摘要:
自噬相关蛋白 (Atgs) 驱动溶酶体介导的降解途径,即自噬,以清除功能失调的细胞成分并维持体内平衡。在人类中,这个过程是由包含 LC3 和 GABARAP 亚家族的哺乳动物 Atg8 (mAtg8) 蛋白家族驱动的。mAtg8 蛋白在自噬体的形成和成熟以及通过与靶蛋白内保守的 LC3 相互作用区 (LIR) 序列结合来捕获特定货物方面发挥重要作用。通过小分子配体调节 mAtg8 与其靶蛋白的相互作用将使进一步研究其功能成为可能。在这里,我们描述了用于发现 LC3 小分子配体的无偏片段和 DNA 编码库 (DEL) 筛选方法。这两种策略都会产生与 LC3 结合的化合物,片段命中有利于 mATG8 蛋白中的保守疏水口袋,如 LC3A 片段复合晶体结构所详述。我们的研究结果表明,可延展的 LIR 结合表面可以很容易地成为碎片的目标;然而,事实证明,合理设计额外的交互以增加亲和力具有挑战性。DEL