Structure of enzyme-bound substrates: resonance Raman and kinetic evidence for differential enzyme-substrate contacts in N-(Pentafluoro-benzoyl)glycine dithioacyl and thioacyl papain
作者:H. Lee、R.H. Angus、A.C. Storer、P.R. Carey
DOI:10.1016/0022-2860(89)80002-x
日期:1989.12
dithioacyl papain fits the rate-structure correlation whereas the corresponding pentafluorobenzoyl glycine thiol intermediate does not. It is proposed that the difference in the size of the CS compared to the CO group brings about a small change in the dithioacyl papain compared to the thiolacyl papain conformation such that enzyme-substrate contacts involving ortho and meta F atoms in the thiol acyl enzyme
摘要 共振拉曼 (RR) 光谱用于探测底物-酶复合物 N-五氟苯甲酰基) 甘氨酸 (二硫代酰基) 木瓜蛋白酶 (C6F5C(=O) NHCH2C(=S)S-木瓜蛋白酶) 中的底物结构。选择该系统是因为 C6F5 基团的高吸电子能力显着影响 -NH- 部分的电子密度,而这反过来又会改变催化活性。酶-底物复合物的 RR 谱通过参考模型化合物 N-(五氟苯甲酰基)甘氨酸乙基二硫酯 (C6F5(CO))NHCH2C(=S)SC2H5 来解释。该化合物在水性或有机溶剂中的 RR 光谱可以根据 N-酰基甘氨酸二硫酯的已知构象状态来理解。模型与酶-底物 RR 光谱的比较表明,底物结合在称为构象 B 的构象异构体中的活性位点,其特征是小的 NHCH2CS(硫醇)扭转角和 N 与 S(硫醇)的紧密接触. 动力学速率-结构相关性涉及 k3、脱酰的速率常数和 N-to-S(硫醇)相互作用的强度。N-(五氟