3-methyl-1(2),4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione | 28668-19-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡唑并嘧啶类
• 英文名称: 3-methyl-1(2),4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione
• 英文别名: 3-methyl-1,4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione；3-Methyl-1,4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-5,7-dion；3-Methylpyrazolo<4,3-d>pyrimidin-5,7-dion；3-Methyl-2h-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7(4h,6h)-dione；3-methyl-2,4-dihydropyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione
• CAS: 28668-19-1
• 化学式: C₆H₆N₄O₂
• 分子量: 166.139
• InChiKey: PGSUDFAXDCCGPI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  86.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-methyl-1(2),4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 生成 5,7-Dichloro-3-methyl-1H-pyrazolo[4,3-D]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  基于结构的有效选择性 YTHDC1 配体设计

  摘要：

  N 6 -腺苷甲基化 (m 6 A) 是一种常见的 mRNA 转录后修饰，YTHDC1 是负责识别细胞核中这种修饰的读取蛋白。在这里，我们提出了一种基于蛋白质结构的药物化学活动，产生了 YTHDC1 抑制剂40 ，其平衡解离常数 ( K d ) 为 49 nM。复合物的晶体结构（1.6 Å 分辨率）验证了设计。化合物40对细胞质 m 6 A-RNA 读取器 YTHDF1-3 和 YTHDC2 具有选择性，并对急性髓系白血病 (AML) 细胞系 THP-1、MOLM-13 和 NOMO-1 显示出抗增殖活性。对于最终形成配体40的一系列化合物，生化测定中的亲和力与 THP-1 细胞系中的抗增殖活性之间的良好相关性提供了细胞中 YTHDC1 靶标参与的证据。细胞热位移测定进一步支持与细胞中 YTHDC1 的结合。因此，配体40是研究 YTHDC1 在 AML 中的作用的工具化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.4c00599
• 作为产物：
  描述：

  5-methyl-4-nitro-1H-pyrazole-3-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 、 乙醇 作用下， 生成 3-methyl-1(2),4-dihydro-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-5,7-dione
  参考文献：
  名称：

  Potential Purine Antagonists. V. Synthesis of Some 3-Methyl-5,7-substituted Pyrazolo[4,3-d]pyrimidines^1,2

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo01114a001

文献信息

• IRAK DEGRADERS AND USES THEREOF
  申请人：Kymera Therapeutics, Inc.

  公开号：EP3731869A1

  公开（公告）日：2020-11-04
• Potential Purine Antagonists. V. Synthesis of Some 3-Methyl-5,7-substituted Pyrazolo[4,3-d]pyrimidines^1,2
  作者：ROLAND K. ROBINS、LEE B. HOLUM、FREDERICK W. FURCHT

  DOI：10.1021/jo01114a001

  日期：1956.8
• 10.1021/acs.jmedchem.4c00599
  作者：Zálešák, František、Nai, Francesco、Herok, Marcin、Bochenkova, Elena、Bedi, Rajiv K.、Li, Yaozong、Errani, Francesco、Caflisch, Amedeo

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.4c00599

  日期：——

  mRNA, with YTHDC1 being the reader protein responsible for recognizing this modification in the cell nucleus. Here, we present a protein structure-based medicinal chemistry campaign that resulted in the YTHDC1 inhibitor 40, which shows an equilibrium dissociation constant (Kd) of 49 nM. The crystal structure of the complex (1.6 Å resolution) validated the design. Compound 40 is selective against the

  N 6 -腺苷甲基化 (m 6 A) 是一种常见的 mRNA 转录后修饰，YTHDC1 是负责识别细胞核中这种修饰的读取蛋白。在这里，我们提出了一种基于蛋白质结构的药物化学活动，产生了 YTHDC1 抑制剂40 ，其平衡解离常数 ( K d ) 为 49 nM。复合物的晶体结构（1.6 Å 分辨率）验证了设计。化合物40对细胞质 m 6 A-RNA 读取器 YTHDF1-3 和 YTHDC2 具有选择性，并对急性髓系白血病 (AML) 细胞系 THP-1、MOLM-13 和 NOMO-1 显示出抗增殖活性。对于最终形成配体40的一系列化合物，生化测定中的亲和力与 THP-1 细胞系中的抗增殖活性之间的良好相关性提供了细胞中 YTHDC1 靶标参与的证据。细胞热位移测定进一步支持与细胞中 YTHDC1 的结合。因此，配体40是研究 YTHDC1 在 AML 中的作用的工具化合物。