N-(tert-butyl)-2-(N-(4-(tert-butyl)phenyl)-2-hydroxyacetamido)-2-(pyridin-3-yl)acetamide | 1417699-91-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(tert-butyl)-2-(N-(4-(tert-butyl)phenyl)-2-hydroxyacetamido)-2-(pyridin-3-yl)acetamide
• 英文别名: N-tert-butyl-2-(4-tert-butyl-N-(2-hydroxyacetyl)anilino)-2-pyridin-3-ylacetamide
• CAS: 1417699-91-2
• 化学式: C₂₃H₃₁N₃O₃
• 分子量: 397.517
• InChiKey: BQTQYFFQUJIERR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  82.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-吡啶甲醛 、 羟基乙酸 、 异氰酸叔丁酯 、 4-叔丁基苯胺 以 甲醇 为溶剂， 生成 N-(tert-butyl)-2-(N-(4-(tert-butyl)phenyl)-2-hydroxyacetamido)-2-(pyridin-3-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  SARS-CoV-2 主要蛋白酶共价非肽抑制剂的设计、合成、X 射线晶体学和生物活性

  摘要：

  自 2019 年出现以来，高度传染性的 SARS-CoV-2 冠状病毒已感染全球数十亿人，出现类似流感的症状。它已导致数百万人死亡。病毒主要蛋白酶 (Mpro) 对于 SARS-CoV-2 复制至关重要，因此是药物靶点。设计并合成了多个系列的Mpro共价抑制剂。构效关系研究表明，(1) 几种针对 Cys145 的基于氯乙酰胺和环氧化物的化合物是有效的抑制剂，其 IC 50值低至 0.49 μM；(2) Mpro 的 Cys44 对于共价抑制剂设计而言不具有亲核性。高分辨率 X 射线研究揭示了蛋白质与抑制剂的相互作用和抑制机制。有趣的是，Cys145 优先攻击几种环氧化物抑制剂中受阻较多的 C α原子。研究发现氯乙酰胺抑制剂13和环氧化物抑制剂30可抑制细胞 SARS-CoV-2 复制，EC 68 （病毒滴度的半对数降低）分别为 3 和 5 μM。这些化合物代表了抗 SARS-CoV-2 药物开发的新药理学先导化合物。

  DOI：

  10.1021/acsinfecdis.3c00565

文献信息

• Discovery, Synthesis, And Structure-Based Optimization of a Series of <i>N</i>-(<i>tert</i>-Butyl)-2-(<i>N</i>-arylamido)-2-(pyridin-3-yl) Acetamides (ML188) as Potent Noncovalent Small Molecule Inhibitors of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) 3CL Protease
  作者：Jon Jacobs、Valerie Grum-Tokars、Ya Zhou、Mark Turlington、S. Adrian Saldanha、Peter Chase、Aimee Eggler、Eric S. Dawson、Yahira M. Baez-Santos、Sakshi Tomar、Anna M. Mielech、Susan C. Baker、Craig W. Lindsley、Peter Hodder、Andrew Mesecar、Shaun R. Stauffer

  DOI：10.1021/jm301580n

  日期：2013.1.24

  A high-throughput screen of the NIH molecular libraries sample collection and subsequent optimization of a lead dipeptide-like series of severe acute respiratory syndrome (SARS) main protease (3CLpro) inhibitors led to the identification of probe compound ML188 (16-(R), (R)-N-(4-(tert-butyl)phenyl)-N-(2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl)furan-2-carboxamide, Pubchem CID: 46897844). Unlike the majority of reported coronavirus 3CLpro inhibitors that act via covalent modification of the enzyme, 16-(R) is a noncovalent SARS-CoV 3CLpro inhibitor with moderate MW and good enzyme and antiviral inhibitory activity. A multicomponent Ugi reaction was utilized to rapidly explore structure-activity relationships within S-1, S-1, and S-2 enzyme binding pockets. The X-ray structure of SARS-CoV 3CLpro bound with 16-(R) was instrumental in guiding subsequent rounds of chemistry optimization. 16-(R) provides an excellent starting point for the further design and refinement of 3CLpro inhibitors that act by a noncovalent mechanism of action.
• Design, Synthesis, X-ray Crystallography, and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
  作者：Md Ashraf-Uz-Zaman、Teck Khiang Chua、Xin Li、Yuan Yao、Bala Krishna Moku、Chandra Bhushan Mishra、Vasanthi Avadhanula、Pedro A. Piedra、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/acsinfecdis.3c00565

  日期：2024.2.9

  Cys44 of Mpro is not nucleophilic for covalent inhibitor design. High-resolution X-ray studies revealed the protein–inhibitor interactions and mechanisms of inhibition. It is of interest that Cys145 preferably attacks the more hindered Cα atom of several epoxide inhibitors. Chloroacetamide inhibitor 13 and epoxide inhibitor 30 were found to inhibit cellular SARS-CoV-2 replication with an EC68 (half-log

  自 2019 年出现以来，高度传染性的 SARS-CoV-2 冠状病毒已感染全球数十亿人，出现类似流感的症状。它已导致数百万人死亡。病毒主要蛋白酶 (Mpro) 对于 SARS-CoV-2 复制至关重要，因此是药物靶点。设计并合成了多个系列的Mpro共价抑制剂。构效关系研究表明，(1) 几种针对 Cys145 的基于氯乙酰胺和环氧化物的化合物是有效的抑制剂，其 IC 50值低至 0.49 μM；(2) Mpro 的 Cys44 对于共价抑制剂设计而言不具有亲核性。高分辨率 X 射线研究揭示了蛋白质与抑制剂的相互作用和抑制机制。有趣的是，Cys145 优先攻击几种环氧化物抑制剂中受阻较多的 C α原子。研究发现氯乙酰胺抑制剂13和环氧化物抑制剂30可抑制细胞 SARS-CoV-2 复制，EC 68 （病毒滴度的半对数降低）分别为 3 和 5 μM。这些化合物代表了抗 SARS-CoV-2 药物开发的新药理学先导化合物。