N-{3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]propyl}-2,3-dihydroxy-5-nitrobenzene-1-carboxamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: N-{3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]propyl}-2,3-dihydroxy-5-nitrobenzene-1-carboxamide
• 英文别名: N-[3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]propyl]-2,3-dihydroxy-5-nitrobenzamide
• 化学式: C₁₉H₂₁N₇O₈
• 分子量: 475.418
• InChiKey: XPDIAUWXKUSFJF-FXRKXCAFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  235
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 10percent Pd/C 氢气 、 二异丁基氢化铝 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 甲胺 、 三氟乙酸 、 偶氮二甲酸二乙酯 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， -78.0~20.0 ℃ 、400.01 kPa 条件下， 反应 142.5h， 生成 N-{3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]propyl}-2,3-dihydroxy-5-nitrobenzene-1-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Bisubstrate inhibitors for the enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT): influence of inhibitor preorganisation and linker length between the two substrate moieties on binding affinity

  摘要：

  抑制儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)是治疗帕金森病的重要方法。根据基于X射线结构设计的原理，一系列新型强效双底物COMT抑制剂已被合成，这些抑制剂具有腺苷和儿茶酚结构单元。生物学结果显示，结合亲和力对抑制剂的预组织结构及核苷与儿茶酚单元间连接链的长度有较大依赖性。对COMT最有效的双底物抑制剂的IC50值为9 nM。它对SAM结合位点表现出竞争性动力学特性，而对儿茶酚结合位点则呈现出混合抑制动力学特征。其双底物结合模式通过分析抑制剂、COMT及Mg2+离子形成的三元复合物的X射线结构得到确认。

  DOI：

  10.1039/b208690p

文献信息

• X-ray Crystal Structure of a Bisubstrate Inhibitor Bound to the Enzyme Catechol-O-methyltransferase: A Dramatic Effect of Inhibitor Preorganization on Binding Affinity We thank F. Hoffmann–La Roche for generous support of this work. We are grateful to P. Malherbe for the cloning of COMT, P. Caspers for the expression of COMT, A. Cesura for enzyme purification, B. Wipf for fermentation, and H. W. Lahm for sequencing.
  作者：Christian Lerner、Armin Ruf、Volker Gramlich、Birgit Masjost、Gerhard Zürcher、Roland Jakob-Roetne、Edilio Borroni、François Diederich

  DOI：10.1002/1521-3773(20011105)40:21<4040::aid-anie4040>3.0.co;2-c

  日期：2001.11.5

  With an IC50 value of 9 nM, 1 is the most potent known disubstrate inhibitor for catechol-O-methyltransferase (COMT). Inhibition of COMT is of significant interest in the therapy of Parkinsonapos;s disease since it ensures that a larger percentage of orally administered L-dopa reaches-in the form of dopamine-its target in the brain. The X-ray crystal structure of a complex formed by COMT and 1 has been solved at 2.6-Å resolution.
• Bisubstrate inhibitors for the enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT): influence of inhibitor preorganisation and linker length between the two substrate moieties on binding affinity
  作者：Christian Lerner、Birgit Masjost、Armin Ruf、Volker Gramlich、Roland Jakob-Roetne、Gerhard Zürcher、Edilio Borroni、François Diederich

  DOI：10.1039/b208690p

  日期：——

  Inhibition of the enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT) is an important approach in the treatment of Parkinson's disease. A series of new potent bisubstrate inhibitors for COMT, resulting from X-ray structure-based design and featuring adenosine and catechol moieties have been synthesised. Biological results show a large dependence of binding affinity on inhibitor preorganisation and the length of the linker between nucleoside and catechol moieties. The most potent bisubstrate inhibitor for COMT has an IC50 value of 9 nM. It exhibits competitive kinetics for the SAM and mixed inhibition kinetics for the catechol binding site. Its bisubstrate binding mode was confirmed by X-ray structure analysis of the ternary complex formed by the inhibitor, COMT and a Mg2+ ion.

  抑制儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)是治疗帕金森病的重要方法。根据基于X射线结构设计的原理，一系列新型强效双底物COMT抑制剂已被合成，这些抑制剂具有腺苷和儿茶酚结构单元。生物学结果显示，结合亲和力对抑制剂的预组织结构及核苷与儿茶酚单元间连接链的长度有较大依赖性。对COMT最有效的双底物抑制剂的IC50值为9 nM。它对SAM结合位点表现出竞争性动力学特性，而对儿茶酚结合位点则呈现出混合抑制动力学特征。其双底物结合模式通过分析抑制剂、COMT及Mg2+离子形成的三元复合物的X射线结构得到确认。