methyl 4-formyl-2-thiophenecarboxylate | 67808-68-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩类
• 英文名称: methyl 4-formyl-2-thiophenecarboxylate
• 英文别名: Methyl 4-formylthiophene-2-carboxylate
• CAS: 67808-68-8
• 化学式: C₇H₆O₃S
• mdl: MFCD06803381
• 分子量: 170.189
• InChiKey: ANWBBQDQVAXJJX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.142
• 拓扑面积：
  71.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-formyl-2-thiophenecarboxylate 在 N-甲基吗啉 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 sodium carbonate 、 过碘酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 4-{[N-methyl-(2-amino-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-methylamino]-carbonyl}-thiophene-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  发现酰胺桥联的吡咯并[2,3-d]嘧啶为肿瘤靶向的经典抗叶酸药物，可被叶酸受体α选择性摄取并抑制从头嘌呤核苷酸的生物合成。

  摘要：

  我们以前显示经典6取代吡咯并[2,3- d ]嘧啶抗叶酸结合叶酸受体（FR）α和目标嘌呤生物合成酶甘氨酰胺核糖核苷酸甲酰基转移酶（GARFTase）具有不同的顺式和反式构象。在这项研究中，我们设计了该系列的新型类似物，在桥区域具有酰胺部分，可以同时采用顺式和反式最低能构象。通过将未结合的配体的侧链构象的数目限制为最可能促进与FRα和抗肿瘤活性所需的靶酶结合的那些，提供了熵的好处。活性最高的化合物7的NMR均显示顺式和反式酰胺桥构象的比率约为1：1。FRα和GARFTase晶体结构中最佳对接姿势为7的桥酰胺基采用顺式和反式构象，Maestro预测的最低能量构象均通过1 kcal / mol的NMR证实。与非限制性亲本类似物1相比，化合物7对FRα表达细胞的抑制作用提高了约3倍，并且被FRα选择性地内在化了还原叶酸载体（RFC），从而对表达FRα的KB人具有显着的体外抗肿瘤活性肿瘤细胞。抗肿瘤

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.115125
• 作为产物：
  描述：

  2-噻吩羧酸,4-甲酰基- 、 甲醇 生成 methyl 4-formyl-2-thiophenecarboxylate
  参考文献：
  名称：

  SATONAKA, HAJIME, BULL. CHEM. SOC. JAP., 1983, 56, N 8, 2463-2468

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Structural basis for potent inhibition of d-amino acid oxidase by thiophene carboxylic acids
  作者：Yusuke Kato、Niyada Hin、Nobuo Maita、Ajit G. Thomas、Sumire Kurosawa、Camilo Rojas、Kazuko Yorita、Barbara S. Slusher、Kiyoshi Fukui、Takashi Tsukamoto

  DOI：10.1016/j.ejmech.2018.09.040

  日期：2018.11

  thiophene-2-carboxylic acids and thiophene-3-carboxylic acids were identified as a new class of DAO inhibitors. Structure-activity relationship (SAR) studies revealed that small substituents are well-tolerated on the thiophene ring of both the 2-carboxylic acid and 3-carboxylic acid scaffolds. Crystal structures of human DAO in complex with potent thiophene carboxylic acids revealed that Tyr224 was

  一系列噻吩-2-羧酸和噻吩-3-羧酸被确定为一类新的 DAO 抑制剂。构效关系（SAR）研究表明，2-羧酸和3-羧酸支架的噻吩环上的小取代基具有良好的耐受性。人 DAO 与强效噻吩羧酸复合物的晶体结构表明，Tyr224 与抑制剂的噻吩环紧密堆叠，导致其他 DAO 抑制剂观察到的二级口袋消失。复合物的分子动力学模拟表明，无论 Tyr224 在模拟的初始状态下是否堆叠，Tyr224 都更喜欢堆叠构象。MM/GBSA 表明 Tyr244 和基于噻吩的抑制剂之间存在显着的疏水相互作用。此外，活性位点通过广泛的氢键网络紧密封闭，其中包括堆叠构象中来自 Tyr224 的氢键网络。在噻吩环中引入大的支化侧链显着降低了效力。这些结果与其他 DAO 抑制剂形成鲜明对比，其他 DAO 抑制剂可以通过由于 Tyr224 重新定位而延伸至二级口袋的分支侧链来获得效力。这些见解对于未来利用新型支架优化 DAO 抑制剂的努力尤其重要。
• Design of Drug Efficacy Guided by Free Energy Simulations of the β2‐Adrenoceptor
  作者：Nicolas Panel、Duc Duy Vo、Nour Aldin Kahlous、Harald Hübner、Stephanie Tiedt、Pierre Matricon、Jody Pacalon、Oliver Fleetwood、Stefanie Kampen、Andreas Luttens、Lucie Delemotte、Jan Kihlberg、Peter Gmeiner、Jens Carlsson

  DOI：10.1002/anie.202218959

  日期：——

  G-protein-coupled receptors (GPCRs) are important therapeutic targets and numerous approved drugs act by either stimulating or blocking receptor activation. However, the design of ligands that modulate GPCR signaling is challenging. We demonstrate that molecular simulations of GPCRs can be used to predict ligand efficacy and identify potent β2-adrenoceptor agonists.

  G 蛋白偶联受体 (GPCR) 是重要的治疗靶标，许多已获批准的药物通过刺激或阻断受体激活来发挥作用。然而，调节 GPCR 信号的配体设计具有挑战性。我们证明 GPCR 的分子模拟可用于预测配体功效并鉴定有效的 β 2 -肾上腺素能受体激动剂。
• Discovery of amide-bridged pyrrolo[2,3-d]pyrimidines as tumor targeted classical antifolates with selective uptake by folate receptor α and inhibition of de novo purine nucleotide biosynthesis
  作者：Weiguo Xiang、Aamod Dekhne、Arpit Doshi、Carrie O'Connor、Zhanjun Hou、Larry H. Matherly、Aleem Gangjee

  DOI：10.1016/j.bmc.2019.115125

  日期：2019.12

  targets. GARFTase inhibition by compound 7 was confirmed by an in situ cell-based activity assay. Our results identify a “first-in-class” classical antifolate with a novel amide linkage between the scaffold and the side chain aryl L-glutamate that affords exclusive selectivity for transport via FRα over RFC and antitumor activity resulting from inhibition of GARFTase and likely AICARFTase. Compound 7 offers

  我们以前显示经典6取代吡咯并[2,3- d ]嘧啶抗叶酸结合叶酸受体（FR）α和目标嘌呤生物合成酶甘氨酰胺核糖核苷酸甲酰基转移酶（GARFTase）具有不同的顺式和反式构象。在这项研究中，我们设计了该系列的新型类似物，在桥区域具有酰胺部分，可以同时采用顺式和反式最低能构象。通过将未结合的配体的侧链构象的数目限制为最可能促进与FRα和抗肿瘤活性所需的靶酶结合的那些，提供了熵的好处。活性最高的化合物7的NMR均显示顺式和反式酰胺桥构象的比率约为1：1。FRα和GARFTase晶体结构中最佳对接姿势为7的桥酰胺基采用顺式和反式构象，Maestro预测的最低能量构象均通过1 kcal / mol的NMR证实。与非限制性亲本类似物1相比，化合物7对FRα表达细胞的抑制作用提高了约3倍，并且被FRα选择性地内在化了还原叶酸载体（RFC），从而对表达FRα的KB人具有显着的体外抗肿瘤活性肿瘤细胞。抗肿瘤
• SATONAKA, HAJIME, BULL. CHEM. SOC. JAP., 1983, 56, N 8, 2463-2468
  作者：SATONAKA, HAJIME

  DOI：——

  日期：——