Synthesis, crystal structure, and a molecular modeling approach to identify effective antiviral hydrazide derivative against the main protease of SARS-CoV-2
作者:Shaaban K. Mohamed、Youness El Bakri、Dalia A. Abdul、Sajjad Ahmad、Mustafa R Albayati、Chin-Hung Lai、Joel T. Mague、Mahmoud S. Tolba
DOI:10.1016/j.molstruc.2022.133391
日期:2022.10
additional C—H•••π(ring) interactions into the full 3-D structure. To obtain a structure-activity relationship, the DFT-NBO analysis is performed to study the intrinsic electronic properties of the title compound. Molecular modeling studies were also conducted to examine the binding affinity of the compound for the SARS-CoV-2 main protease enzyme and to determine intermolecular binding interactions. The
2019年秋天,一种新型冠状病毒在中国武汉市爆发,并迅速在全球传播,迫切需要科学界开发抗病毒治疗药物。为此,我们合成了一种新的酰肼衍生物,( E )-N ' -(1-(4-溴苯基)亚乙基)-2-(6-甲氧基萘-2-基)丙酰肼,因为它具有潜在的抑制特性。 。标题分子的不对称单元由两个构象明显不同的独立分子组成。晶体中,独立的分子通过NH•••O和CH•••O氢键以及CH•••π(环)相互作用连接成沿b轴方向延伸的螺旋链。这些链通过额外的 CH•••π(环)相互作用进一步连接成完整的 3-D 结构。为了获得构效关系,进行了 DFT-NBO 分析以研究标题化合物的固有电子性质。还进行了分子模型研究,以检查该化合物与 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的结合亲和力,并确定分子间结合相互作用。该化合物在酶活性口袋处显示出稳定的结合模式,结合能为-8.1 kcal/mol。此外,揭示了酶-化合物复合物的