[(2S,3S,4R,5R)-5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)-3,4-二羟基-四氢呋喃-2-基]甲氧基-[[(2R,3R,4S,6S)-3,4-二羟基-6-甲基-5-氧代-四氢吡喃-2-基]氧基-羟基-磷酰]氧基-次磷酸 | 18186-48-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 中文名称: [(2S,3S,4R,5R)-5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)-3,4-二羟基-四氢呋喃-2-基]甲氧基-[[(2R,3R,4S,6S)-3,4-二羟基-6-甲基-5-氧代-四氢吡喃-2-基]氧基-羟基-磷酰]氧基-次磷酸
• 英文名称: GDP-4-keto-6-deoxy-α-D-mannose
• 英文别名: GDP-6-deoxy-4-keto-D-Man；GDP-6-deoxy-4-keto-D-mannose；GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2R,3S,4R,6R)-3,4-dihydroxy-6-methyl-5-oxooxan-2-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 18186-48-6
• 化学式: C₁₆H₂₃N₅O₁₅P₂
• 分子量: 587.331
• InChiKey: PNHLMHWWFOPQLK-BKUUWRAGSA-N

物化性质

• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.3
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  304
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2S,3S,4R,5R)-5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)-3,4-二羟基-四氢呋喃-2-基]甲氧基-[[(2R,3R,4S,6S)-3,4-二羟基-6-甲基-5-氧代-四氢吡喃-2-基]氧基-羟基-磷酰]氧基-次磷酸 在 葡萄糖 、 烟酰胺腺嘌呤双核苷酸磷酸盐 、 GDP-L-Fucose synthase from E_. coli O₁₅₇ 、 glycoside hydrolase 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 以2.72 g的产率得到5`-二磷酸鸟嘌呤核苷-岩藻糖二钠盐
  参考文献：
  名称：

  通过级联转换策略从普通糖中轻松合成糖核苷酸

  摘要：

  糖核苷酸是碳水化合物代谢中必不可少的糖基化供体。自然地，大多数糖核苷酸通过从头生物合成途径衍生自有限数量的常见糖核苷酸，经历单一或多重反应，例如脱水、差向异构化、异构化、氧化、还原、胺化和乙酰化反应。然而，人们普遍认为，由于制备成本高且产品分离难度大，这种复杂的生物转化对于合成用途并不实用。因此，大多数发现的糖核苷酸都不容易获得。在这里，基于de novo主要是生物合成，从两种常见的糖 D-Man 和蔗糖中成功制备了 13 种难以获得的糖核苷酸，其产量高达数克，无需繁琐的纯化操作。这项工作表明，从头生物合成虽然经历了复杂的反应，但通过采用级联转换策略，对于合成使用也是实用且具有成本效益的。

  DOI：

  10.1021/jacs.2c03138
• 作为产物：
  描述：

  guanosine 5'-diphospho-D-mannose 在 GDP-D-Man 4,6-dehydratase from Pseudomonas aeruginosa 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 [(2S,3S,4R,5R)-5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)-3,4-二羟基-四氢呋喃-2-基]甲氧基-[[(2R,3R,4S,6S)-3,4-二羟基-6-甲基-5-氧代-四氢吡喃-2-基]氧基-羟基-磷酰]氧基-次磷酸
  参考文献：
  名称：

  通过级联转换策略从普通糖中轻松合成糖核苷酸

  摘要：

  糖核苷酸是碳水化合物代谢中必不可少的糖基化供体。自然地，大多数糖核苷酸通过从头生物合成途径衍生自有限数量的常见糖核苷酸，经历单一或多重反应，例如脱水、差向异构化、异构化、氧化、还原、胺化和乙酰化反应。然而，人们普遍认为，由于制备成本高且产品分离难度大，这种复杂的生物转化对于合成用途并不实用。因此，大多数发现的糖核苷酸都不容易获得。在这里，基于de novo主要是生物合成，从两种常见的糖 D-Man 和蔗糖中成功制备了 13 种难以获得的糖核苷酸，其产量高达数克，无需繁琐的纯化操作。这项工作表明，从头生物合成虽然经历了复杂的反应，但通过采用级联转换策略，对于合成使用也是实用且具有成本效益的。

  DOI：

  10.1021/jacs.2c03138

文献信息

• [EN] USE OF FUCOSYLATION INHIBITOR FOR PRODUCING AFUCOSYLATED ANTIBODY<br/>[FR] UTILISATION D'UN INHIBITEUR DE FUCOSYLATION POUR PRODUIRE UN ANTICORPS AFUCOSYLÉ
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2021127414A1

  公开（公告）日：2021-06-24

  The present invention provides inhibitors of fucosylation during protein expression from mammalian cells. The inhibitors are derived from rhamnose and act by inhibition of GDP-mannose 4,6-dehydratase (GMD). The invention further provides methods of making proteins with reduced level of fucosylation, such as antibodies and antibodies made by the methods of the present invention. Such hypofucosylated or nonfucosylated antibodies may find use, for example, in treatment of human disease in which is it therapeutically beneficial to direct antibody dependent cellular cytotoxicity (ADCC) mediated killing of cells expressing the antibody target on their surface, for example in depletion of Tregs in cancer patients using a hypofucosylated or nonfucosylated anti-CTLA-4 antibody.

  本发明提供了在哺乳动物细胞中蛋白质表达过程中抑制富糖基化的抑制剂。这些抑制剂源自鼠李糖，并通过抑制 GDP-甘露糖4,6-脱水酶（GMD）来发挥作用。该发明还提供了制备具有降低富糖基化水平的蛋白质的方法，例如通过本发明的方法制备的抗体和抗体。这种低富糖化或无富糖化的抗体可以在治疗人类疾病中发挥作用，例如在治疗中对表达抗体靶点的细胞进行抗体依赖性细胞毒作用（ADCC）介导的杀伤，例如在癌症患者中使用低富糖化或无富糖化的抗CTLA-4抗体去除Treg细胞。
• Nucleic acids useful for enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose
  申请人：Cytel Corporation

  公开号：US20030134403A1

  公开（公告）日：2003-07-17

  This invention provides methods for practical enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose. These methods are useful for efficient synthesis of reactants used in the synthesis of fucosylated oligosaccharides.

  本发明提供了一种实用的酶促转化GDP-甘露糖为GDP-岩藻糖的方法。这些方法对于高效合成富含岩藻糖基的寡糖反应物非常有用。
• Methods for enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose
  申请人：Cytel Corporation

  公开号：US20030143567A1

  公开（公告）日：2003-07-31

  This invention provides methods for practical enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose. These methods are useful for efficient synthesis of reactants used in the synthesis of fucosylated oligosaccharides.

  这项发明提供了一种实用的酶促将GDP-甘露糖转化为GDP-岩藻糖的方法。这些方法对于高效合成用于合成岩藻糖基寡糖的反应物是有用的。
• Preparation of fucosylated oligosaccharides
  申请人：Sjoberg R. Eric

  公开号：US20060234354A1

  公开（公告）日：2006-10-19

  This invention provides methods for practical enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose. These methods are useful for efficient synthesis of reactants used in the synthesis of fucosylated oligosaccharides.

  这项发明提供了一种实用的酶促反应方法，用于将GDP-甘露糖转化为GDP-岩藻糖。这些方法可用于高效合成在寡糖岩藻糖合成中使用的反应物。
• Enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose
  申请人：Neose Technologies, Inc.

  公开号：US06500661B1

  公开（公告）日：2002-12-31

  This invention provides methods for practical enzymatic conversion of GDP-mannose to GDP-fucose. These methods are useful for efficient synthesis of reactants used in the synthesis of fucosylated oligosaccharides.

  这项发明提供了一种实用的酶催化方法，将GDP-甘露糖转化为GDP-岩藻糖。这些方法对于高效合成用于合成岩藻糖基寡糖的反应物非常有用。