1-(3-amino-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine | 108630-07-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(3-amino-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine
• 英文别名: 3'-amino-5-methyl-3'-deoxy-uridine；3'-Amino-5-methyl-3'-desoxy-uridin；1-[(2R,3R,4S,5S)-4-amino-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 108630-07-5
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₅
• 分子量: 257.246
• InChiKey: XTMUVONJUKLBOY-JXOAFFINSA-N

物化性质

• 熔点：
  223-225 °C
• 密度：
  1.475±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  di-O-benzoyl-3-phthalimido-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl chloride 在 甲醇 、 正丁胺 、 xylene 作用下， 生成 1-(3-amino-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  The Synthesis of 1-(Aminodeoxy-β-D-ribofuranosyl)-2-pyrimidinones. New 3'- and 5'-Aminonucleosides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja01543a054

文献信息

• Mycobacterium tuberculosis Thymidine Monophosphate Kinase Inhibitors: Biological Evaluation and Conformational Analysis of 2′- and 3′-Modified Thymidine Analogues
  作者：Philippe Van Rompaey、Koen Nauwelaerts、Veerle Vanheusden、Jef Rozenski、Hélène Munier-Lehmann、Piet Herdewijn、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1002/ejoc.200300177

  日期：2003.8

  Mycobacterium tuberculosis thymidine monophosphate kinase (TMPKmt) has recently been introduced as a potential target for the structure-based design of anti-tuberculosis drugs. Based on the TMPKmt X-ray structure and previous S.A.R. studies, we synthesised the nucleoside analogues 3a−b, 6a−b, 7a−b, and 8a−b, modified in 2′- and 3′-position of the ribofuranose ring moiety. To our surprise, these analogues

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)