5‐[(2‐methyl‐1H‐benzo[d]imidazol‐1‐yl)methylene]pyrimidine‐2,4,6(1H,3H,5H)‐trione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 5‐[(2‐methyl‐1H‐benzo[d]imidazol‐1‐yl)methylene]pyrimidine‐2,4,6(1H,3H,5H)‐trione
• 英文别名: 5-[(2-Methylbenzimidazol-1-yl)methylidene]-1,3-diazinane-2,4,6-trione
• 化学式: C₁₃H₁₀N₄O₃
• 分子量: 270.247
• InChiKey: NJWCLKGPRFYGOM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.08
• 拓扑面积：
  93.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  邻苯二胺 在 盐酸 作用下， 以 水 、 仲丁醇 为溶剂， 生成 5‐[(2‐methyl‐1H‐benzo[d]imidazol‐1‐yl)methylene]pyrimidine‐2,4,6(1H,3H,5H)‐trione
  参考文献：
  名称：

  新型苯并咪唑连接的（硫代）巴比妥酸盐作为针对白血病的非异羟肟酸盐 HDAC6 抑制剂：设计、合成和构效关系

  摘要：

  基于组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制所需的成熟药效团特征，设计并合成了新型易于制备的苯并咪唑连接的（硫代）巴比妥酸盐衍生物作为 HDAC6 抑制剂。标题化合物的拟议结构基于其光谱数据和元素分析得到确认。新合成的化合物在体外针对 HDAC6 进行了筛选。所有测试的化合物都显示出纳摩尔水平的强效 HDAC6 抑制作用。几种化合物表现出显着的 HDAC6 抑制活性（IC 50  = 48.85–75.62 nM），优于参考药物辛二酰苯胺异羟肟酸（SAHA；IC 50 = 91.73 纳米）。进一步评估了最有效的衍生物对两种人类白血病细胞系的体外抗癌活性。硫代巴比妥酸盐3e对测试细胞的效力是 SAHA 的两倍。还描述了详细的构效关系。此外，分子对接模拟揭示了标题化合物螯合位于 HDAC6 结合口袋内的催化 Zn +2离子的能力。物理化学性质的计算机评价表明，目标化合物在药代动力学方面是有前途的候选者。

  DOI：

  10.1002/ardp.202200433