紫红霉酮 | 21288-60-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 并四苯
• 中文名称: 紫红霉酮
• 英文名称: ε-rhodomycinone
• 英文别名: ε-Rhodomycinon；Epsilon-rhodomycinone；methyl (1R,2R,4S)-2-ethyl-2,4,5,7,12-pentahydroxy-6,11-dioxo-3,4-dihydro-1H-tetracene-1-carboxylate
• CAS: 21288-60-8
• 化学式: C₂₂H₂₀O₉
• 分子量: 428.395
• InChiKey: PYFOXRACBORDCT-GOSXWKPOSA-N

物化性质

• 熔点：
  185 °C
• 沸点：
  606.8±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.593±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  162
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  紫红霉酮 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 8.0h， 以89%的产率得到ζ-rhodomycinone
  参考文献：
  名称：

  8-Hydroxyanthracyclinones from .epsilon.-rhodomycinone

  摘要：

  epsilon-Rhodomycinone was converted into 8,9-dehydro-zeta-rhodomycinone, which gave a cis diol with osmium tetroxide and a pair of epimeric epoxides with m-chloroperbenzoic acid. Acid-catalyzed opening of the epoxides gave the corresponding trans diols. In contrast, acid treatment of the trimethyl ethers of these epoxides gave predominantly a lactone and an eta-rhodomycinone derivative, with only small amounts of the diols. None of the new rhodomycinones were active against Bacillus subtilis, but 8,9-dehydro-zeta-rhodomycinone was active in the induction of lytic phage in Escherichia coli.

  DOI：

  10.1021/jm00185a020
• 作为产物：
  描述：

  阿克拉菌酮 在 DnrF recombinant 11-hydroxylase 作用下， 生成 紫红霉酮
  参考文献：
  名称：

  蒽环酮 C-H 功能化的多种组合生物合成策略

  摘要：

  链霉菌属是“大自然的抗生素工厂”，可生产有价值的生物活性代谢物，例如细胞毒性蒽环类聚酮化合物。虽然蒽环类药物有数百种天然和化学合成的类似物，但大部分化学多样性源于对糖链的酶促修饰，以及在较小程度上源于对核心支架的改变。之前的工作已经在天蓝色链霉菌M1152Δ matAB中生成了 BioBricks 合成生物学工具箱，可以产生阿克拉维酮、9-表-阿克拉维酮、金霉素酮和诺加霉素酮。在这项工作中，我们扩展了平台，通过两种关键策略生成氧化修饰类似物。 (i) 我们将聚酮合酶 (PKS) 盒中光神霉素生物合成途径中的芳香酶环化酶替换为酮还原酶和一环环化酶，以生成 2-羟基化类似物。 (ii)接下来，我们设计了几种多加氧酶盒来催化11-羟基化、1-羟基化、10-羟基化、10-脱羧和4-羟基区域异构化。我们还开发了改进的质粒载体和S. coelicolor M1152Δ matAB表达宿主来生产蒽环类化

  DOI：

  10.1021/acssynbio.4c00043

文献信息

• The synthesis of daunosaminyl ε-rhodomycinone, daunosaminyl 10-epi-ε-rhodomycinone, daunosaminyl ε-pyrromycinone, and 10-descarbomethoxy-ε-pyrromycin
  作者：John M. Essery、Terrence W. Doyle

  DOI：10.1139/v80-295

  日期：1980.9.1

  The epimerisation at C10 of ε-rhodomycinone by aqueous alkali treatment of its 6,7-acetonide is described. Daunosaminyl ε-rhodomycinone and daunosaminyl 10-epi-ε-rhodomycinone were prepared and compared with regard to their antibacterial properties. Daunosaminyl ε-pyrromycinone and 10-descarbomethoxy-ε-pyrromycin were synthesized and their antitumor properties were compared with some naturally occurring glycosides of ε-pyrromycinone.

  通过对6,7-缩醛衍生物进行水性碱处理，描述了ε-罗多霉素酮C10的顺式异构化。制备了达诺霉胺基ε-罗多霉素酮和达诺霉胺基10-顺式异构体ε-罗多霉素酮，并比较了它们的抗菌性能。合成了达诺霉胺基ε-吡啶霉素酮和10-脱羧甲氧基-ε-吡啶霉素，并将它们的抗肿瘤性能与一些天然产生的ε-吡啶霉素酮糖苷进行了比较。
• Streptomyces peucetius daunorubicin biosynthesis gene, dnrF: sequence and heterologous expression
  作者：S. Filippini、M. M. Solinas、U. Breme、M. B. Schluter、D. Gabellini、G. Biamonti、A. L. Colombo、L. Garofano

  DOI：10.1099/13500872-141-4-1007

  日期：1995.4.1

  The dnrF gene, responsible for conversion of aklavinone to ɛ-rhodomycinone via C-11 hydroxylation, was mapped in the daunorubicin (Dnr) gene cluster of Streptomyces peucetius ATCC 29050, close to drrAB, one of the anthracycline-resistance genes. The dnrF gene was sequenced and should encode a protein of 489 amino acids with a molecular mass of 52 kDa. The deduced DnrF protein shows significant similarities with bacterial FAD- and NADPH-dependent hydroxylases either required to introduce hydroxyl groups into polycyclic aromatic polyketide antibiotics or involved in catabolism of aromatic compounds. Heterologous expression of dnrF in Streptomyces lividans TK23 and in Escherichia coli demonstrated that the gene encodes a NADPH-dependent hydroxylase catalysing the hydroxylation of aklavinone to yield ɛ-rhodomycinone. The enzyme is inactive on anthracyclines glycosylated at position C-7 and its activity decreases to a different extent with other substrate modifications, indicating that DnrF has a significant substrate specificity.

  dnrF基因负责通过C-11羟基化将阿克拉维酮转化为ɛ-罗多霉素酮，该基因位于链霉菌peucetius ATCC 29050的柔红霉素（Dnr）基因簇中，靠近drrAB，后者是蒽环类抗生素抗性基因之一。dnrF基因已测序，应编码一种489个氨基酸的蛋白质，分子质量为52 kDa。推导出的DnrF蛋白与细菌FAD和NADPH依赖性羟化酶有显著相似性，这些酶要么将羟基引入多环芳族多酮抗生素，要么参与芳香族化合物的分解代谢。在链霉菌lividans TK23和大肠杆菌中异源表达dnrF表明，该基因编码一种NADPH依赖性羟化酶，催化阿克拉维酮的羟基化反应，生成ɛ-罗多霉素酮。该酶对C-7位糖基化的蒽环类抗生素不活跃，其活性随着其他底物修饰的不同而降低，表明DnrF具有显著的底物特异性。
• A two-plasmid system for the glycosylation of polyketide antibiotics: bioconversion of ε-rhodomycinone to rhodomycin D
  作者：Carlos Olano、Natalia Lomovskaya、Leonid Fonstein、Jon T Roll、C Richard Hutchinson

  DOI：10.1016/s1074-5521(00)80004-6

  日期：1999.12

  genes for deoxysugar biosynthesis that are now available. RESULTS Production of thymidine diphospho (TDP)-L-daunosamine (dnm), the aminodeoxysugar present in the anthracycline antitumor drugs daunorubicin (DNR) and doxorubicin (DXR), and its attachment to epsilon-rhodomycinone to generate rhodomycin D has been achieved by bioconversion with a strain of Streptomyces lividans that bears two plasmids.

  背景技术许多微生物产品的生物活性需要存在附接到阿昔洛酮的一种或多种脱氧糖分子。这在聚酮化合物中尤其普遍，并且是抗肿瘤蒽环类抗生素是狂热的DNA结合药物的重要原因。在体内制备不同的脱氧氨基糖并将其连接至相同或不同糖苷配基的能力将促进新蒽环类化合物的合成和对抗肿瘤药物的追求。使用现在可用的用于脱氧糖生物合成的众多细菌基因，这是可行的。结果胸苷二磷酸（TDP）-L-柔红胺（dnm）的生产，蒽环类抗肿瘤药柔红霉素（DNR）和阿霉素（DXR）中存在的氨基脱氧糖，并通过带有两个质粒的淡紫色链霉菌菌株的生物转化已经实现了其与ε-溶菌素的结合并产生罗丹霉素D。其中一个包含链霉菌dnmJVUZTQS基因和dnmW（以前称为dpsH，被认为是聚酮化合物环化酶基因），dnrH（不是形成红球菌D所必需的）和dnrI（表达dnm和drr所需的调控基因）。基因。另一个质粒具有编码葡萄糖-1-磷酸胸腺嘧啶基转移酶和TDP-葡萄糖-4
• Cloning and characterization of the Streptomyces peucetius dnrQS genes encoding a daunosamine biosynthesis enzyme and a glycosyl transferase involved in daunorubicin biosynthesis
  作者：S L Otten、X Liu、J Ferguson、C R Hutchinson

  DOI：10.1128/jb.177.22.6688-6692.1995

  日期：1995.11

  The dnrQS genes from the daunorubicin producer Streptomyces peucetius were characterized by DNA sequencing, complementation analysis, and gene disruption. The dnrQ gene is required for daunosamine biosynthesis, and dnrS appears to encode a glycosyltransferase for the addition of the 2,3,6-trideoxy-3-aminohexose, daunosamine, to epsilon-rhodomycinone.

  来自多柔比星生产菌株链霉菌Peucetius的dnrQS基因通过DNA测序、互补分析和基因破坏进行了表征。dnrQ基因对多柔比星胺的生物合成至关重要，而dnrS则编码一种糖基转移酶，用于将2,3,6-三去氧-3-氨基己糖（多柔比星胺）添加到ε-紫罗兰霉素酮上。
• Re-Exploring the Anthracycline Chemical Space for Better Anti-Cancer Compounds
  作者：Merle A. van Gelder、Sabina Y. van der Zanden、Merijn B. L. Vriends、Roos A. Wagensveld、Gijsbert A. van der Marel、Jeroen D. C. Codée、Herman S. Overkleeft、Dennis P. A. Wander、Jacques J. C. Neefjes

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c00853

  日期：2023.8.24

  capacity to induce DNA- and chromatin damage. This coherent set of data allowed us to deduce a few guidelines on anthracycline design, as well as discover novel, highly potent anthracyclines that may be better tolerated by patients.

  蒽环类抗癌药物在临床上广泛用于治疗多种癌症。它们会产生 DNA 双链断裂，但最近引入染色质损伤的诱导作为抗癌活性的另一个主要决定因素。这两个事件的结合导致了所报告的副作用。虽然我们对蒽环类药物的结构-活性关系的了解有所提高，但许多结构变异仍然没有得到很好的探索。因此，我们在此报告了一组不同的蒽环类药物的制备方法，这些蒽环类药物在糖部分、胺烷基化模式、糖链和糖苷配基方面存在差异。我们评估了相关人类癌细胞系的体外细胞毒性，以及诱导 DNA 和染色质损伤的能力。这组连贯的数据使我们能够推断出一些关于蒽环类药物设计的指南，并发现患者可能更好耐受的新型高效蒽环类药物。