m-PEG24-Mal

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯烷类
• 英文名称: m-PEG24-Mal
• 英文别名: 3-(2,5-dioxopyrrol-1-yl)-N-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]propanamide
• 化学式: C₅₆H₁₀₆N₂O₂₇
• 分子量: 1239.45
• InChiKey: IRQWFNZIEAPTBJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  85
• 可旋转键数：
  75
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  288
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  27

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  m-PEG24-Mal 、 GVGCRG 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 C₇₆H₁₄₃N₁₁O₃₄S
  参考文献：
  名称：

  由单一重组连接酶催化的位点特异性序列蛋白质标记

  摘要：

  具有明确底物特异性的蛋白质连接酶是蛋白质工程的通用工具。反应完成后，目前报道的蛋白质连接酶的产物含有被同一连接酶识别的氨基酸序列，导致连接和水解的重复循环作为竞争反应。因此，以前在不同位置顺序标记蛋白质的努力需要正交特异性的连接酶。重组的 Oldenlandia affinis 天冬酰胺内肽酶 OaAEP1 对于传入的亲核试剂是混杂的。这种混杂使我们能够定义由天然氨基酸组成的亲核试剂，该亲核试剂可以有效地连接到底物上，但产生的产物却很难被 OaAEP1 识别。用有效识别模块修饰的蛋白质可以很容易地进行修饰，以产生带有抗切割基序的确定产物，而含有这种劣等识别基序的蛋白质基本上保持不变。我们证明了通过这种方法可获得的 N 或 C 端蛋白质修饰的多功能性，并以优异的产量以顺序、位点特异性方式修饰了单个底物蛋白质的 N 和 C 端。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b09166

文献信息

• A New Class of Peptidomimetics Targeting the Polo-Box Domain of Polo-Like Kinase 1
  作者：Mija Ahn、Young-Hyun Han、Jung-Eun Park、Sungmin Kim、Woo Cheol Lee、Soo Jae Lee、Pethaiah Gunasekaran、Chaejoon Cheong、Song Yub Shin、Hye-Yeon Kim、Eun Kyung Ryu、Ravichandran N. Murugan、Nam-Hyung Kim、Jeong Kyu Bang

  DOI：10.1021/jm501147g

  日期：2015.1.8

  Recent progress in the development of peptide-derived Polo-like kinase (Plk1) polo-box domain (PBD) inhibitors has led to the synthesis of multiple peptide ligands with high binding affinity and selectivity. However, few systematic analyses have been conducted to identify key Plk1 residues and characterize their interactions with potent Plk1 peptide inhibitors. We performed systematic deletion analysis using the most potent 4j peptide and studied N-terminal capping of the minimal peptide with diverse organic moieties, leading to the identification of the peptidomimetic 8 (AB-103) series with high binding affinity and selectivity. To evaluate the bioavailability of short peptidomimetic ligands, PEGylated 8 series were synthesized and incubated with HeLa cells to test for cellular uptake, antiproliferative activity, and Plk1 kinase inhibition. Finally, crystallographic studies of the Plk1 PBD in complex with peptidomimetics 8 and 22 (AB-103-5) revealed the presence of two hydrogen bond interactions responsible for their high binding affinity and selectivity.