Synthesis, biological evaluation, and molecular docking analysis of novel linker-less benzamide based potent and selective HDAC3 inhibitors
作者:Ganesh Routholla、Sravani Pulya、Tarun Patel、Sk. Abdul Amin、Nilanjan Adhikari、Swati Biswas、Tarun Jha、Balaram Ghosh
DOI:10.1016/j.bioorg.2021.105050
日期:2021.9
was found to be a highly potent HDAC3 inhibitor (IC50 = 560 nM) and displayed 46-fold selectivity for HDAC3 over HDAC2, and 33-fold selectivity for HDAC3 over HDAC1. The synthesized compounds possess antiproliferative activities against different cancer cell lines and significantly less cytotoxic to normal cells. Molecular Docking studies of compounds 5e and 5f reveal a similar binding mode of interactions
一系列具有不同芳基和杂芳基帽基的新型无接头苯甲酰胺已被设计、合成和筛选为具有良好抗癌活性的有效组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制剂。发现两种先导化合物5e和5f是比其他 I 类 HDAC 和 HDAC6 更有效且高度选择性的 HDAC3 抑制剂。发现带有 6-喹啉基部分作为帽基的化合物5e是一种高效的 HDAC3 抑制剂(IC 50 = 560 nM) 并显示 HDAC3 的选择性是 HDAC2 的 46 倍,HDAC3 的选择性是 HDAC1 的 33 倍。合成的化合物对不同的癌细胞系具有抗增殖活性,对正常细胞的细胞毒性显着降低。化合物5e和5f 的分子对接研究揭示了在 HDAC3 活性位点与CI994类似的相互作用结合模式。这些观察结果与体外HDAC3 抑制活性一致。当用化合物5e和5f处理 B16F10 细胞时,发现 H3K9 和 H4K12 的内源性乙酰化水平显着增强以剂量依赖性方