5'-O-<3-<(diethoxy)phosphoryl>propyl>uridine | 1053614-47-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-<3-<(diethoxy)phosphoryl>propyl>uridine
• 英文别名: Diethyl (3-(((2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)propyl)phosphonate；1-[(2R,3R,4S,5R)-5-(3-diethoxyphosphorylpropoxymethyl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1053614-47-3
• 化学式: C₁₆H₂₇N₂O₉P
• 分子量: 422.372
• InChiKey: YMNPVOXDLCOZSX-NMFUWQPSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-<3-<(diethoxy)phosphoryl>propyl>uridine 在 sodium hydroxide 、 水 作用下， 以14%的产率得到5'-O-3-<3-<(ethoxy)sodiooxyphosphoryl>propyl>uridine
  参考文献：
  名称：

  Structure–function studies on nucleoside antibiotic mureidomycin A: synthesis of 5′-functionalised uridine models

  摘要：

  功能团在核苷类抗生素mureidomycin A (MRD A)生物活性中的重要性，通过对天然产物样品的衍生化和合成含尿苷类似物进行了研究。已制备N-琥珀酰和二、三乙酰衍生物MRD A，发现它们作为大肠杆菌转位酶I抑制剂的活性降低。MRD A的烯酰胺烯对多种试剂的氢化表现出极强的抗性。从N-3-对甲氧基苯甲基-2′,3′-异丙烯基尿苷合成了几种5′-功能化的尿苷衍生物。制备了一系列5′-氨酰衍生物，其中3-氨基丙酰基（IC50 260 μM）和7-氨基庚酸（IC50 1.5 mM）衍生物被发现作为可逆抑制剂。一种模仿MRD A羧基末端的类似物被合成，并且也作为转位酶I的抑制剂（IC50 1.9 mM）。一种设计为可能自杀抑制剂的磷onate类似物显示出适度抑制（IC50 3.7 mM），且被证明是不可逆的。

  DOI：

  10.1039/a901287g
• 作为产物：
  描述：

  1-(2,3-O-Isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)-3-(4-methoxybenzyl)uracil 在 ammonium cerium(IV) nitrate 、 水 、 sodium hydride 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 30.25h， 生成 5'-O-<3-<(diethoxy)phosphoryl>propyl>uridine
  参考文献：
  名称：

  Structure–function studies on nucleoside antibiotic mureidomycin A: synthesis of 5′-functionalised uridine models

  摘要：

  功能团在核苷类抗生素mureidomycin A (MRD A)生物活性中的重要性，通过对天然产物样品的衍生化和合成含尿苷类似物进行了研究。已制备N-琥珀酰和二、三乙酰衍生物MRD A，发现它们作为大肠杆菌转位酶I抑制剂的活性降低。MRD A的烯酰胺烯对多种试剂的氢化表现出极强的抗性。从N-3-对甲氧基苯甲基-2′,3′-异丙烯基尿苷合成了几种5′-功能化的尿苷衍生物。制备了一系列5′-氨酰衍生物，其中3-氨基丙酰基（IC50 260 μM）和7-氨基庚酸（IC50 1.5 mM）衍生物被发现作为可逆抑制剂。一种模仿MRD A羧基末端的类似物被合成，并且也作为转位酶I的抑制剂（IC50 1.9 mM）。一种设计为可能自杀抑制剂的磷onate类似物显示出适度抑制（IC50 3.7 mM），且被证明是不可逆的。

  DOI：

  10.1039/a901287g

文献信息

• Structure–function studies on nucleoside antibiotic mureidomycin A: synthesis of 5′-functionalised uridine models
  作者：Caragh A Gentle、Stephen A. Harrison、Masatoshi Inukai、Timothy D. H. Bugg

  DOI：10.1039/a901287g

  日期：——

  The importance of functional groups in nucleoside antibiotic mureidomycin A (MRD A) for biological activity has been examined by derivatisation of samples of the natural product, and by synthesis of uridine-containing analogues. N-Succinyl and di- and tri-acetyl derivatives MRD A have been prepared, and were found to have reduced activity as inhibitors of E. coli translocase I. The enamide alkene of MRD A was found to be extremely resistant towards hydrogenation by a variety of reagents. Several 5′-functionalised uridine derivatives were synthesised from N 3-p-methoxybenzyl-2′,3′-isopropylideneuridine. A series of 5′-aminoacyl derivatives were prepared, and the 3-aminopropionyl (IC50 260 µM) and 7-aminoheptanoyl (IC50 1.5 mM) derivatives were found to act as reversible inhibitors. An analogue mimicking the carboxy terminus of MRD A was synthesised, and also acted as an inhibitor of translocase I (IC50 1.9 mM). A phosphonate analogue designed as a possible suicide inhibitor showed modest inhibition (IC50 3.7 mM), which was shown to be irreversible.

  功能团在核苷类抗生素mureidomycin A (MRD A)生物活性中的重要性，通过对天然产物样品的衍生化和合成含尿苷类似物进行了研究。已制备N-琥珀酰和二、三乙酰衍生物MRD A，发现它们作为大肠杆菌转位酶I抑制剂的活性降低。MRD A的烯酰胺烯对多种试剂的氢化表现出极强的抗性。从N-3-对甲氧基苯甲基-2′,3′-异丙烯基尿苷合成了几种5′-功能化的尿苷衍生物。制备了一系列5′-氨酰衍生物，其中3-氨基丙酰基（IC50 260 μM）和7-氨基庚酸（IC50 1.5 mM）衍生物被发现作为可逆抑制剂。一种模仿MRD A羧基末端的类似物被合成，并且也作为转位酶I的抑制剂（IC50 1.9 mM）。一种设计为可能自杀抑制剂的磷onate类似物显示出适度抑制（IC50 3.7 mM），且被证明是不可逆的。