Alexa⁵⁶⁸-N-hydroxysuccinimide ester | 1127247-31-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: Alexa⁵⁶⁸-N-hydroxysuccinimide ester
• 英文别名: Alexa Fluor 568 para-isomer；4-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonyl-2-[7,7,19,19-tetramethyl-9,17-bis(sulfomethyl)-2-oxa-6,20-diazapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,8,10,12,15,17,21-nonaen-13-yl]benzoic acid
• CAS: 1127247-31-7
• 化学式: C₃₇H₃₃N₃O₁₃S₂
• 分子量: 791.813
• InChiKey: KBWNZHUGGRDAEA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  260
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Alexa⁵⁶⁸-N-hydroxysuccinimide ester 、 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以67 %的产率得到4-((3-(N-(3-(((2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl)carbamoyl)-5-(((R)-1-phenylethyl)carbamoyl)phenyl)-N-methylsulfamoyl)propyl)carbamoyl)-2-(1,2,2,10,10,11-hexamethyl-4,8-bis(sulfomethyl)-3,4,8,9,10,11-hexahydro-2H-pyrano[3,2-g:5,6-g']diquinolin-1-ium-6-yl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  多色、细胞不可渗透的高亲和力 BACE1 抑制剂探针可实现卓越的单分子内源染色和成像

  摘要：

  流行但并非无可争议的淀粉样蛋白级联假说将 APP 裂解酶 1 (BACE1) 的 β 位点置于阿尔茨海默病发病机制的中心位置。在这里，我们使用新颖的无标签和无抗体标记工具研究了 BACE1 的功能特性，这些工具是与不同的不可渗透的 Alexa Fluor 染料连接的 BACE1 抑制剂 IV（也称为 C3）的缀合物。我们证明这些荧光小分子与 BACE1 特异性结合，在其正构位点具有 1:1 的标记化学计量。这是一个至关重要的特性，特别是对于单分子和超分辨率显微镜方法来说，可以表征染料在过表达细胞系统和天然神经元组织中的标记能力。有了多种颜色，我们通过福斯特共振能量转移 (FRET) 受体光漂白和天然 BACE1 的单粒子成像来评估 BACE1 多聚化。总之，我们的新型荧光抑制剂（称为Alexa-C3 ）为 BACE1 的蛋白质相互作用和扩散行为提供了前所未有的见解，直至单分子水平。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.4c00339

文献信息

• Benzodiazepine ligands can act as allosteric modulators of the Type 1 cholecystokinin receptor
  作者：Fan Gao、Patrick M. Sexton、Arthur Christopoulos、Laurence J. Miller

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.06.053

  日期：2008.8

  The cholecystokinin (CCK(1)) receptor is a G protein-coupled receptor important for nutrient homeostasis. The molecular basis of CCK-receptor binding has been debated, with one prominent model suggesting occupation of the same region of the intramembranous helical bundle as benzodiazepines. Here, we used a specific assay of allosteric ligand interaction to probe the mode of binding of devazepide, a

  胆囊收缩素 (CCK(1)) 受体是一种对营养稳态很重要的 G 蛋白偶联受体。CCK 受体结合的分子基础一直存在争议，一个突出的模型表明与苯二氮卓类药物占据膜内螺旋束的同一区域。在这里，我们使用变构配体相互作用的特定测定来探测 devazepide（一种原型苯二氮卓配体）的结合模式。Devazepide 引起预结合 CCK 解离的显着减慢，只有通过与地形不同的变构位点结合才有可能。这种作用被苯二氮卓结合口袋中的半胱氨酸的化学修饰破坏了。将变构模型应用于一系列苯二氮卓配体和 CCK 之间的平衡相互作用，产生了每个调节剂的定量估计 s 对变构位点的亲和力，以及被占据的正构位点和变构位点之间相互作用的负协同程度。苯二氮卓类与 CCK(1) 受体结合的变构性质为小分子药物开发提供了新的机会。
• 芳基化偶联剂、荧光染料偶联物及相关应用
  申请人：北京大学

  公开号：CN116768816A

  公开（公告）日：2023-09-19

  本发明提供了一种芳基化偶联剂、荧光染料偶联物及相关应用。该芳基化偶联剂具有如下结构式：#imgabs0#R1为H或氨基的保护基；R2选自烷基；R3选自取代或未取代的亚芳基、亚烷基、杂亚烷基或杂亚环烯基，当R3含有取代基时，取代基位于亚芳基、亚烷基或杂亚环烯基的任意可取代的位置，取代基选自含或不含杂原子的C1～C6的烷基、卤素、氨基及硝基中的任意一种或多种，杂亚环烯基或含有杂原子的C1～C6的烷基中的杂原子各自独立地选自O、S或N，杂原子位于任意一个碳原子的位置；X为F或Cl。在相同条件下，此类芳基化偶联剂与染料偶联反应速度快，且形成的产物比马来酰亚胺的反应产物更为稳定。