5-difluoromethylsulfonyl-3-methyl-2-methylthiobenzothiazolium methylsulfate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并噻唑类
• 英文名称: 5-difluoromethylsulfonyl-3-methyl-2-methylthiobenzothiazolium methylsulfate
• 英文别名: 5-(Difluoromethylsulfonyl)-3-methyl-2-methylsulfanyl-1,3-benzothiazol-3-ium;methyl sulfate；5-(difluoromethylsulfonyl)-3-methyl-2-methylsulfanyl-1,3-benzothiazol-3-ium;methyl sulfate
• 化学式: CH₃O₄S*C₁₀H₁₀F₂NO₂S₃
• 分子量: 421.488
• InChiKey: ZXNWYELQVQBKMM-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.54
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  175
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-difluoromethylsulfonyl-3-methyl-2-methylthiobenzothiazolium methylsulfate 、 、 ammonium acetate 在 吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成 trimethyl(3-{4-[5-(difluoromethanesulfonyl)-3-methylbenzothiazol-2-ylmethylene]-4H-pyrimidin-1-yl]propyl}ammonium acetate
  参考文献：
  名称：

  Amplicon melting analysis with saturation dyes

  摘要：

  提供了一种用于核酸分析的方法，其中将至少部分双链的目标核酸与具有至少50％饱和度的双链DNA结合染料混合以形成混合物。在一种实施例中，核酸在双链DNA结合染料存在下被扩增，而在另一种实施例中，通过测量加热混合物时从双链DNA结合染料发出的荧光来为目标核酸生成熔解曲线。还提供了用于核酸分析的染料以及制备染料的方法。

  公开号：

  US09290663B2

文献信息

• Thio-substituted methine dyes
  申请人：University of Utah Research Foundation

  公开号：EP2574678A1

  公开（公告）日：2013-04-03

  The invention provides double stranded nucleic acid binding dyes for use in nucleic acid analysis.

  本发明提供了用于核酸分析的双链核酸结合染料。
• Nucleic acid melting analysis with saturation dyes
  申请人：University of Utah Research Foundation

  公开号：EP2826867A1

  公开（公告）日：2015-01-21

  The invention provides a method for nucleic acid analysis comprising the steps of mixing a target nucleic acid with a saturating dsDNA binding dye and an unlabeled probe configured to hybridize to a portion of the target nucleic acid, to form a mixture, amplifying the target nucleic acid to generate an amplicon, allowing the unlabeled probe to hybridize to the amplicon to form a probe/amplicon duplex, generating a melting curve for the probe/amplicon duplex by measuring fluorescence from the dsDNA binding dye as the mixture is heated, and analyzing the shape of the melting curve. Also provided are kits for analyzing a target nucleic acid comprising: oligonucleotide primers configured for amplifying the target nucleic, a saturating dsDNA binding dye. a thermostable polymerase, and acid an unlabeled probe configured to hybridize at least partially to the target nucleic acid.

  本发明提供了一种核酸分析方法，包括以下步骤 将目标核酸与饱和 dsDNA 结合染料和配置为与目标核酸部分杂交的未标记探针混合，形成混合物、 扩增目标核酸以产生扩增子、 让未标记探针与扩增子杂交，形成探针/扩增子双链体、 通过测量混合物加热时 dsDNA 结合染料发出的荧光，生成探针/扩增子双链体的熔化曲线，以及 分析熔化曲线的形状。 还提供了用于分析目标核酸的试剂盒，包括 用于扩增目标核酸的寡核苷酸引物、 饱和 dsDNA 结合染料。 一种恒温聚合酶，以及 酸 一个未标记探针，配置为至少部分与目标核酸杂交。
• Nucleic and melting analysis with saturation dyes
  申请人：Wittwer T. Carl

  公开号：US20050233335A1

  公开（公告）日：2005-10-20

  Methods are provided for nucleic acid analysis wherein a target nucleic acid is mixed with a dsDNA binding dye to form a mixture. Optionally, an unlabeled probe is included in the mixture. A melting curve is generated for the target nucleic acid by measuring fluorescence from the dsDNA binding dye as the mixture is heated. Dyes for use in nucleic acid analysis and methods for making dyes are also provided.

  提供了用于核酸分析的方法，其中目标核酸与 dsDNA 结合染料混合形成混合物。可选地，混合物中还包括一个未标记的探针。通过测量混合物加热时 dsDNA 结合染料发出的荧光，生成目标核酸的熔化曲线。还提供了用于核酸分析的染料和制造染料的方法。
• AMPLICON MELTING ANALYSIS WITH SATURATION DYES
  申请人：University of Utah Research Foundation

  公开号：EP1558762A2

  公开（公告）日：2005-08-03
• EP1558762A4
  申请人：——

  公开号：EP1558762A4

  公开（公告）日：2008-06-25