model should provide a more accurate and improved platform for the design of new inhibitors of HIV IN. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• 4,5-Dihydroxypyrimidine Methyl Carboxylates, Carboxylic Acids, and Carboxamides as Inhibitors of Human Cytomegalovirus pUL89 Endonuclease
  作者：Tianyu He、Tiffany C. Edwards、Jiashu Xie、Hideki Aihara、Robert J. Geraghty、Zhengqiang Wang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c00203

  日期：2022.4.14

  Human cytomegalovirus (HCMV) terminase complex entails a metal-dependent endonuclease at the C-terminus of pUL89 (pUL89-C). We report herein the design, synthesis, and characterization of dihydroxypyrimidine (DHP) acid (14), methyl ester (13), and amide (15) subtypes as inhibitors of HCMV pUL89-C. All analogs synthesized were tested in an endonuclease assay and a thermal shift assay (TSA) and subjected

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14