2-N-(N,N-dimethylaminomethylidenyl)-N1-benzoyl-7-deaza-7-iodo-5'-O-(4-monomethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine | 1288998-94-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-N-(N,N-dimethylaminomethylidenyl)-N1-benzoyl-7-deaza-7-iodo-5'-O-(4-monomethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine
• CAS: 1288998-94-6
• 化学式: C₄₁H₃₈IN₅O₆
• 分子量: 823.687
• InChiKey: QJCPYGCEUDWRBB-BMPTZRATSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.38
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  120.41
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-N-(N,N-dimethylaminomethylidenyl)-N1-benzoyl-7-deaza-7-iodo-5'-O-(4-monomethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine 在 caesium carbonate 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 2-N-(N,N-dimethylaminomethylidenyl)-N3-benzoyl-7-deaza-7-iodo-3'-O-(2-cyanoethyl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  氟化物可切割、荧光标记的可逆终止子：合成和在引物延伸中的使用

  摘要：

  在 3'- O 上含有保护基团的荧光 2'-脱氧核苷酸-位置是可逆终止子，可实现基于阵列的 DNA 合成测序 (SBS) 方法。在此，我们描述了四个可逆终止子的合成和完整表征，这些终止子带有一个 3' 封闭部分和一个接头染料系统，该系统在相同的氟化物处理下可去除。每个核苷酸类似物都有一个不同的荧光团，通过氟化物可裂解的接头和 2-氰乙基部分作为 3'-封闭基团连接到碱基上，也可以通过使用氟化物处理来去除。此外，我们鉴定了一种 DNA 聚合酶，即 RevertAid M-MuLV 逆转录酶，它可以整合四种修饰的可逆终止子。

  DOI：

  10.1002/chem.201001952
• 作为产物：
  描述：

  7-iodo-7-deaza-2'-deoxyguanosine 在 4-二甲氨基吡啶 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 63.5h， 生成 2-N-(N,N-dimethylaminomethylidenyl)-N1-benzoyl-7-deaza-7-iodo-5'-O-(4-monomethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  氟化物可切割、荧光标记的可逆终止子：合成和在引物延伸中的使用

  摘要：

  在 3'- O 上含有保护基团的荧光 2'-脱氧核苷酸-位置是可逆终止子，可实现基于阵列的 DNA 合成测序 (SBS) 方法。在此，我们描述了四个可逆终止子的合成和完整表征，这些终止子带有一个 3' 封闭部分和一个接头染料系统，该系统在相同的氟化物处理下可去除。每个核苷酸类似物都有一个不同的荧光团，通过氟化物可裂解的接头和 2-氰乙基部分作为 3'-封闭基团连接到碱基上，也可以通过使用氟化物处理来去除。此外，我们鉴定了一种 DNA 聚合酶，即 RevertAid M-MuLV 逆转录酶，它可以整合四种修饰的可逆终止子。

  DOI：

  10.1002/chem.201001952