methyl 4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]pentanoate | 1237750-60-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 类固醇和类固醇衍生物
• 英文名称: methyl 4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]pentanoate
• 英文别名: methyl (4R)-4-[(1R,3aS,4E,7aR)-4-[2-[(3R,5R)-3,5-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-4-methylidenecyclohexylidene]ethylidene]-7a-methyl-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]pentanoate
• CAS: 1237750-60-5
• 化学式: C₃₇H₆₆O₄Si₂
• 分子量: 631.1
• InChiKey: SHOPQMOYDBFTST-ZOXGDVDFSA-N

物化性质

• 沸点：
  600.2±55.0 °C(predicted)
• 密度：
  0.97±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.78
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  44.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]pentanoate 在 N-甲基吗啉 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-Bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]-N-methoxy-N-methylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  共价结合亲电配体的维生素D受体中组氨酸残基的鉴定

  摘要：

  我们设计并合成了具有亲电子试剂的维生素D类似物，作为维生素D受体（VDR）的共价修饰剂。新的维生素d类似物1 - 4具有在侧链共轭除了His301或His393在VDR亲电烯酮基团。所有化合物均显示出特定的VDR结合效能和激动活性。的共价键的形成1 - 4与VDR的配体结合域（LBD），通过电喷雾电离质谱评价。所有化合物均显示出共价结合到VDR-LBD，和相应的共轭加成物VDR-LBD的丰度1 - 4与温育时间而增加。烯酮化合物1和图2显示出比烯-炔酮3和二烯酮4化合物更高的反应性。此外，我们成功地获得VDR-LBD的共晶体与类似物1 - 4。X射线晶体学分析显示在VDR-LBD中与His301共价键。我们成功地合成了与VDR-LBD形成共价键的维生素D类似物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b00774
• 作为产物：
  描述：

  甲醇 、 ethyl (2E)-4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]pent-2-enoate 在 magnesium 作用下， 反应 20.0h， 以84%的产率得到methyl 4-[(1R,3R,7E,17β)-1,3-bis{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-2-methylidene-9,10-secoestra-5,7-dien-17-yl]pentanoate
  参考文献：
  名称：

  维生素D受体的强效拮抗剂：具有简单侧链结构的维生素D类似物

  摘要：

  我们先前曾报道22 S-丁基25,26,27-trinor-1α，24-二羟基维生素D 3 2是有效的VDR拮抗剂。VDR的配体结合域与2配合的X射线晶体结构表明，该配体在配体结合袋中诱导了一个额外的空腔。该结构还显示，配体仅与蛋白质的螺旋12形成不良的疏水相互作用。在这里，为了研究诱导多余腔体以及与螺旋12相互作用不足对拮抗作用的影响，我们设计并合成了一系列带有或不带有22个烷基取代基的维生素D 3类似物，并评估了它们的生物效价。我们发现22-丁基类似物3c和5c充当完全拮抗剂，22乙基类似物3b，4b，5b和22丁基类似物4c充当部分激动剂，而其他（3a，4a，5a，6a，6b和6c）充当VDR。有趣的是6c是VDR的有效激动剂，而其26,27-dinor类似物5c是有效的拮抗剂。类似物6c很好地募集了共激活剂SRC-1，但5c没有。这些结果表明，在这种配体中，诱导额外的空穴和与螺旋1

  DOI：

  10.1021/jm100649d

文献信息

• Butyl Pocket Formation in the Vitamin D Receptor Strongly Affects the Agonistic or Antagonistic Behavior of Ligands
  作者：Nobuko Yoshimoto、Yuta Sakamaki、Minoru Haeta、Akira Kato、Yuka Inaba、Toshimasa Itoh、Makoto Nakabayashi、Nobutoshi Ito、Keiko Yamamoto

  DOI：10.1021/jm300230a

  日期：2012.5.10

  Previously, we reported that 22S-butyl-25,26,27-trinor-1 alpha,24-dihydroxyvitamin D-3 2 represents a new class of antagonist for the vitamin D receptor (VDR). The crystal structure of the ligand-binding domain (LBD) of VDR complexed with 2 showed the formation of a butyl pocket to accommodate the 22-butyl group and insufficient interactions between ligand 2 and the C-terminus of VDR Here, we designed and synthesized new analogues 5a-c and evaluated their biological activities to probe whether agonistic activity is recovered when the analogue restores interactions with the C-terminus of VDR Analogues 5a-c exhibited full agonistic activity in transactivation. Interestingly, 5c, which bears a 24-diethyl group, completely recovered agonistic activity, although 3c and 4c act as an antagonist and a weak agonist, respectively. The crystal structures of VDR-LBD complexed with 3a, 4a, 5a, and 5c were solved, and the results confirmed that butyl pocket formation in VDR strongly affects the agonistic or antagonistic behaviors of ligands.