1-(2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluorocytosine | 2317-79-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluorocytosine
• 英文别名: 5-Fluor-1-<2-desoxy-α,D-ribofuranosyl>-cytosin；1-(2-Deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluorcytosin；1-(α-D-2-Desoxy-ribofuranosyl)-5-fluor-cytosin；4-amino-1-(α-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-5-fluoro-1H-pyrimidin-2-one；4-amino-5-fluoro-1-[(2S,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 2317-79-5
• 化学式: C₉H₁₂FN₃O₄
• 分子量: 245.21
• InChiKey: IDYKCXHJJGMAEV-XVMARJQXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-(3,5-di-O-benzoyl-2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluoro-N4-p-toluoylcytosine 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 15.0h， 以58%的产率得到1-(2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluorocytosine
  参考文献：
  名称：

  合成核苷和核苷酸。二十一 关于2'-脱氧-α-D-核呋喃核糖基核苷和核苷酸的合成和生物学评价。

  摘要：

  将 N4-苯甲酰基-2'-脱氧胞苷（1）转化为其 3'，5'-二-O-乙酸酯（2）。通过与三氟甲磺酸三甲基硅酯（TMS-triflate）反应，化合物 2 顺利异构化成其 α-对应物（3）。3 的皂化反应得到了结晶α-2'-脱氧胞苷（4）。同样，3', 5'-di-O-p-toluoyl-2'-deoxythymidine (5) 被异构化为 α-异构体 (6)，然后脱锁得到 α-2'-deoxythymidine (7)。α-2'-脱氧腺苷（8）和 9-(2-脱氧-α-D-呋喃核糖基)-6-甲基硫嘌呤（9a）是通过 TMS-三late催化反式-2-脱氧核糖基化从化合物 2 分别制备成 N6-苯甲酰基腺嘌呤和 6-甲基硫嘌呤。α-5-氟-2'-脱氧胞苷（11a）及其 β-异构体（11b）是通过 N4-对甲苯甲酰基-5-氟胞嘧啶的三甲基硅烷衍生物与 1-O-乙酰基-3，5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖反应，然后脱锁合成的。在与α-2'-脱氧核苷有关的化合物中，化合物 4 和 11a 对培养中的小鼠白血病 L5178Y 细胞表现出微弱的生长抑制活性。在核苷 5'-三磷酸酯中，α-脱氧 ATP 在以活化 DNA 为模板引物时与 DNA 聚合酶 α 有一定的亲和力；α-脱氧胸苷 5'- 三磷酸酯（TTP）在以聚[rA]-醇溶 dT 为模板引物时对 DNA 聚合酶 β 有显著的抑制作用。

  DOI：

  10.1248/cpb.32.1441

文献信息

• Synthetic nucleosides and nucleotides. XXI. On the synthesis and biological evaluations of 2'-deoxy-.ALPHA.-D-ribofuranosyl nucleosides and nucleotides.
  作者：TOYOFUMI YAMAGUCHI、MINEO SANEYOSHI

  DOI：10.1248/cpb.32.1441

  日期：——

  N4-Benzoyl-2'-deoxycytidine (1) was converted to its 3', 5'-di-O-acetate (2). Compound 2 was smoothly anomerized to its α-counterpart (3) by reaction with trimethylsilyl trifluoromethanesul-fonate (TMS-triflate). Saponification of 3 afforded crystalline α-2'-deoxycytidine (4). Similarly, 3', 5'-di-O-p-toluoyl-2'-deoxythymidine (5) was anomerized to the α-anomer (6), which was then deblocked to give α-2'-deoxythymidine (7). α-2'-Deoxyadenosine (8) and 9-(2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-6-methylthiopurine (9a) were prepared by TMS-triflate-catalyzed trans-2-deoxyribosylation from compound 2 to N6-benzoyladenine and 6-methylthiopurine, respectively. α-5-Fluoro-2'-deoxycytidine (11a) and its β-anomer (11b) were synthesized by the reaction of the trimethylsilyl derivative of N4-p-toluoyl-5-fluorocytosine with 1-O-acetyl-3, 5-di-O-benzoyl-2-deoxy-D-ribofuranose followed by deblocking. Among the compounds related to α-2'-deoxyribonucleosides, compound 4 and 11a showed weak growth-inhibitory activity on mouse leukemic L5178Y cells in culture. Of the nucleoside 5'-triphosphates, α-deoxy ATP had some affinity with DNA polymerase α when activated DNA was used as a template-primer. α-Deoxythymidine 5'-triphosphate (TTP) showed a remarkable inhibitory effect on DNA polymerase β when poly [rA]-oligo dT was used as template-primer.

  将 N4-苯甲酰基-2'-脱氧胞苷（1）转化为其 3'，5'-二-O-乙酸酯（2）。通过与三氟甲磺酸三甲基硅酯（TMS-triflate）反应，化合物 2 顺利异构化成其 α-对应物（3）。3 的皂化反应得到了结晶α-2'-脱氧胞苷（4）。同样，3', 5'-di-O-p-toluoyl-2'-deoxythymidine (5) 被异构化为 α-异构体 (6)，然后脱锁得到 α-2'-deoxythymidine (7)。α-2'-脱氧腺苷（8）和 9-(2-脱氧-α-D-呋喃核糖基)-6-甲基硫嘌呤（9a）是通过 TMS-三late催化反式-2-脱氧核糖基化从化合物 2 分别制备成 N6-苯甲酰基腺嘌呤和 6-甲基硫嘌呤。α-5-氟-2'-脱氧胞苷（11a）及其 β-异构体（11b）是通过 N4-对甲苯甲酰基-5-氟胞嘧啶的三甲基硅烷衍生物与 1-O-乙酰基-3，5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖反应，然后脱锁合成的。在与α-2'-脱氧核苷有关的化合物中，化合物 4 和 11a 对培养中的小鼠白血病 L5178Y 细胞表现出微弱的生长抑制活性。在核苷 5'-三磷酸酯中，α-脱氧 ATP 在以活化 DNA 为模板引物时与 DNA 聚合酶 α 有一定的亲和力；α-脱氧胸苷 5'- 三磷酸酯（TTP）在以聚[rA]-醇溶 dT 为模板引物时对 DNA 聚合酶 β 有显著的抑制作用。