溴亚甲基二(膦酸) | 10596-21-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 中文名称: 溴亚甲基二(膦酸)
• 英文名称: bromomethanediphosphonate
• 英文别名: [bromo(phosphono)methyl]phosphonic acid；Bromomethylenebis(phosphonic acid)
• CAS: 10596-21-1
• 化学式: CH₅BrO₆P₂
• 分子量: 254.899
• InChiKey: WKBWYLXFNPONGU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  535.5±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.630±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于水

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 海关编码：
  2916190090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  溴亚甲基二(膦酸) 、 二环己胺 以 乙醇 为溶剂， 生成 bromomethanediphosphonate tris(dicyclohexylammonium) salt
  参考文献：
  名称：

  McKenna, Charles E.; Khawli, Leslie A.; Ahmad, Wan-Yaacob, Phosphorus and Sulfur and the Related Elements, 1988, vol. 37, p. 1 - 12

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  单溴亚甲基二膦酸四异丙基酯 在 氢溴酸 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 溴亚甲基二(膦酸)
  参考文献：
  名称：

  DNA 聚合酶 β 催化中的过渡态：碱基对构型改变的限速化学

  摘要：

  对具有焦磷酸盐模拟 β,γ-pCXYp 离去基团和可变 X 和 Y 取代的 dNTP 类似物的动力学研究揭示了 DNA 聚合酶 β 的化学过渡态能量的显着差异，这取决于碱基配对构型的所有方面，包括传入的 dNTP 是嘌呤或嘧啶，并且碱基配对是正确的（T•A 和 G•C）还是错误的（T•G 和 G•T）。催化速率常数 (log( k pol )) 与 p K a4 的Brønsted 图离去基团表现出线性自由能关系 (LFER)，负斜率范围为 -0.6 至 -2.0，与化学速率决定过渡态一致，其中活性位点在化学过程中根据基数调整电荷稳定需求配对配置。Brønsted 斜率和截距显着不同，并提供了第一个直接证据表明酶-引物-模板复合物对 dNTP 碱基的识别触发了活性位点催化区域的构象变化，从而显着改变了决定速率的化学步骤.

  DOI：

  10.1021/bi500101z

文献信息

• Completing the β,γ-CXY-dNTP Stereochemical Probe Toolkit: Synthetic Access to the dCTP Diastereomers and ³¹P and ¹⁹F NMR Correlations with Absolute Configurations
  作者：Pouya Haratipour、Corinne Minard、Maryam Nakhjiri、Amirsoheil Negahbani、Brian T. Chamberlain、Jorge Osuna、Thomas G. Upton、Michelle Zhao、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01204

  日期：2020.11.20

  documented here, but the reductive deprotection step is not compatible with dCTP or the bromo substituent in β,γ-CHBr-dNTP analogues. To complete assembly of the toolkit, we describe an alternative synthetic strategy featuring ethylbenzylamine or phenylglycine-derived chiral BP synthons incorporating a photolabile protecting group. After acid-catalyzed removal of the (R)-(+)-α-ethylbenzylamine auxiliary

  β，γ-氧被一个CXY基团模拟的核苷5'-三磷酸（dNTP）类似物（β，γ-CXY-dNTPs）提供了有关DNA聚合酶催化和保真度的信息。CXY立体化学的定义对于阐明精确的结合模式非常重要。我们之前曾报道过通过P，C-二吗啉酰胺CHCl（6a，6b）和CHF（7a，7b）双膦酸酯制备的（R）-和（S）-β，γ-CHX-dGTP非对映异构体（X = F，Cl）（BPs）配备（R）-扁桃酸作为手性助剂，并使用H 2 / Pd进行最终脱保护。该方法还提供了β，γ-CHCl-dTTP（11a，11b），β，γ-CHF（12a，12b）和β，γ-CHCl（13a，13b）dATP非对映异构体，但还原脱保护步骤与dCTP或β，γ-CHBr中的溴取代基不相容-dNTP类似物。为了完成该工具包的组装，我们描述了一种替代合成策略，其特征在于乙基苄胺或苯基甘氨酸衍生的手性BP合成子并入了对光不稳定的保护基团。
• Halogenated β,γ-Methylene- and Ethylidene-dGTP-DNA Ternary Complexes with DNA Polymerase β: Structural Evidence for Stereospecific Binding of the Fluoromethylene Analogues
  作者：Vinod K. Batra、Lars C. Pedersen、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Boris A. Kashemirov、Thomas G. Upton、Myron F. Goodman、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ja909370k

  日期：2010.6.9

  enzyme that plays an important role in base excision repair (BER) and oncogenesis. We report X-ray crystallographic results for a series of beta,gamma-CXY dGTP analogues, where X,Y = H, F, Cl, Br, and/or CH(3). For all three R/S monofluorinated analogues examined (CHF, 3/4; CCH(3)F, 13/14; CClF 15/16), a single CXF-diastereomer (3, 13, 16) is observed in the active site complex, with the CXF fluorine

  核苷酸的β，γ-氟亚甲基类似物被认为是天然底物的有用模拟物，但尚无定义其活性位点相互作用的直接结构证据，包括在 CHF 碳上引入的新手性中心的影响，如β ,γ-氟亚甲基-dGTP，与 DNA 聚合酶 β 形成活性位点复合物，DNA 聚合酶是一种在碱基切除修复 (BER) 和肿瘤发生中起重要作用的修复酶。我们报告了一系列 beta、γ-CXY dGTP 类似物的 X 射线晶体学结果，其中 X、Y = H、F、Cl、Br 和/或 CH(3)。对于检查的所有三个 R/S 单氟化类似物（CHF，3/4；CCH(3)F，13/14；CClF 15/16），在活性位点观察到单个 CXF-非对映异构体（3、13、16）复杂的，CXF 氟原子与 Arg183 的胍 N 相距约 3 A（键合）距离。相比之下，对于 CHCl、CHBr 和 CHCH(3) 类似物，两种非对映异构体（6/7、8/9、10/11）大致相等地填充酶复合物中的
• A Change in the Rate-Determining Step of Polymerization by the K289M DNA Polymerase β Cancer-Associated Variant
  作者：Khadijeh S. Alnajjar、Beatriz Garcia-Barboza、Amirsoheil Negahbani、Maryam Nakhjiri、Boris Kashemirov、Charles McKenna、Myron F. Goodman、Joann B. Sweasy

  DOI：10.1021/acs.biochem.6b01230

  日期：2017.4.18

  K289M is a variant of DNA polymerase β (pol β) that has previously been identified in colorectal cancer. The expression of this variant leads to a 16-fold increase in mutation frequency at a specific site in vivo and a reduction in fidelity in vitro in a sequence context-specific manner. Previous work shows that this reduction in fidelity results from a decreased level of discrimination against incorrect

  K289M是DNA聚合酶β（polβ）的一种变体，先前已在大肠癌中鉴定出这种变体。该变体的表达导致体内特定位点的突变频率增加16倍，并以序列背景特定的方式使体外保真度降低。先前的工作表明，保真度的降低是由于在聚合水平上对不正确的核苷酸掺入的辨别水平降低而导致的。为了探测polβ的K289M突变体变体的过渡状态，使用具有宽范围离去基单酸解离常数（pKa4）的β，γ-CXYdGTP类似物进行了单周转动力学实验，其中包括一组相应的新型β ，γ-CXYdCTP类似物。出奇，我们发现，与野生型polβ相比，K289M正确插入的催化速率常数（kpol）的log值不随pKa4值<11的类似物的离开基团pKa4的增加而降低。这表明与野生型（WT）相比，K289M反应的相对速率常数之一有所不同。但是，通过K289M与pKa4进行不正确插入的log（kpol）值图揭示了具有负斜率的线性相关性，在这方面类似于W
• MCKENNA, CHARLES E.;KHAWLI, LESLIE A.;AHMAD, WAN YAACOB;PHAM, PHUONG;BONG+, PHOSPHORUS AND SULFUR., 37,(1988) N-2, C. 1-12
  作者：MCKENNA, CHARLES E.、KHAWLI, LESLIE A.、AHMAD, WAN YAACOB、PHAM, PHUONG、BONG+

  DOI：——

  日期：——
• Transition State in DNA Polymerase β Catalysis: Rate-Limiting Chemistry Altered by Base-Pair Configuration
  作者：Keriann Oertell、Brian T. Chamberlain、Yue Wu、Elena Ferri、Boris A. Kashemirov、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna、Myron F. Goodman

  DOI：10.1021/bi500101z

  日期：2014.3.25

  G•T). Brønsted plots of the catalytic rate constant (log(kpol)) versus pKa4 for the leaving group exhibit linear free energy relationships (LFERs) with negative slopes ranging from −0.6 to −2.0, consistent with chemical rate-determining transition-states in which the active-site adjusts to charge-stabilization demand during chemistry depending on base-pair configuration. The Brønsted slopes as well as

  对具有焦磷酸盐模拟 β,γ-pCXYp 离去基团和可变 X 和 Y 取代的 dNTP 类似物的动力学研究揭示了 DNA 聚合酶 β 的化学过渡态能量的显着差异，这取决于碱基配对构型的所有方面，包括传入的 dNTP 是嘌呤或嘧啶，并且碱基配对是正确的（T•A 和 G•C）还是错误的（T•G 和 G•T）。催化速率常数 (log( k pol )) 与 p K a4 的Brønsted 图离去基团表现出线性自由能关系 (LFER)，负斜率范围为 -0.6 至 -2.0，与化学速率决定过渡态一致，其中活性位点在化学过程中根据基数调整电荷稳定需求配对配置。Brønsted 斜率和截距显着不同，并提供了第一个直接证据表明酶-引物-模板复合物对 dNTP 碱基的识别触发了活性位点催化区域的构象变化，从而显着改变了决定速率的化学步骤.