3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N⁴-isobutyryl cytidine | 402518-20-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N⁴-isobutyryl cytidine
• 英文别名: N-[1-[(6aR,8R,9S,9aS)-9-methyl-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 402518-20-1
• 化学式: C₂₆H₄₇N₃O₆Si₂
• 分子量: 553.847
• InChiKey: YKQWTNYIIPABLC-PLRSXRBSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.33
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  98.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N⁴-isobutyryl cytidine 在 四丁基氟化铵 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 生成 5'-O-dimethoxytrityl-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N⁴-isobutyrylcytidine
  参考文献：
  名称：

  合成与性能（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基寡核苷酸

  摘要：

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)00745-1
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-4-O-(2-nitrophenyl) uridine 在 氨 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 98.0h， 生成 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-(2'S)-2'-deoxy-2'-C-methyl-N⁴-isobutyryl cytidine
  参考文献：
  名称：

  合成与性能（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基寡核苷酸

  摘要：

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)00745-1

文献信息

• Synthesis and properties of (2′S)- and (2′R)-2′-deoxy-2′-C-methyl oligonucleotides
  作者：Daniel O Cicero、Mariana Gallo、Philippe J Neuner、Adolfo M Iribarren

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)00745-1

  日期：2001.9

  The synthesis of (2′S)- and (2′R)-2′-deoxy-2′-C-methyl-N3-(4-t-butylbenzoyl) uridine, (2′S)-2′-deoxy-2′-C-methyluridine and (2′S)-2′-deoxy-2′-C-methyl-N4-isobutyryl cytidine building blocks are here described. The preparation of oligonucleotides carrying these monomers in all positions but 3′-end is presented and the binding affinity between these new fragments and the complementary DNA and RNA sequences

  的合成（2'小号） -和（2' - [R）-2'-脱氧-2'- Ç甲基Ñ 3 - （4-吨-butylbenzoyl）尿苷，（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç -methyluridine和（2'小号）-2'-脱氧-2'- ç甲基ñ 4异丁酰基胞苷积木在这里描述。提出了在所有位置但3'-端均携带这些单体的寡核苷酸的制备方法，并评估了这些新片段与互补DNA和RNA序列之间的结合亲和力。（2′R）取代的寡核苷酸既不与互补的DNA序列又不与RNA序列杂交。然而，含有（2 'S）修饰的寡核苷酸的杂交体的解链曲线的一阶导数表示解链转变。