O-(N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidin-5'-yl)-O-{N2-isobutyryl-2'-O-methyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)guanosin-3'-yl} hydrogenphosphonate diester | 1242897-94-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: O-(N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidin-5'-yl)-O-{N2-isobutyryl-2'-O-methyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)guanosin-3'-yl} hydrogenphosphonate diester
• CAS: 1242897-94-4
• 化学式: C₆₃H₈₃N₈O₁₅P
• 分子量: 1223.37
• InChiKey: YHHXMQGIKOISSN-IWDAPLKTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.34
• 重原子数：
  87.0
• 可旋转键数：
  34.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  273.87
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  20.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[3-(tert-butoxycarbonylamino)propyl]diethyl malonate trifluoroacetic acid salt 、 O-(N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidin-5'-yl)-O-{N2-isobutyryl-2'-O-methyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)guanosin-3'-yl} hydrogenphosphonate diester 在 吡啶 、 四氯化碳 、 三乙胺 作用下， 反应 1.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧氨基磷酸二核苷作为丙型肝炎病毒亚基因组复制子和 NS5B 聚合酶活性的改进抑制剂

  摘要：

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。

  DOI：

  10.1021/jm100102v
• 作为产物：
  描述：

  N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidine-5'-yl hydrogenphosphonate triethylammonium salt 、 N-(9-((2r,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺 在 吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以80%的产率得到O-(N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidin-5'-yl)-O-{N2-isobutyryl-2'-O-methyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)guanosin-3'-yl} hydrogenphosphonate diester
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧氨基磷酸二核苷作为丙型肝炎病毒亚基因组复制子和 NS5B 聚合酶活性的改进抑制剂

  摘要：

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。

  DOI：

  10.1021/jm100102v