[(2R,3S,5R)-5-[4-[4-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl(methyl)amino]butanoylamino]-2-oxopyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate | 1064690-36-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: [(2R,3S,5R)-5-[4-[4-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl(methyl)amino]butanoylamino]-2-oxopyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
• CAS: 1064690-36-3
• 化学式: C₃₄H₃₈N₄O₉
• 分子量: 646.697
• InChiKey: SZHORPRSGQXDRV-WTNLLYQRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  164
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,5R)-5-[4-[4-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl(methyl)amino]butanoylamino]-2-oxopyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate 、 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[[4-[[3-[[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]amino]-3-oxopropyl]carbamoyl]phenyl]methyl]carbamate 在 四氮唑 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid synthesizing dimer amidite and nucleic acid synthesizing method

  摘要：

  提供一种优质的二聚体酰胺，可进行纯化，最好是其保护基在温和条件下可被去除，并提供一种使用该二聚体酰胺合成核酸的方法，所述二聚体酰胺具有以下一般式（1）所代表的结构，以及包括对二聚体酰胺进行缩合反应的核酸合成方法： 在一般式（1）中，R1和R2分别独立地代表从一般式（2）到（4）和结构式（12）到（15）中选择的任一组，并且排除R1和R2分别代表结构式（12）的化合物： 并且在一般式（2）到（4）中，R3代表以下结构式（16）到（25）中所代表的任一组：

  公开号：

  US08889843B2

文献信息

• FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD
  申请人：Fujihara Tsuyoshi

  公开号：US20130017973A1

  公开（公告）日：2013-01-17

  To provide a functional molecule including a modified nucleotide unit having a substituent introduced to a base thereof, wherein the substituent is removably introduced to the base; a functional molecule synthesizing amidite that has a substituent removably introduced to its base and that is used for the manufacture of the functional molecule; and a target substance analysis method including: preparing a random pool of functional molecules using a functional molecule synthesizing amidite; screening a functional molecule having affinity for a target substance from the random pool; amplifying the functional molecules having affinity for the target substance, wherein the method further comprises, prior to the amplification step, removing a substituent from the functional molecule having affinity for the target substance.

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。
• US8288516B2
  申请人：——

  公开号：US8288516B2

  公开（公告）日：2012-10-16