N-chloroacetamido-fluorescein

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: N-chloroacetamido-fluorescein
• 英文别名: 5-chloromethylamidofluorescein；4-(chloromethylamide)fluorescein；5-[(2-Chloroacetyl)amino]-2-(3-hydroxy-6-oxoxanthen-9-yl)benzoic acid
• 化学式: C₂₂H₁₄ClNO₆
• 分子量: 423.809
• InChiKey: UYNQADAHLCGLPP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.05
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-chloroacetamido-fluorescein 在 potassium carbonate 、 三氟乙酸 、 potassium iodide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 2-(3-Hydroxy-6-oxoxanthen-9-yl)-5-[[2-[4,7,10-tris(carboxymethyl)-1,4,7,10-tetrazacyclododec-1-yl]acetyl]amino]benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  Near-Infrared Neodymium Tag for Quantifying Targeted Biomarker and Counting Its Host Circulating Tumor Cells

  摘要：

  在复杂的生物系统中，目标分析物的定量信息是了解其参与机制的最基本前提，因此，如果它是所谓的生物标记物，就能精确诊断疾病。在这里，我们设计并合成了一种钕（Nd）涂层标签[1,4,7,10-四氮杂环十二烷-1,4,7-三乙酸（DOTA）-Nd 复合物与光收集天线氨基荧光素（AMF，λex/em = 494/520 nm），AMF-DOTA-Nd]，它具有双工信号、第二近红外（NIR）窗口发光（λem = 1065 nm，2.5 μs）和稳定的同位素质量（142Nd）。AMF-DOTA-Nd 与基于脲的拟肽靶向基团 2-[3-(1,3- 二羧丙基)-脲基]戊二酸 (DUPA)-8-Aoc-Phe-Phe-Cys (DUPAaFFC) 共价连接（DUPAaFFC-AMF-DOTA-Nd）、本研究将前列腺特异性膜抗原（PSMA）及其剪接变体（total PSMA, tPSMA）作为靶向生物标记物，利用近红外和电感耦合等离子体质谱法（ICPMS）对其进行检测和定量，检测限（LOD）（3σ）为 0.3 纳克/毫升。在对前列腺癌（PCa）、良性前列腺增生症（BPH）患者和健康志愿者的 80 份血液样本进行分析时，我们发现 320 和 600 纳克/毫升的 tPSMA 可作为区分良性前列腺增生症和 PCa 以及诊断 PCa 的临界值。此外，当标记细胞膜跨膜 mPSMA 时，使用 ICPMS 对 Gleason 评分为 6-9 的 PCa 血液样本中 PSMA 阳性的循环肿瘤细胞（CTC）进行了计数，CTC 数量从 134 个到 773 个不等。如果将其他特定的靶向基团改性为近红外钕标记，这种方法有望适用于液体活检中其他具有临床意义的生物大分子及其宿主 CTC。

  DOI：

  10.1021/acs.analchem.7b02016
• 作为产物：
  描述：

  5-aminofluorescein 、 氯乙酰氯 反应 1.0h， 生成 N-chloroacetamido-fluorescein
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a New NIR Fluorescent Nd Complex Labeling Agent

  摘要：

  荧光分析已广泛应用于生物、化学和分析研究领域。一种有用的荧光标记剂应具有近红外发射、较大的斯托克偏移和良好的标记能力，同时不干扰被标记化合物的药理特征。因此，我们计划开发一种由近红外荧光分子和马来酰亚胺共轭分子组成的 M-AMF-DOTA(Nd)衍生物，作为新型近红外荧光标记剂，以满足上述要求。M-AMF-DOTA(Nd)由 4-氨基荧光素合成，并通过赖氨酸侧链与阿维丁分子（阿维丁-AMF-DOTA(Nd)）连接，与 2-亚氨基硫杂环戊烷反应。对 M-AMF-DOTA(Nd) 和 Avidin-AMF-DOTA(Nd) 的荧光特性进行了比较评估。此外，还进行了阿维丁-AMF-DOTA(Nd)与 D-生物素的结合试验以及肿瘤细胞摄取研究，以评估共轭作用对蛋白质生物和理化特性的影响。M-AMF-DOTA(Nd)的总收率为22%。M-AMF-DOTA(Nd)具有典型的钕离子近红外荧光（488 nm激发波长为880 nm和900 nm）。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)很容易合成，而且也能从 Nd 离子发出典型的近红外荧光，荧光强度没有降低。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)与 D-生物素的结合亲和力与天真阿维丁相当。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)被肿瘤细胞吸收的方式与与异硫氰酸荧光素结合的阿维丁相同，异硫氰酸荧光素是一种已被广泛使用的荧光阿维丁。研究结果表明，M-AMF-DOTA(Nd)是一种可用于常规近红外荧光分析的标记剂。

  DOI：

  10.1007/s10895-009-0542-3

文献信息

• Inhibition of Mitosis by Glycopeptide Dendrimer Conjugates of Colchicine
  作者：David Lagnoux、Tamis Darbre、M. Lienhard Schmitz、Jean-Louis Reymond

  DOI：10.1002/chem.200401294

  日期：2005.6.20

  devices for colchicine. Colchicine was attached to the dendrimers at the cysteine thiol group through a disulfide or thioether linkage. The biological activities of the glycopeptide dendrimer conjugates were evaluated in HeLa tumor cells and non-transformed mouse embryonic fibroblasts (MEFs). The concentrations of glycopeptide dendrimer drug conjugates required to achieve inhibition of cell proliferation

  已经制备了糖肽树状聚合物，其表面上带有四个或八个相同的糖苷部分（β-葡萄糖，α-半乳糖，α-N-乙酰基半乳糖或乳糖），分支内的天然氨基酸（Ser，Thr，His，Asp ，Glu，Leu，Val，Phe），2,3-二氨基丙酸作为分支单元，并在核心保留一个半胱氨酸残基。这些树状聚合物已被用作秋水仙碱的药物递送装置。秋水仙碱通过二硫键或硫醚键连接到半胱氨酸硫醇基团的树枝状聚合物上。在HeLa肿瘤细胞和未转化的小鼠胚胎成纤维细胞（MEF）中评估了糖肽树状聚合物结合物的生物学活性。发现通过干扰微管蛋白系统达到抑制细胞增殖所需的糖肽树状聚合物结合物的浓度比秋水仙碱浓度要高（IC50> 1 microM）。另一方面，糖肽树状大分子缀合物抑制HeLa细胞的增殖比MEF的增殖有效20到100倍。相比之下，非糖基化树状大分子和秋水仙碱本身对HeLa细胞的选择性是10倍或更低。
• Vinyl Sulfone Bifunctional Tag Reagents for Single-Point Modification of Proteins
  作者：Julia Morales-Sanfrutos、Francisco Javier Lopez-Jaramillo、Fernando Hernandez-Mateo、Francisco Santoyo-Gonzalez

  DOI：10.1021/jo100324p

  日期：2010.6.18

  The introduction of multiple labels onto biomolecules is a challenge. We report herein the synthesis of vinyl sulfone derivatized bifunctional tag single-attachment-point reagents (BTSAP) bearing biotin and a fluorescent tag and their applications in proteins for the introduction of multiple labels by means of the Michael-type addition of the electrophilic vinyl sulfone group. These BTSAP reagents

  在生物分子上引入多种标记是一个挑战。我们在此报告乙烯基砜衍生的带有生物素和荧光标签的双功能标签单连接点试剂（BTSAP）的合成及其在蛋白质中的应用，以通过亲电乙烯基砜的迈克尔型加成引入多个标签团体。这些BTSAP试剂可通过两步化学策略轻松合成，该策略涉及炔烃乙烯砜衍生标签（AVST）的制备以及第二叠氮化物功能化标签的随后点击CuAAC附着。BTSAP试剂与低反应蛋白辣根过氧化物酶（HRP）的直接偶联将其转变为双重报告基团（即荧光和过氧化物酶活性），可以通过生物素-亲和素亲和力与任何识别系统偶联。可点击的自报告化合物，通过乙烯基砜基团偶联后，可同时在蛋白质中引入炔烃功能并进行标记。在基于CuAAC的顺序方法中实施这些可点击的AVST化合物也可以实现HRP的双重标记。与通过BTSAP试剂进行直接双功能标记相比，此方法在荧光标记，比活和生物素标签的功能性方面产生同等的结果。但是，对于生命科学而言
• Synthesis of a New NIR Fluorescent Nd Complex Labeling Agent
  作者：Kazuki Aita、Takashi Temma、Yoichi Shimizu、Yuji Kuge、Koh-ichi Seki、Hideo Saji

  DOI：10.1007/s10895-009-0542-3

  日期：2010.1

  Fluorescent analysis has been widely used in biological, chemical and analytical research. A useful fluorescent labeling agent should include NIR emission, a large Stoke’s shift, and good labeling ability without interfering with the pharmacological profile of the labeled compound. Thus, we planned to develop an M-AMF-DOTA(Nd) derivative composed of an NIR fluorescent moiety and a maleimide conjugating moiety as a new NIR fluorescent labeling agent which fulfills these requirements. M-AMF-DOTA(Nd) was synthesized from 4-amino-fluorescein and was conjugated with an avidin molecule (Avidin-AMF-DOTA(Nd)) through Lys-side chains by reaction with 2-iminothiolane. The fluorescent features of M-AMF-DOTA(Nd) and Avidin-AMF-DOTA(Nd) were comparatively evaluated. A binding assay of Avidin-AMF-DOTA(Nd) with D-biotin and a tumor cell-uptake study were performed to estimate the effects of conjugation on the biological and physicochemical features of the protein. M-AMF-DOTA(Nd) was obtained in 22% overall yield. M-AMF-DOTA(Nd) had a typical NIR fluorescence from the Nd ion (880 nm and 900 nm from 488 nm excitation). Avidin-AMF-DOTA(Nd) was easily synthesized and also had typical NIR fluorescence from the Nd ion without loss of fluorescent intensity. The binding affinity of Avidin-AMF-DOTA(Nd) to D-biotin was equivalent to naive avidin. Avidin-AMF-DOTA(Nd) was taken up by tumor cells in the same manner as avidin conjugated with fluorescein isothiocyanate, an established, widely used fluorescent avidin. Results from this study indicate that M-AMF-DOTA(Nd) is a potential labeling agent for routine NIR fluorescent analysis.

  荧光分析已广泛应用于生物、化学和分析研究领域。一种有用的荧光标记剂应具有近红外发射、较大的斯托克偏移和良好的标记能力，同时不干扰被标记化合物的药理特征。因此，我们计划开发一种由近红外荧光分子和马来酰亚胺共轭分子组成的 M-AMF-DOTA(Nd)衍生物，作为新型近红外荧光标记剂，以满足上述要求。M-AMF-DOTA(Nd)由 4-氨基荧光素合成，并通过赖氨酸侧链与阿维丁分子（阿维丁-AMF-DOTA(Nd)）连接，与 2-亚氨基硫杂环戊烷反应。对 M-AMF-DOTA(Nd) 和 Avidin-AMF-DOTA(Nd) 的荧光特性进行了比较评估。此外，还进行了阿维丁-AMF-DOTA(Nd)与 D-生物素的结合试验以及肿瘤细胞摄取研究，以评估共轭作用对蛋白质生物和理化特性的影响。M-AMF-DOTA(Nd)的总收率为22%。M-AMF-DOTA(Nd)具有典型的钕离子近红外荧光（488 nm激发波长为880 nm和900 nm）。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)很容易合成，而且也能从 Nd 离子发出典型的近红外荧光，荧光强度没有降低。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)与 D-生物素的结合亲和力与天真阿维丁相当。阿维丁-AMF-DOTA(Nd)被肿瘤细胞吸收的方式与与异硫氰酸荧光素结合的阿维丁相同，异硫氰酸荧光素是一种已被广泛使用的荧光阿维丁。研究结果表明，M-AMF-DOTA(Nd)是一种可用于常规近红外荧光分析的标记剂。
• Development of a Highly Selective Fluorescence Probe for Hydrogen Sulfide
  作者：Kiyoshi Sasakura、Kenjiro Hanaoka、Norihiro Shibuya、Yoshinori Mikami、Yuka Kimura、Toru Komatsu、Tasuku Ueno、Takuya Terai、Hideo Kimura、Tetsuo Nagano

  DOI：10.1021/ja207851s

  日期：2011.11.16

  Hydrogen sulfide (H(2)S) has recently been identified as a biological response modifier. Here, we report the design and synthesis of a novel fluorescence probe for H(2)S, HSip-1, utilizing azamacrocyclic copper(II) ion complex chemistry to control the fluorescence. HSip-1 showed high selectivity and high sensitivity for H(2)S, and its potential for biological applications was confirmed by employing

  硫化氢 (H(2)S) 最近已被确定为生物反应改性剂。在这里，我们报告了 H(2)S、HSip-1 的新型荧光探针的设计和合成，利用氮杂大环铜 (II) 离子复合化学来控制荧光。HSip-1 对 H(2)S 显示出高选择性和高灵敏度，通过将其用于活细胞中 H(2)S 的荧光成像，证实了其在生物应用中的潜力。
• DOUBLE-LABELLING AGENTS BASED ON VINYL SULPHONE
  申请人：Santoyo Gonzalez Francisco

  公开号：US20110065164A1

  公开（公告）日：2011-03-17

  The invention relates to labelling agents containing a compound with two labelled molecules and a vinyl sulphone group. The invention also relates to the compounds, the method for obtaining these and the uses thereof in the marking of biomolecules and, more specifically, proteins.