[5-(6-benzoylthiohex-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)urid-3'-O-yl]-O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite | 1342885-29-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: [5-(6-benzoylthiohex-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)urid-3'-O-yl]-O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite
• CAS: 1342885-29-3
• 化学式: C₅₂H₅₉N₄O₉PS
• 分子量: 947.102
• InChiKey: ASDMFOALMAZKEU-PQZGNOOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.61
• 重原子数：
  67.0
• 可旋转键数：
  22.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  154.34
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-5-(6-hydroxyhex-1-ynyl)uridine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 氟化氢吡啶 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 39.0h， 生成 [5-(6-benzoylthiohex-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)urid-3'-O-yl]-O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  链内锁增加了双链体的稳定性和碱基配对的选择性。

  摘要：

  在相邻核苷碱基之间具有二硫键的寡脱氧核苷酸探针显示，RNA双链的双链体的熔点升高，最高可达7.6摄氏度。通过自动合成，弱配对的TT二聚体被锁定的2'-脱氧-5-（硫代炔基）尿苷残基取代。

  DOI：

  10.1039/c1cc14008f