7-(4-nitrobenzyl)-N²-(pent-4-enoyl)guanosine | 869657-64-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 7-(4-nitrobenzyl)-N²-(pent-4-enoyl)guanosine
• 英文别名: N-[7-[(4-nitrophenyl)methyl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]pent-4-enamide
• CAS: 869657-64-7
• 化学式: C₁₇H₁₆N₆O₄
• 分子量: 368.352
• InChiKey: USNQZZOUFHNBBP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-(4-nitrobenzyl)-N²-(pent-4-enoyl)guanosine 在 sodium dithionite 作用下， 以 phosphate buffer 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 tert-butyl [N²-(pent-4-enoyl)guanin-9-yl]acetate
  参考文献：
  名称：

  A Regioselective Synthesis of Alkyl 2-(Guanin-9-yl)acetates as PNA Building Blocks from 7-(4-Nitrobenzyl)guanine Derivatives

  摘要：

  鸟嘌呤衍生物在N7位置被4-R-苄基基团（R = H，MeO，NO2）取代，已在鸟嘌呤的N9-烷基化中进行评估。鉴于从鸟嘌呤衍生物中（取代的）苄基基团的善变去除和鸟嘌呤盐酸盐的pent-4-烯酰化，已制定了一种改进的替代方法，包括pent-4-烯酰化和guanosine的per-O-乙酰化（8），N7位置的4-硝基苄基化，后接N-糖苷水解（10），N9-烷基化（13）和用亚硫酸钠去保护以得到肽核酸构建块tert-丁基[N2-(pent-4-烯酰)鸟嘌呤-9-基]-乙酸酯（15），总收率为36%。这避免了N7位置异构体的形成，溶解度问题和任何色谱纯化。观察到O-和/或N2-酰基对N-糖苷键的稳定性和2-氨基基团的反应性具有显著影响。通过2D NMR阐明了在碱性介质中由鸟嘌呤盐4d的咪唑环开环产生的嘧啶副产物12的结构。

  DOI：

  10.1135/cccc20050085
• 作为产物：
  描述：

  N²-(pent-4-enoyl)guanosine 在 吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 92.0h， 生成 7-(4-nitrobenzyl)-N²-(pent-4-enoyl)guanosine
  参考文献：
  名称：

  A Regioselective Synthesis of Alkyl 2-(Guanin-9-yl)acetates as PNA Building Blocks from 7-(4-Nitrobenzyl)guanine Derivatives

  摘要：

  鸟嘌呤衍生物在N7位置被4-R-苄基基团（R = H，MeO，NO2）取代，已在鸟嘌呤的N9-烷基化中进行评估。鉴于从鸟嘌呤衍生物中（取代的）苄基基团的善变去除和鸟嘌呤盐酸盐的pent-4-烯酰化，已制定了一种改进的替代方法，包括pent-4-烯酰化和guanosine的per-O-乙酰化（8），N7位置的4-硝基苄基化，后接N-糖苷水解（10），N9-烷基化（13）和用亚硫酸钠去保护以得到肽核酸构建块tert-丁基[N2-(pent-4-烯酰)鸟嘌呤-9-基]-乙酸酯（15），总收率为36%。这避免了N7位置异构体的形成，溶解度问题和任何色谱纯化。观察到O-和/或N2-酰基对N-糖苷键的稳定性和2-氨基基团的反应性具有显著影响。通过2D NMR阐明了在碱性介质中由鸟嘌呤盐4d的咪唑环开环产生的嘧啶副产物12的结构。

  DOI：

  10.1135/cccc20050085

文献信息

• A Regioselective Synthesis of Alkyl 2-(Guanin-9-yl)acetates as PNA Building Blocks from 7-(4-Nitrobenzyl)guanine Derivatives
  作者：Györgyi Ferenc、Péter Forgó、Zoltán Kele、Lajos Kovács

  DOI：10.1135/cccc20050085

  日期：——

  Guanine derivatives substituted at N⁷ with 4-R-benzyl groups (R = H, MeO, NO₂) have been evaluated in the regioselective N⁹-alkylation of guanine. Given the capricious removal of (substituted) benzyl groups from guanine derivatives and pent-4-enoylation of guaninium hydrochloride, an improved alternative approach has been elaborated consisting in the pent-4-enoylation and per-O-acetylation of guanosine (8), 4-nitrobenzylation at N⁷ followed by N-glycoside hydrolysis (10), N⁹-alkylation (13) and deprotection with sodium dithionite to afford the peptide nucleic acid building block tert-butyl [N²-(pent-4-enoyl)guanin-9-yl]- acetate (15) in 36% overall yield. This avoids N⁷ regioisomer formation, solubility problems and any chromatographic purification. A remarkable influence of the O- and/or N²-acyl groups on the stability of N-glycosidic bond and reactivity of 2-amino group was observed. The structure of a pyrimidine by-product 12 arising from the imidazole ring-opening of guaninium salt 4d in alkaline medium has been elucidated by 2D NMR.

  鸟嘌呤衍生物在N7位置被4-R-苄基基团（R = H，MeO，NO2）取代，已在鸟嘌呤的N9-烷基化中进行评估。鉴于从鸟嘌呤衍生物中（取代的）苄基基团的善变去除和鸟嘌呤盐酸盐的pent-4-烯酰化，已制定了一种改进的替代方法，包括pent-4-烯酰化和guanosine的per-O-乙酰化（8），N7位置的4-硝基苄基化，后接N-糖苷水解（10），N9-烷基化（13）和用亚硫酸钠去保护以得到肽核酸构建块tert-丁基[N2-(pent-4-烯酰)鸟嘌呤-9-基]-乙酸酯（15），总收率为36%。这避免了N7位置异构体的形成，溶解度问题和任何色谱纯化。观察到O-和/或N2-酰基对N-糖苷键的稳定性和2-氨基基团的反应性具有显著影响。通过2D NMR阐明了在碱性介质中由鸟嘌呤盐4d的咪唑环开环产生的嘧啶副产物12的结构。